189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0831 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0831  penicillin amidase  100 
 
 
829 aa  1654    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0438978 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1223  penicillin amidase family protein  39.81 
 
 
810 aa  625  1e-178  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0961  penicillin amidase  42.55 
 
 
804 aa  597  1e-169  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1282  peptidase S45 penicillin amidase  41.31 
 
 
775 aa  554  1e-156  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.224327  normal  0.39054 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0953  peptidase  42.43 
 
 
886 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0780  peptidase  42.3 
 
 
796 aa  549  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0792  putative penicillin amidase  42.55 
 
 
796 aa  548  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4181  penicillin amidase  41.85 
 
 
831 aa  549  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0631  penicillin amidase, putative  42.38 
 
 
797 aa  545  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2008  putative penicillin amidase  42.01 
 
 
790 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.276522  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1038  penicillin amidase, putative  41.91 
 
 
783 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.383648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2163  peptidase  42.01 
 
 
815 aa  528  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.703029  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1484  putative penicillin amidase  41.91 
 
 
790 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251017  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0153  putative penicillin amidase  41.91 
 
 
790 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.877859  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2028  putative penicillin amidase  41.91 
 
 
790 aa  528  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1011  putative penicillin amidase  41.91 
 
 
790 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01150  penicillin acylase II  40.09 
 
 
805 aa  526  1e-148  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3220  penicillin amidase  36.43 
 
 
768 aa  477  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2669  penicillin amidase  36.86 
 
 
782 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3540  penicillin amidase  35.91 
 
 
768 aa  458  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3361  peptidase S45 penicillin amidase  34.47 
 
 
769 aa  449  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.272902 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2914  penicillin amidase  35.49 
 
 
770 aa  445  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1765  peptidase S45 penicillin amidase  35.33 
 
 
777 aa  424  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3025  penicillin acylase II  35.09 
 
 
786 aa  412  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02441  putative hydrolase  34.1 
 
 
776 aa  401  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.135854  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3735  penicillin amidase  33.21 
 
 
758 aa  395  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3370  penicillin amidase  29.29 
 
 
822 aa  280  7e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  28.83 
 
 
783 aa  258  3e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  28.37 
 
 
804 aa  254  5.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  31.72 
 
 
803 aa  249  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  28.36 
 
 
779 aa  241  4e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  28.71 
 
 
769 aa  238  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  28.74 
 
 
821 aa  235  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  30.44 
 
 
770 aa  231  4e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  26.88 
 
 
817 aa  227  6e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  28.9 
 
 
827 aa  227  6e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  32.3 
 
 
843 aa  226  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  28.14 
 
 
827 aa  225  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  29.27 
 
 
829 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  25.24 
 
 
796 aa  221  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  27.21 
 
 
821 aa  221  5e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  24.53 
 
 
796 aa  219  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0269  penicillin amidase  28.85 
 
 
789 aa  218  4e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.29223 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  26.42 
 
 
818 aa  218  4e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  23.7 
 
 
796 aa  217  7e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  24.2 
 
 
796 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  24.29 
 
 
796 aa  215  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  24.41 
 
 
796 aa  215  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  24.29 
 
 
796 aa  215  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  24.33 
 
 
796 aa  214  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  24.41 
 
 
796 aa  213  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  24.44 
 
 
796 aa  213  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5071  peptidase S45, penicillin amidase  34.39 
 
 
788 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  24.46 
 
 
823 aa  209  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  28.35 
 
 
787 aa  210  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6210  peptidase S45 penicillin amidase  28.38 
 
 
858 aa  207  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329512  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0772  hypothetical protein  24.63 
 
 
810 aa  206  1e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50980  putative penicillin amidase  26.88 
 
 
847 aa  206  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.646025  hitchhiker  0.000000127919 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1448  penicillin amidase  29.52 
 
 
823 aa  206  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  27.16 
 
 
810 aa  206  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2845  putative penicillin acylase (penicillin amidase)  28.95 
 
 
823 aa  206  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  28.35 
 
 
855 aa  206  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2999  peptidase S45 penicillin amidase  26.58 
 
 
807 aa  205  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  29.91 
 
 
854 aa  204  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0038  peptidase S45 penicillin amidase  26.09 
 
 
807 aa  205  4e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  34.06 
 
 
788 aa  204  7e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4349  putative penicillin amidase  26.94 
 
 
847 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2327  penicillin amidase  26.19 
 
 
826 aa  200  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00682213  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0301  peptidase S45 penicillin amidase  34.49 
 
 
787 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.916585  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0858  penicillin acylase  26.38 
 
 
780 aa  198  3e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.459366  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  26.84 
 
 
818 aa  196  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21490  penicilin amidase  27.61 
 
 
841 aa  193  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  29.09 
 
 
813 aa  192  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2814  peptidase S45 penicillin amidase  26.98 
 
 
870 aa  192  2.9999999999999997e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.893736  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1565  acylase precursor  31.54 
 
 
827 aa  191  5e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0134254  normal  0.042074 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5217  peptidase S45 penicillin amidase  32.97 
 
 
787 aa  191  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  28.13 
 
 
821 aa  189  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4805  peptidase S45 penicillin amidase  26.44 
 
 
844 aa  188  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5635  penicillin amidase (peptidase S45)  27.6 
 
 
812 aa  188  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0788  penicillin amidase  30.45 
 
 
872 aa  188  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3360  peptidase S45 penicillin amidase  25.9 
 
 
833 aa  185  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545108  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  24.24 
 
 
808 aa  186  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1495  penicillin amidase  25.67 
 
 
821 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.505124  normal  0.225613 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  27.82 
 
 
792 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4913  peptidase S45 penicillin amidase  29.51 
 
 
740 aa  184  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0991334  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  27.27 
 
 
809 aa  182  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2798  penicillin amidase  25.35 
 
 
848 aa  181  4e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000130023  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  24.76 
 
 
819 aa  181  4.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4404  peptidase S45, penicillin amidase  27.42 
 
 
903 aa  180  8e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.676732  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0835  peptidase S45 penicillin amidase  28.03 
 
 
856 aa  180  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0497714  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  24.03 
 
 
811 aa  179  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  24 
 
 
819 aa  177  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19340  Peptidase S45, penicillin amidase family  27.61 
 
 
839 aa  176  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1354  penicillin amidase  26.16 
 
 
829 aa  174  5.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342409  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5398  penicillin amidase  26.1 
 
 
803 aa  174  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111495  hitchhiker  0.00200209 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1726  penicillin acylase  26.73 
 
 
837 aa  173  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0371  putative penicillin amidase  26.73 
 
 
837 aa  173  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1877  putative penicillin amidase  26.81 
 
 
823 aa  172  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0278  putative penicillin amidase  26.73 
 
 
837 aa  172  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23695  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0887  putative penicillin amidase  26.61 
 
 
837 aa  171  5e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>