215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1908 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  48.6 
 
 		 829 aa  723    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  48.9 
 
 		 821 aa  736    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  100 
 
 		 818 aa  1634    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  60.12 
 
 		 813 aa  936    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2452  penicillin amidase  43.54 
 
 		 889 aa  625  1e-177  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288116  normal  0.271218 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  41.81 
 
 		 819 aa  624  1e-177  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  40.15 
 
 		 819 aa  604  1.0000000000000001e-171  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4805  peptidase S45 penicillin amidase  43.06 
 
 		 844 aa  602  1e-170  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1594  peptidase S45 penicillin amidase  43.6 
 
 		 836 aa  593  1e-168  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  41.9 
 
 		 803 aa  548  1e-154  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  39.54 
 
 		 804 aa  540  9.999999999999999e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  38.31 
 
 		 821 aa  521  1e-146  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4305  penicillin amidase  44.76 
 
 		 641 aa  504  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104752  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  40.13 
 
 		 809 aa  498  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  39.87 
 
 		 809 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0269  penicillin amidase  38.34 
 
 		 789 aa  461  9.999999999999999e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.29223 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  36.88 
 
 		 810 aa  459  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  37.15 
 
 		 783 aa  458  1e-127  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  37.9 
 
 		 779 aa  453  1.0000000000000001e-126  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  33.93 
 
 		 796 aa  450  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  33.93 
 
 		 796 aa  450  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  33.42 
 
 		 796 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  33.76 
 
 		 796 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  33.76 
 
 		 796 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1553  penicillin amidase  37.04 
 
 		 774 aa  446  1.0000000000000001e-124  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  33.42 
 
 		 796 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  32.95 
 
 		 796 aa  444  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  33.29 
 
 		 796 aa  443  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  32.95 
 
 		 796 aa  442  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  33.08 
 
 		 796 aa  437  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  36.81 
 
 		 769 aa  435  1e-120  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  36.78 
 
 		 827 aa  430  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  36.68 
 
 		 827 aa  431  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  36.65 
 
 		 817 aa  420  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  37.63 
 
 		 821 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  37.63 
 
 		 787 aa  413  1e-114  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1565  acylase precursor  35.86 
 
 		 827 aa  413  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0134254  normal  0.042074 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1448  penicillin amidase  34.06 
 
 		 823 aa  415  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2845  putative penicillin acylase (penicillin amidase)  33.81 
 
 		 823 aa  412  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  36.59 
 
 		 770 aa  412  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1495  penicillin amidase  35.08 
 
 		 821 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.505124  normal  0.225613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  36.33 
 
 		 843 aa  403  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1644  penicillin amidase  36.31 
 
 		 854 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2327  penicillin amidase  33.61 
 
 		 826 aa  396  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00682213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  31.7 
 
 		 823 aa  397  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  34.97 
 
 		 857 aa  394  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1354  penicillin amidase  34.29 
 
 		 829 aa  393  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4404  peptidase S45, penicillin amidase  34.31 
 
 		 903 aa  394  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.676732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  34.73 
 
 		 854 aa  383  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  34.35 
 
 		 855 aa  386  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  32.33 
 
 		 806 aa  381  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19340  Peptidase S45, penicillin amidase family  33.77 
 
 		 839 aa  372  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4884  peptidase S45 penicillin amidase  33.33 
 
 		 906 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0788  penicillin amidase  34.76 
 
 		 872 aa  366  1e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50980  putative penicillin amidase  32.13 
 
 		 847 aa  364  3e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.646025  hitchhiker  0.000000127919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4349  putative penicillin amidase  32 
 
 		 847 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2814  peptidase S45 penicillin amidase  33.81 
 
 		 870 aa  361  3e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.893736  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1414  penicillin amidase  33.17 
 
 		 837 aa  359  9e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.290325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6210  peptidase S45 penicillin amidase  32.06 
 
 		 858 aa  356  1e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  33.57 
 
 		 864 aa  352  2e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0835  peptidase S45 penicillin amidase  34.33 
 
 		 856 aa  350  5e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0497714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0858  penicillin acylase  28.85 
 
 		 780 aa  345  2e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.459366  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1213  peptidase S45, penicillin amidase  31.54 
 
 		 816 aa  342  2e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.951411 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4002  penicillin amidase  34.24 
 
 		 818 aa  338  1.9999999999999998e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3871  penicillin amidase  30.93 
 
 		 824 aa  334  4e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2798  penicillin amidase  30.33 
 
 		 848 aa  327  6e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000130023  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4133  penicillin amidase family protein  30.16 
 
 		 824 aa  326  9e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.699184  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3370  penicillin amidase  34.39 
 
 		 822 aa  320  6e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  28.26 
 
 		 811 aa  300  9e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  28.5 
 
 		 818 aa  293  9e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1108  acylase  31 
 
 		 813 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.77464  normal  0.714706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  30.41 
 
 		 808 aa  288  2.9999999999999996e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1147  penicillin amidase  30.76 
 
 		 813 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4245  peptidase S45 penicillin amidase  32.08 
 
 		 784 aa  287  5e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423428  normal  0.359084 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4305  penicillin amidase  30.47 
 
 		 813 aa  286  8e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  32.12 
 
 		 792 aa  286  8e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0396  hypothetical protein  30.56 
 
 		 795 aa  282  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  31.35 
 
 		 809 aa  281  4e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0502  peptidase S45, penicillin amidase  27.16 
 
 		 795 aa  281  5e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.269122  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2999  peptidase S45 penicillin amidase  30.3 
 
 		 807 aa  280  6e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3025  penicillin acylase II  32.09 
 
 		 786 aa  280  1e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5398  penicillin amidase  30.19 
 
 		 803 aa  278  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111495  hitchhiker  0.00200209 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1137  penicillin amidase  29.45 
 
 		 813 aa  277  7e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.416343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0371  putative penicillin amidase  30.1 
 
 		 837 aa  273  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1726  penicillin acylase  30.31 
 
 		 837 aa  272  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5635  penicillin amidase (peptidase S45)  29.89 
 
 		 812 aa  272  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0887  putative penicillin amidase  29.97 
 
 		 837 aa  272  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1174  putative penicillin amidase  29.97 
 
 		 837 aa  272  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2152  putative penicillin amidase  29.97 
 
 		 837 aa  272  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1877  putative penicillin amidase  29.97 
 
 		 823 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03980  hypothetical protein  30.68 
 
 		 795 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0278  putative penicillin amidase  30.19 
 
 		 837 aa  271  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23695  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5217  peptidase S45 penicillin amidase  30.24 
 
 		 787 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  29.67 
 
 		 788 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  28.97 
 
 		 795 aa  269  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3277  penicillin amidase  29.99 
 
 		 782 aa  269  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5071  peptidase S45, penicillin amidase  29.31 
 
 		 788 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0038  peptidase S45 penicillin amidase  28.07 
 
 		 807 aa  265  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  28.97 
 
 		 795 aa  264  4e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0898  peptidase S45 penicillin amidase  30.75 
 
 		 785 aa  263  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177532 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>