159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4913 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4913  peptidase S45 penicillin amidase  100 
 
 		 740 aa  1417    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0991334  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3025  penicillin acylase II  32.61 
 
 		 786 aa  245  3e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3540  penicillin amidase  30.78 
 
 		 768 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3361  peptidase S45 penicillin amidase  27.93 
 
 		 769 aa  194  7e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.272902 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0961  penicillin amidase  30.01 
 
 		 804 aa  192  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3220  penicillin amidase  26.34 
 
 		 768 aa  183  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2669  penicillin amidase  26.83 
 
 		 782 aa  178  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2914  penicillin amidase  26.98 
 
 		 770 aa  178  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0831  penicillin amidase  29.51 
 
 		 829 aa  177  7e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0438978 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4181  penicillin amidase  29.25 
 
 		 831 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2028  putative penicillin amidase  30.49 
 
 		 790 aa  170  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2163  peptidase  30.49 
 
 		 815 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.703029  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2008  putative penicillin amidase  30.49 
 
 		 790 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.276522  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1484  putative penicillin amidase  30.49 
 
 		 790 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251017  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0153  putative penicillin amidase  30.49 
 
 		 790 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.877859  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1011  putative penicillin amidase  30.49 
 
 		 790 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1038  penicillin amidase, putative  30.49 
 
 		 783 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.383648  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02441  putative hydrolase  26.91 
 
 		 776 aa  159  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.135854  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01150  penicillin acylase II  29.74 
 
 		 805 aa  158  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1282  peptidase S45 penicillin amidase  28.11 
 
 		 775 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.224327  normal  0.39054 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3735  penicillin amidase  26.07 
 
 		 758 aa  146  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1223  penicillin amidase family protein  23.64 
 
 		 810 aa  142  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0792  putative penicillin amidase  28.63 
 
 		 796 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0953  peptidase  28.63 
 
 		 886 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3370  penicillin amidase  24.8 
 
 		 822 aa  139  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0780  peptidase  28.63 
 
 		 796 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1765  peptidase S45 penicillin amidase  27.21 
 
 		 777 aa  139  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0631  penicillin amidase, putative  30.39 
 
 		 797 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  25.58 
 
 		 779 aa  130  6e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  27.07 
 
 		 817 aa  127  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  23.53 
 
 		 796 aa  126  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  23.07 
 
 		 796 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  27.13 
 
 		 854 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  25.61 
 
 		 827 aa  122  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  26.08 
 
 		 827 aa  122  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  22.43 
 
 		 796 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  26.28 
 
 		 821 aa  121  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  22.3 
 
 		 796 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  22.43 
 
 		 796 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  22.55 
 
 		 796 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  22.3 
 
 		 796 aa  118  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  22.3 
 
 		 796 aa  117  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  25.28 
 
 		 783 aa  117  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  22.3 
 
 		 796 aa  118  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50980  putative penicillin amidase  26.85 
 
 		 847 aa  117  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.646025  hitchhiker  0.000000127919 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0269  penicillin amidase  26.93 
 
 		 789 aa  116  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.29223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  26.58 
 
 		 843 aa  117  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19340  Peptidase S45, penicillin amidase family  27.24 
 
 		 839 aa  115  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  27.18 
 
 		 787 aa  116  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  27.51 
 
 		 809 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0858  penicillin acylase  23.31 
 
 		 780 aa  112  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.459366  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  22.51 
 
 		 796 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  26.68 
 
 		 829 aa  112  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6210  peptidase S45 penicillin amidase  26.23 
 
 		 858 aa  112  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  24.76 
 
 		 855 aa  111  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  27.25 
 
 		 804 aa  111  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1553  penicillin amidase  28.94 
 
 		 774 aa  110  7.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275425  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  26.22 
 
 		 769 aa  109  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4349  putative penicillin amidase  25.91 
 
 		 847 aa  109  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2814  peptidase S45 penicillin amidase  29.24 
 
 		 870 aa  108  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.893736  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  28.26 
 
 		 809 aa  107  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0788  penicillin amidase  28.11 
 
 		 872 aa  107  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  26.56 
 
 		 770 aa  107  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1414  penicillin amidase  26.05 
 
 		 837 aa  105  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.290325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  25.48 
 
 		 819 aa  102  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  26.76 
 
 		 810 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  24.16 
 
 		 819 aa  103  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  24.63 
 
 		 823 aa  101  6e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2114  penicillin acylase-like protein  27.16 
 
 		 774 aa  100  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  25.83 
 
 		 857 aa  100  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  24.24 
 
 		 809 aa  100  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  24.33 
 
 		 821 aa  100  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4805  peptidase S45 penicillin amidase  27.93 
 
 		 844 aa  100  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1588  penicillin amidase  26.24 
 
 		 693 aa  98.6  4e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0427638 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1846  penicillin amidase  26.53 
 
 		 698 aa  96.7  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.275998 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  22.94 
 
 		 818 aa  96.3  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  22.31 
 
 		 808 aa  95.5  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0612  peptidase S45 penicillin amidase  35.82 
 
 		 815 aa  94.4  6e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.928673  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1644  penicillin amidase  27.1 
 
 		 854 aa  94  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  29.35 
 
 		 813 aa  94  9e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  26.92 
 
 		 818 aa  94  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  20.51 
 
 		 811 aa  93.2  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  26.9 
 
 		 864 aa  92.4  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  25.85 
 
 		 821 aa  91.7  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1495  penicillin amidase  24.68 
 
 		 821 aa  89.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.505124  normal  0.225613 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0835  peptidase S45 penicillin amidase  28.17 
 
 		 856 aa  89.7  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0497714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2327  penicillin amidase  29.1 
 
 		 826 aa  87.4  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00682213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  23.21 
 
 		 806 aa  87.4  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0038  peptidase S45 penicillin amidase  22.76 
 
 		 807 aa  86.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  26.38 
 
 		 803 aa  85.9  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21490  penicilin amidase  24.39 
 
 		 841 aa  86.3  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2845  putative penicillin acylase (penicillin amidase)  24.51 
 
 		 823 aa  84.7  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1354  penicillin amidase  30.74 
 
 		 829 aa  84.3  0.000000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1448  penicillin amidase  24.51 
 
 		 823 aa  84.3  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2452  penicillin amidase  25.61 
 
 		 889 aa  82.8  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288116  normal  0.271218 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1594  peptidase S45 penicillin amidase  27.06 
 
 		 836 aa  82  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  25.88 
 
 		 788 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5071  peptidase S45, penicillin amidase  25.56 
 
 		 788 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5217  peptidase S45 penicillin amidase  24.02 
 
 		 787 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2798  penicillin amidase  24.76 
 
 		 848 aa  78.2  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000130023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>