213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0301 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  89.69 
 
 		 788 aa  1427    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0396  hypothetical protein  69.3 
 
 		 795 aa  1071    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  65.41 
 
 		 795 aa  1076    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  65.7 
 
 		 795 aa  1081    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5398  penicillin amidase  66.62 
 
 		 803 aa  1078    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111495  hitchhiker  0.00200209 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  60.88 
 
 		 809 aa  992    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03980  hypothetical protein  69.56 
 
 		 795 aa  1064    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0301  peptidase S45 penicillin amidase  100 
 
 		 787 aa  1601    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.916585  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  67 
 
 		 792 aa  1077    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5217  peptidase S45 penicillin amidase  88.44 
 
 		 787 aa  1422    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5071  peptidase S45, penicillin amidase  89.69 
 
 		 788 aa  1452    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0502  peptidase S45, penicillin amidase  36.69 
 
 		 795 aa  540  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.269122  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  31.15 
 
 		 817 aa  330  7e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  31.55 
 
 		 821 aa  322  9.999999999999999e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  28.86 
 
 		 796 aa  318  3e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  28.86 
 
 		 796 aa  318  3e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  29.02 
 
 		 796 aa  318  3e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  28.7 
 
 		 796 aa  317  7e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  28.77 
 
 		 796 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  28.73 
 
 		 796 aa  315  2.9999999999999996e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  28.57 
 
 		 796 aa  314  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  28.9 
 
 		 796 aa  313  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  28.48 
 
 		 796 aa  313  1e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  28.44 
 
 		 796 aa  310  6.999999999999999e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  31.4 
 
 		 827 aa  307  4.0000000000000004e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0269  penicillin amidase  33.21 
 
 		 789 aa  305  3.0000000000000004e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.29223 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  30.05 
 
 		 827 aa  300  5e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  29.77 
 
 		 829 aa  298  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  30.41 
 
 		 843 aa  297  4e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  30.96 
 
 		 821 aa  297  6e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  31.65 
 
 		 769 aa  295  3e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  30.63 
 
 		 783 aa  291  3e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  29.63 
 
 		 803 aa  281  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  29.18 
 
 		 855 aa  275  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  29.39 
 
 		 810 aa  273  1e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  29.96 
 
 		 854 aa  272  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  30.48 
 
 		 779 aa  272  2e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  29.84 
 
 		 770 aa  270  8.999999999999999e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  27.39 
 
 		 804 aa  268  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4805  peptidase S45 penicillin amidase  28.45 
 
 		 844 aa  267  5e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  30.41 
 
 		 787 aa  265  2e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  28.06 
 
 		 819 aa  261  5.0000000000000005e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2327  penicillin amidase  29 
 
 		 826 aa  259  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00682213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  29.34 
 
 		 809 aa  257  7e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2798  penicillin amidase  27.26 
 
 		 848 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000130023  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2814  peptidase S45 penicillin amidase  28.8 
 
 		 870 aa  253  1e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.893736  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1594  peptidase S45 penicillin amidase  29.38 
 
 		 836 aa  253  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1553  penicillin amidase  30.09 
 
 		 774 aa  252  2e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  29.28 
 
 		 809 aa  251  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  29.16 
 
 		 818 aa  251  4e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  26.79 
 
 		 819 aa  245  1.9999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4404  peptidase S45, penicillin amidase  27.34 
 
 		 903 aa  244  3e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.676732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1644  penicillin amidase  29.99 
 
 		 854 aa  244  5e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0858  penicillin acylase  26.26 
 
 		 780 aa  243  1e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.459366  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  27.57 
 
 		 823 aa  241  5e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  29.12 
 
 		 813 aa  240  8e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1448  penicillin amidase  27.25 
 
 		 823 aa  238  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6210  peptidase S45 penicillin amidase  28.31 
 
 		 858 aa  238  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2845  putative penicillin acylase (penicillin amidase)  27.25 
 
 		 823 aa  237  8e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  26.93 
 
 		 818 aa  237  8e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1213  peptidase S45, penicillin amidase  28.11 
 
 		 816 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.951411 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  26.59 
 
 		 811 aa  234  5e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50980  putative penicillin amidase  26.35 
 
 		 847 aa  234  6e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.646025  hitchhiker  0.000000127919 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  27.49 
 
 		 857 aa  229  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1565  acylase precursor  27.75 
 
 		 827 aa  229  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0134254  normal  0.042074 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3370  penicillin amidase  28.05 
 
 		 822 aa  229  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  26.25 
 
 		 808 aa  226  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1495  penicillin amidase  26.11 
 
 		 821 aa  226  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.505124  normal  0.225613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0038  peptidase S45 penicillin amidase  27.35 
 
 		 807 aa  225  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19340  Peptidase S45, penicillin amidase family  27.62 
 
 		 839 aa  224  4e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5635  penicillin amidase (peptidase S45)  28.34 
 
 		 812 aa  224  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1414  penicillin amidase  27.03 
 
 		 837 aa  223  9e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.290325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4349  putative penicillin amidase  26.28 
 
 		 847 aa  221  6e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1354  penicillin amidase  27.43 
 
 		 829 aa  218  5e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342409  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4133  penicillin amidase family protein  27.38 
 
 		 824 aa  214  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.699184  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0371  putative penicillin amidase  27.92 
 
 		 837 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  26.41 
 
 		 806 aa  213  7.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1726  penicillin acylase  27.78 
 
 		 837 aa  212  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0278  putative penicillin amidase  27.78 
 
 		 837 aa  212  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23695  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1877  putative penicillin amidase  27.8 
 
 		 823 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0887  putative penicillin amidase  27.8 
 
 		 837 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1174  putative penicillin amidase  27.8 
 
 		 837 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2152  putative penicillin amidase  27.8 
 
 		 837 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3025  penicillin acylase II  28.57 
 
 		 786 aa  209  1e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3871  penicillin amidase  26.83 
 
 		 824 aa  209  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2999  peptidase S45 penicillin amidase  26.24 
 
 		 807 aa  209  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3478  peptidase S45 penicillin amidase  27.8 
 
 		 847 aa  208  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0788  penicillin amidase  27.97 
 
 		 872 aa  206  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  27.09 
 
 		 821 aa  205  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0835  peptidase S45 penicillin amidase  27.52 
 
 		 856 aa  203  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0497714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4199  peptidase S45 penicillin amidase  27.44 
 
 		 809 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2452  penicillin amidase  27.06 
 
 		 889 aa  202  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288116  normal  0.271218 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4309  peptidase S45 penicillin amidase  27.44 
 
 		 809 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3277  penicillin amidase  26.7 
 
 		 782 aa  201  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  27 
 
 		 864 aa  199  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0831  penicillin amidase  34.49 
 
 		 829 aa  194  5e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0438978 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0961  penicillin amidase  25.27 
 
 		 804 aa  192  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1397  penicillin amidase  26.93 
 
 		 762 aa  183  9.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4305  penicillin amidase  26.47 
 
 		 813 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0898  peptidase S45 penicillin amidase  26.04 
 
 		 785 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177532 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>