212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1547 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  60.97 
 
 		 788 aa  967    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  61.7 
 
 		 795 aa  1026    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  62.23 
 
 		 795 aa  1023    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5217  peptidase S45 penicillin amidase  60.58 
 
 		 787 aa  973    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5398  penicillin amidase  62.28 
 
 		 803 aa  1020    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111495  hitchhiker  0.00200209 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  100 
 
 		 809 aa  1640    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03980  hypothetical protein  65.6 
 
 		 795 aa  1053    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0396  hypothetical protein  66.24 
 
 		 795 aa  1067    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0301  peptidase S45 penicillin amidase  61.67 
 
 		 787 aa  982    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.916585  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  65.88 
 
 		 792 aa  1063    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5071  peptidase S45, penicillin amidase  60.15 
 
 		 788 aa  972    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0502  peptidase S45, penicillin amidase  37.18 
 
 		 795 aa  543  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.269122  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  32.47 
 
 		 843 aa  349  9e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  33.21 
 
 		 821 aa  343  5.999999999999999e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  31.11 
 
 		 817 aa  340  4e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  30.84 
 
 		 796 aa  339  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  30.49 
 
 		 796 aa  338  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  30.83 
 
 		 796 aa  338  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  30.49 
 
 		 796 aa  338  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  30.82 
 
 		 796 aa  337  5e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  30.5 
 
 		 796 aa  336  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  30.71 
 
 		 796 aa  335  2e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  30.59 
 
 		 796 aa  334  4e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  30.65 
 
 		 796 aa  333  6e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  30.5 
 
 		 796 aa  332  1e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  31.99 
 
 		 827 aa  324  4e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  31.74 
 
 		 827 aa  320  5e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  29.52 
 
 		 855 aa  316  9e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  31.41 
 
 		 829 aa  311  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0269  penicillin amidase  33.54 
 
 		 789 aa  310  6.999999999999999e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.29223 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  30.14 
 
 		 821 aa  305  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  31.38 
 
 		 804 aa  303  1e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  30.13 
 
 		 819 aa  300  8e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  30.96 
 
 		 783 aa  294  4e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  31.04 
 
 		 854 aa  293  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  29.78 
 
 		 819 aa  291  3e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  31.76 
 
 		 810 aa  291  3e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  31.72 
 
 		 813 aa  291  3e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  31.23 
 
 		 803 aa  290  6e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  31.83 
 
 		 769 aa  290  9e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  31.13 
 
 		 787 aa  287  5.999999999999999e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  31.59 
 
 		 770 aa  283  9e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  30.43 
 
 		 779 aa  283  1e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2798  penicillin amidase  30.15 
 
 		 848 aa  278  3e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000130023  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1594  peptidase S45 penicillin amidase  30.58 
 
 		 836 aa  276  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  29.16 
 
 		 818 aa  275  3e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1644  penicillin amidase  30.66 
 
 		 854 aa  273  1e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  29.04 
 
 		 857 aa  272  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4805  peptidase S45 penicillin amidase  30.64 
 
 		 844 aa  271  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4404  peptidase S45, penicillin amidase  27.34 
 
 		 903 aa  271  4e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.676732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6210  peptidase S45 penicillin amidase  29.96 
 
 		 858 aa  270  5.9999999999999995e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  31.06 
 
 		 818 aa  270  5.9999999999999995e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2814  peptidase S45 penicillin amidase  29.16 
 
 		 870 aa  270  5.9999999999999995e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.893736  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1414  penicillin amidase  28.81 
 
 		 837 aa  267  7e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.290325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50980  putative penicillin amidase  27.8 
 
 		 847 aa  265  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.646025  hitchhiker  0.000000127919 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4884  peptidase S45 penicillin amidase  27.85 
 
 		 906 aa  264  6e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0038  peptidase S45 penicillin amidase  29.48 
 
 		 807 aa  263  8e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4349  putative penicillin amidase  27.68 
 
 		 847 aa  263  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19340  Peptidase S45, penicillin amidase family  28.93 
 
 		 839 aa  261  3e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  27.68 
 
 		 811 aa  258  3e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1553  penicillin amidase  29.3 
 
 		 774 aa  256  1.0000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  29.15 
 
 		 808 aa  255  3e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2452  penicillin amidase  29.33 
 
 		 889 aa  250  8e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288116  normal  0.271218 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1448  penicillin amidase  27.43 
 
 		 823 aa  249  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2327  penicillin amidase  27.94 
 
 		 826 aa  248  3e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00682213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0788  penicillin amidase  29.95 
 
 		 872 aa  248  3e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2845  putative penicillin acylase (penicillin amidase)  27.43 
 
 		 823 aa  248  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5635  penicillin amidase (peptidase S45)  28.71 
 
 		 812 aa  246  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4133  penicillin amidase family protein  28.84 
 
 		 824 aa  245  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.699184  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  28.83 
 
 		 809 aa  243  9e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3370  penicillin amidase  29.13 
 
 		 822 aa  242  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0835  peptidase S45 penicillin amidase  29.13 
 
 		 856 aa  238  3e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0497714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1495  penicillin amidase  26.9 
 
 		 821 aa  238  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.505124  normal  0.225613 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0858  penicillin acylase  27.26 
 
 		 780 aa  237  7e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.459366  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  28.84 
 
 		 809 aa  237  8e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1354  penicillin amidase  27.52 
 
 		 829 aa  236  9e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3871  penicillin amidase  28.05 
 
 		 824 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3277  penicillin amidase  27.7 
 
 		 782 aa  233  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  27.87 
 
 		 823 aa  232  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  28.28 
 
 		 864 aa  231  4e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4309  peptidase S45 penicillin amidase  29.19 
 
 		 809 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4199  peptidase S45 penicillin amidase  29.19 
 
 		 809 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1565  acylase precursor  28.8 
 
 		 827 aa  228  5.0000000000000005e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0134254  normal  0.042074 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1213  peptidase S45, penicillin amidase  27.64 
 
 		 816 aa  227  6e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.951411 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  28.31 
 
 		 806 aa  224  4e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2999  peptidase S45 penicillin amidase  27.88 
 
 		 807 aa  223  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3478  peptidase S45 penicillin amidase  27.22 
 
 		 847 aa  218  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3360  peptidase S45 penicillin amidase  26.92 
 
 		 833 aa  211  3e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545108  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  29.2 
 
 		 821 aa  211  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1137  penicillin amidase  27.01 
 
 		 813 aa  204  5e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.416343  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1108  acylase  27.76 
 
 		 813 aa  203  8e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.77464  normal  0.714706 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1147  penicillin amidase  27.69 
 
 		 813 aa  203  9e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0772  hypothetical protein  26.36 
 
 		 810 aa  203  9.999999999999999e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4002  penicillin amidase  28.72 
 
 		 818 aa  201  5e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4305  penicillin amidase  27.1 
 
 		 813 aa  201  6e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30580  penicilin amidase  29.93 
 
 		 898 aa  197  6e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0787437  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3025  penicillin acylase II  27.32 
 
 		 786 aa  196  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3459  peptidase S45 penicillin amidase  27.07 
 
 		 885 aa  190  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0402135  hitchhiker  0.000204801 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4305  penicillin amidase  29.83 
 
 		 641 aa  189  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104752  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0950  peptidase S45 penicillin amidase  25.93 
 
 		 759 aa  187  9e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.841423  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>