214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1653 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  100 
 
 
827 aa  1667    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  85.35 
 
 
827 aa  1470    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  53.67 
 
 
817 aa  835    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  39.78 
 
 
821 aa  549  1e-155  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  40.1 
 
 
803 aa  513  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  37.63 
 
 
804 aa  506  9.999999999999999e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  34.73 
 
 
796 aa  498  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  35.03 
 
 
796 aa  496  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  34.9 
 
 
796 aa  497  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  35.02 
 
 
796 aa  497  1e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  35.03 
 
 
796 aa  496  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  34.86 
 
 
796 aa  498  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  35.03 
 
 
796 aa  497  1e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  34.65 
 
 
796 aa  496  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  35.04 
 
 
796 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  38.02 
 
 
810 aa  493  9.999999999999999e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  35.03 
 
 
796 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  38.01 
 
 
854 aa  483  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  38.64 
 
 
829 aa  476  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  38.8 
 
 
843 aa  474  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  38.13 
 
 
821 aa  466  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  42.11 
 
 
770 aa  468  9.999999999999999e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0269  penicillin amidase  39.16 
 
 
789 aa  460  9.999999999999999e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.29223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  35.64 
 
 
855 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1644  penicillin amidase  37.3 
 
 
854 aa  458  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4404  peptidase S45, penicillin amidase  35.84 
 
 
903 aa  458  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.676732  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6210  peptidase S45 penicillin amidase  36.53 
 
 
858 aa  451  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329512  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  38.25 
 
 
769 aa  447  1.0000000000000001e-124  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  37.02 
 
 
783 aa  443  1e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  36.31 
 
 
779 aa  442  9.999999999999999e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4884  peptidase S45 penicillin amidase  35.48 
 
 
906 aa  431  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  35.26 
 
 
857 aa  427  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  37.76 
 
 
787 aa  424  1e-117  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  36.57 
 
 
818 aa  423  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  36.51 
 
 
813 aa  422  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0858  penicillin acylase  32.37 
 
 
780 aa  410  1e-113  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.459366  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0788  penicillin amidase  35.03 
 
 
872 aa  402  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2814  peptidase S45 penicillin amidase  34 
 
 
870 aa  392  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.893736  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0835  peptidase S45 penicillin amidase  34.7 
 
 
856 aa  384  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0497714  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  32.29 
 
 
823 aa  385  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  32.71 
 
 
819 aa  384  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3370  penicillin amidase  33.01 
 
 
822 aa  379  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  31.38 
 
 
819 aa  377  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  36.69 
 
 
809 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2452  penicillin amidase  32.48 
 
 
889 aa  375  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288116  normal  0.271218 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1553  penicillin amidase  33.74 
 
 
774 aa  375  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275425  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4805  peptidase S45 penicillin amidase  33.37 
 
 
844 aa  375  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3277  penicillin amidase  31.93 
 
 
782 aa  374  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1877  putative penicillin amidase  32.77 
 
 
823 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1726  penicillin acylase  32.89 
 
 
837 aa  373  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  36.45 
 
 
809 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0887  putative penicillin amidase  32.77 
 
 
837 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1174  putative penicillin amidase  32.77 
 
 
837 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0371  putative penicillin amidase  32.89 
 
 
837 aa  372  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0278  putative penicillin amidase  32.77 
 
 
837 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23695  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2152  putative penicillin amidase  32.77 
 
 
837 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1594  peptidase S45 penicillin amidase  35.13 
 
 
836 aa  371  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  32.75 
 
 
864 aa  367  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5635  penicillin amidase (peptidase S45)  32.8 
 
 
812 aa  368  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0038  peptidase S45 penicillin amidase  32.09 
 
 
807 aa  359  9.999999999999999e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  32.59 
 
 
818 aa  353  8e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3478  peptidase S45 penicillin amidase  31.59 
 
 
847 aa  349  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  32.34 
 
 
806 aa  348  3e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4199  peptidase S45 penicillin amidase  30.4 
 
 
809 aa  348  3e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4309  peptidase S45 penicillin amidase  30.4 
 
 
809 aa  348  3e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1089  penicillin amidase family protein  33.25 
 
 
761 aa  341  4e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0502  peptidase S45, penicillin amidase  28.57 
 
 
795 aa  337  3.9999999999999995e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.269122  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2798  penicillin amidase  29.48 
 
 
848 aa  337  7.999999999999999e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000130023  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  34.5 
 
 
792 aa  332  2e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  28.34 
 
 
811 aa  331  3e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  30.77 
 
 
808 aa  330  8e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4754  peptidase S45 penicillin amidase  34.03 
 
 
792 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11589  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  31.59 
 
 
809 aa  329  2.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0396  hypothetical protein  32.17 
 
 
795 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2999  peptidase S45 penicillin amidase  31.3 
 
 
807 aa  328  3e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50980  putative penicillin amidase  30.84 
 
 
847 aa  328  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.646025  hitchhiker  0.000000127919 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21490  penicilin amidase  30.61 
 
 
841 aa  328  3e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  34.88 
 
 
821 aa  325  2e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03980  hypothetical protein  32.21 
 
 
795 aa  324  3e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4349  putative penicillin amidase  30.6 
 
 
847 aa  324  3e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0772  hypothetical protein  29.81 
 
 
810 aa  325  3e-87  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4245  peptidase S45 penicillin amidase  32.93 
 
 
784 aa  320  5e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423428  normal  0.359084 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1565  acylase precursor  33.37 
 
 
827 aa  320  7e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0134254  normal  0.042074 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1448  penicillin amidase  30.86 
 
 
823 aa  318  4e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1397  penicillin amidase  31.86 
 
 
762 aa  317  5e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5398  penicillin amidase  31.43 
 
 
803 aa  316  9e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111495  hitchhiker  0.00200209 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2845  putative penicillin acylase (penicillin amidase)  30.86 
 
 
823 aa  316  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1495  penicillin amidase  30.63 
 
 
821 aa  316  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.505124  normal  0.225613 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5071  peptidase S45, penicillin amidase  31.27 
 
 
788 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  30.24 
 
 
795 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  31.63 
 
 
788 aa  311  4e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  30.21 
 
 
795 aa  310  5e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0301  peptidase S45 penicillin amidase  31.37 
 
 
787 aa  308  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.916585  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2327  penicillin amidase  31.51 
 
 
826 aa  308  3e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00682213  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19340  Peptidase S45, penicillin amidase family  30.72 
 
 
839 aa  306  1.0000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5217  peptidase S45 penicillin amidase  31.11 
 
 
787 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1213  peptidase S45, penicillin amidase  29.51 
 
 
816 aa  303  9e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.951411 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0898  peptidase S45 penicillin amidase  32.77 
 
 
785 aa  298  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.177532 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1354  penicillin amidase  30.89 
 
 
829 aa  294  5e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342409  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1414  penicillin amidase  28.82 
 
 
837 aa  294  5e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.290325  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>