212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2001 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  58.09 
 
 		 783 aa  902    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  100 
 
 		 770 aa  1512    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  58.52 
 
 		 779 aa  893    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0269  penicillin amidase  44.73 
 
 		 789 aa  566  1e-160  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.29223 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  42.38 
 
 		 821 aa  566  1e-160  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  44.67 
 
 		 803 aa  563  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  42.45 
 
 		 804 aa  562  1e-158  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  41.24 
 
 		 810 aa  525  1e-147  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  41.93 
 
 		 829 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  40.73 
 
 		 821 aa  511  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  41.01 
 
 		 769 aa  507  9.999999999999999e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  42.06 
 
 		 787 aa  509  9.999999999999999e-143  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0858  penicillin acylase  34.65 
 
 		 780 aa  482  1e-134  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.459366  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  42.11 
 
 		 827 aa  469  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  34.77 
 
 		 796 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  34.43 
 
 		 796 aa  456  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  34.56 
 
 		 796 aa  457  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  34.43 
 
 		 796 aa  456  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  34.56 
 
 		 796 aa  457  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  34.55 
 
 		 796 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  34.38 
 
 		 796 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  34.55 
 
 		 796 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  34.18 
 
 		 796 aa  452  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  34.68 
 
 		 796 aa  449  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  39.41 
 
 		 827 aa  450  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  38.33 
 
 		 817 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  38.6 
 
 		 809 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  38.6 
 
 		 809 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  34.88 
 
 		 806 aa  423  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  33.16 
 
 		 823 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1553  penicillin amidase  37.31 
 
 		 774 aa  419  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1644  penicillin amidase  36.62 
 
 		 854 aa  413  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  34.31 
 
 		 819 aa  414  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  34.07 
 
 		 819 aa  409  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4805  peptidase S45 penicillin amidase  36.01 
 
 		 844 aa  407  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  37.41 
 
 		 813 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  36.42 
 
 		 818 aa  405  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  36.08 
 
 		 854 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  36.44 
 
 		 857 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  37.17 
 
 		 843 aa  398  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6210  peptidase S45 penicillin amidase  35.97 
 
 		 858 aa  394  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2452  penicillin amidase  35.15 
 
 		 889 aa  391  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288116  normal  0.271218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  35.63 
 
 		 855 aa  392  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  37.6 
 
 		 821 aa  385  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1594  peptidase S45 penicillin amidase  35.88 
 
 		 836 aa  382  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0371  putative penicillin amidase  35.87 
 
 		 837 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1877  putative penicillin amidase  35.62 
 
 		 823 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1726  penicillin acylase  35.62 
 
 		 837 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0887  putative penicillin amidase  35.62 
 
 		 837 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1174  putative penicillin amidase  35.62 
 
 		 837 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0278  putative penicillin amidase  35.62 
 
 		 837 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23695  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2152  putative penicillin amidase  35.62 
 
 		 837 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2814  peptidase S45 penicillin amidase  35.22 
 
 		 870 aa  369  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.893736  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4404  peptidase S45, penicillin amidase  33.1 
 
 		 903 aa  363  6e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.676732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0788  penicillin amidase  36.44 
 
 		 872 aa  362  1e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3370  penicillin amidase  34.33 
 
 		 822 aa  360  6e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1448  penicillin amidase  34.08 
 
 		 823 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2845  putative penicillin acylase (penicillin amidase)  34.08 
 
 		 823 aa  352  1e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  29.8 
 
 		 811 aa  352  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2999  peptidase S45 penicillin amidase  31.41 
 
 		 807 aa  348  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  34.4 
 
 		 864 aa  347  3e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  32.55 
 
 		 818 aa  348  3e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0038  peptidase S45 penicillin amidase  33.16 
 
 		 807 aa  348  3e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0835  peptidase S45 penicillin amidase  35.96 
 
 		 856 aa  347  5e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0497714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2327  penicillin amidase  34.04 
 
 		 826 aa  342  2e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00682213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4884  peptidase S45 penicillin amidase  36.77 
 
 		 906 aa  340  5.9999999999999996e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1565  acylase precursor  33.75 
 
 		 827 aa  340  7e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0134254  normal  0.042074 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1495  penicillin amidase  33.38 
 
 		 821 aa  331  3e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.505124  normal  0.225613 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5635  penicillin amidase (peptidase S45)  32.2 
 
 		 812 aa  330  8e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3277  penicillin amidase  32.43 
 
 		 782 aa  328  2.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0772  hypothetical protein  29.1 
 
 		 810 aa  326  1e-87  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4199  peptidase S45 penicillin amidase  30.68 
 
 		 809 aa  323  5e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4309  peptidase S45 penicillin amidase  30.68 
 
 		 809 aa  323  5e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  31.08 
 
 		 808 aa  315  9.999999999999999e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50980  putative penicillin amidase  31.12 
 
 		 847 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.646025  hitchhiker  0.000000127919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4349  putative penicillin amidase  31.71 
 
 		 847 aa  314  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3478  peptidase S45 penicillin amidase  32.04 
 
 		 847 aa  307  5.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1354  penicillin amidase  31.61 
 
 		 829 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1846  penicillin amidase  34.51 
 
 		 698 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.275998 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4245  peptidase S45 penicillin amidase  34.68 
 
 		 784 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423428  normal  0.359084 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2798  penicillin amidase  31.01 
 
 		 848 aa  300  5e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000130023  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3360  peptidase S45 penicillin amidase  32.16 
 
 		 833 aa  297  5e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545108  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3025  penicillin acylase II  32.67 
 
 		 786 aa  296  1e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4133  penicillin amidase family protein  30.26 
 
 		 824 aa  296  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.699184  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4754  peptidase S45 penicillin amidase  35.02 
 
 		 792 aa  293  6e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11589  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1588  penicillin amidase  32.11 
 
 		 693 aa  293  1e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0427638 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  32.61 
 
 		 792 aa  292  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0898  peptidase S45 penicillin amidase  35.07 
 
 		 785 aa  291  4e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177532 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19340  Peptidase S45, penicillin amidase family  31.81 
 
 		 839 aa  290  8e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  31.77 
 
 		 809 aa  290  1e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1089  penicillin amidase family protein  30.85 
 
 		 761 aa  286  1.0000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3871  penicillin amidase  28.86 
 
 		 824 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1213  peptidase S45, penicillin amidase  29.51 
 
 		 816 aa  280  5e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.951411 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1397  penicillin amidase  32.75 
 
 		 762 aa  280  8e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1414  penicillin amidase  30.84 
 
 		 837 aa  280  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.290325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4305  penicillin amidase  35.52 
 
 		 641 aa  278  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104752  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5071  peptidase S45, penicillin amidase  29.96 
 
 		 788 aa  270  8e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30580  penicilin amidase  35.52 
 
 		 898 aa  268  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0787437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0301  peptidase S45 penicillin amidase  29.95 
 
 		 787 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.916585  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  30.06 
 
 		 788 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.115972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>