209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0038 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0038  peptidase S45 penicillin amidase  100 
 
 
807 aa  1672    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4309  peptidase S45 penicillin amidase  40.22 
 
 
809 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1726  penicillin acylase  39.93 
 
 
837 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0887  putative penicillin amidase  39.81 
 
 
837 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1174  putative penicillin amidase  39.81 
 
 
837 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0371  putative penicillin amidase  39.93 
 
 
837 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4199  peptidase S45 penicillin amidase  40.22 
 
 
809 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0278  putative penicillin amidase  39.93 
 
 
837 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23695  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2152  putative penicillin amidase  39.81 
 
 
837 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1877  putative penicillin amidase  39.81 
 
 
823 aa  562  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3277  penicillin amidase  39.88 
 
 
782 aa  556  1e-157  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5635  penicillin amidase (peptidase S45)  37.72 
 
 
812 aa  532  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3478  peptidase S45 penicillin amidase  38.09 
 
 
847 aa  517  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21490  penicilin amidase  35.92 
 
 
841 aa  488  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0898  peptidase S45 penicillin amidase  37.78 
 
 
785 aa  451  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.177532 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4754  peptidase S45 penicillin amidase  36.96 
 
 
792 aa  433  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11589  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4245  peptidase S45 penicillin amidase  36.4 
 
 
784 aa  433  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423428  normal  0.359084 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  31.02 
 
 
817 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  32.49 
 
 
827 aa  363  6e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  32.09 
 
 
827 aa  359  9.999999999999999e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  30.32 
 
 
796 aa  352  2e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  30.52 
 
 
796 aa  352  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  30.32 
 
 
796 aa  352  2e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  30.29 
 
 
796 aa  351  3e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  30.88 
 
 
796 aa  351  4e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  30.4 
 
 
796 aa  349  1e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  30.4 
 
 
796 aa  349  1e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  33.16 
 
 
770 aa  348  3e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  30.4 
 
 
796 aa  347  4e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  30.23 
 
 
796 aa  345  1e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  31.05 
 
 
821 aa  344  4e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  31.98 
 
 
783 aa  338  2.9999999999999997e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  30.84 
 
 
796 aa  336  1e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  32.42 
 
 
779 aa  331  4e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0269  penicillin amidase  31.86 
 
 
789 aa  321  3e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.29223 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  30.7 
 
 
821 aa  320  6e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  30.33 
 
 
829 aa  317  5e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  30.18 
 
 
804 aa  311  2.9999999999999997e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6210  peptidase S45 penicillin amidase  31.66 
 
 
858 aa  309  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329512  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  29.9 
 
 
803 aa  307  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  29.76 
 
 
823 aa  304  5.000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  30.21 
 
 
769 aa  302  1e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  29.68 
 
 
854 aa  301  3e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  30.4 
 
 
787 aa  301  4e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  30.69 
 
 
810 aa  300  8e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  28.95 
 
 
819 aa  295  2e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  29.49 
 
 
855 aa  291  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  28.28 
 
 
819 aa  283  1e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  28.93 
 
 
843 aa  280  6e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0858  penicillin acylase  28.77 
 
 
780 aa  280  9e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.459366  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  28.32 
 
 
818 aa  279  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2814  peptidase S45 penicillin amidase  28.79 
 
 
870 aa  275  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.893736  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4805  peptidase S45 penicillin amidase  28.94 
 
 
844 aa  275  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3370  penicillin amidase  29.46 
 
 
822 aa  274  5.000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  28.64 
 
 
857 aa  271  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1644  penicillin amidase  29.74 
 
 
854 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  26.05 
 
 
811 aa  270  8e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2999  peptidase S45 penicillin amidase  30.56 
 
 
807 aa  267  8e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  28.2 
 
 
806 aa  264  4.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  29.48 
 
 
809 aa  263  8e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1594  peptidase S45 penicillin amidase  29.95 
 
 
836 aa  263  8.999999999999999e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  29.07 
 
 
864 aa  263  8.999999999999999e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  29.58 
 
 
792 aa  262  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0772  hypothetical protein  28.68 
 
 
810 aa  261  4e-68  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03980  hypothetical protein  28.76 
 
 
795 aa  261  4e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0396  hypothetical protein  29.09 
 
 
795 aa  261  4e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0788  penicillin amidase  27.6 
 
 
872 aa  261  5.0000000000000005e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  28.07 
 
 
808 aa  259  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  28.52 
 
 
813 aa  259  1e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  29.38 
 
 
795 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  28.46 
 
 
809 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  28.49 
 
 
809 aa  254  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  28.33 
 
 
818 aa  253  7e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  29.17 
 
 
795 aa  249  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2452  penicillin amidase  27.72 
 
 
889 aa  248  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288116  normal  0.271218 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1089  penicillin amidase family protein  27.54 
 
 
761 aa  244  6e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1553  penicillin amidase  28.75 
 
 
774 aa  239  1e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275425  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  28.62 
 
 
788 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4305  penicillin amidase  31.65 
 
 
641 aa  236  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104752  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19340  Peptidase S45, penicillin amidase family  28.62 
 
 
839 aa  235  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0835  peptidase S45 penicillin amidase  27.75 
 
 
856 aa  233  7.000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0497714  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5398  penicillin amidase  28.5 
 
 
803 aa  230  6e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111495  hitchhiker  0.00200209 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4404  peptidase S45, penicillin amidase  26.24 
 
 
903 aa  227  5.0000000000000005e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.676732  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4349  putative penicillin amidase  27.16 
 
 
847 aa  226  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5071  peptidase S45, penicillin amidase  27.39 
 
 
788 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1414  penicillin amidase  26.88 
 
 
837 aa  224  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.290325  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0301  peptidase S45 penicillin amidase  27.61 
 
 
787 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.916585  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50980  putative penicillin amidase  26.65 
 
 
847 aa  224  6e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.646025  hitchhiker  0.000000127919 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1565  acylase precursor  26.65 
 
 
827 aa  224  6e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0134254  normal  0.042074 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5217  peptidase S45 penicillin amidase  28.25 
 
 
787 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2327  penicillin amidase  25.42 
 
 
826 aa  218  4e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00682213  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1397  penicillin amidase  26.9 
 
 
762 aa  214  5.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2798  penicillin amidase  26.47 
 
 
848 aa  214  7e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000130023  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3025  penicillin acylase II  26.62 
 
 
786 aa  213  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1448  penicillin amidase  25.6 
 
 
823 aa  211  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2845  putative penicillin acylase (penicillin amidase)  25.6 
 
 
823 aa  211  6e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30580  penicilin amidase  30.54 
 
 
898 aa  209  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0787437  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1495  penicillin amidase  25.51 
 
 
821 aa  209  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.505124  normal  0.225613 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3142  penicillin amidase  28.59 
 
 
812 aa  209  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1213  peptidase S45, penicillin amidase  26.54 
 
 
816 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.951411 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>