210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1588 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1846  penicillin amidase  74.5 
 
 		 698 aa  1070    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.275998 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1588  penicillin amidase  100 
 
 		 693 aa  1413    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0427638 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  32.45 
 
 		 770 aa  291  3e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  30.59 
 
 		 779 aa  287  4e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  31.14 
 
 		 769 aa  278  3e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  31.9 
 
 		 804 aa  276  8e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  30.92 
 
 		 783 aa  276  1.0000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  31.21 
 
 		 821 aa  269  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  32.47 
 
 		 803 aa  266  1e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0269  penicillin amidase  31.46 
 
 		 789 aa  261  2e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.29223 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  30.94 
 
 		 787 aa  261  4e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  30.45 
 
 		 796 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  29.96 
 
 		 796 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  29.83 
 
 		 796 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  29.96 
 
 		 796 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  30.32 
 
 		 796 aa  253  8.000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  30.06 
 
 		 796 aa  253  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  29.67 
 
 		 796 aa  251  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  29.97 
 
 		 796 aa  251  3e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2999  peptidase S45 penicillin amidase  29.66 
 
 		 807 aa  250  7e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  29.45 
 
 		 796 aa  249  9e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  29.91 
 
 		 821 aa  248  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  25.58 
 
 		 811 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  29.03 
 
 		 796 aa  242  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  27.73 
 
 		 823 aa  240  6.999999999999999e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  29.1 
 
 		 829 aa  239  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1553  penicillin amidase  29.75 
 
 		 774 aa  237  6e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  28.91 
 
 		 810 aa  234  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  31.65 
 
 		 843 aa  231  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  28.06 
 
 		 808 aa  229  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0772  hypothetical protein  25.69 
 
 		 810 aa  228  3e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  31.4 
 
 		 806 aa  228  3e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  26.78 
 
 		 818 aa  221  3.9999999999999997e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  28.55 
 
 		 857 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  28.36 
 
 		 817 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  32.26 
 
 		 818 aa  218  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  29.22 
 
 		 821 aa  218  4e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3360  peptidase S45 penicillin amidase  32.17 
 
 		 833 aa  217  7e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545108  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  29.83 
 
 		 819 aa  216  8e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  29.35 
 
 		 819 aa  216  9.999999999999999e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2814  peptidase S45 penicillin amidase  28.09 
 
 		 870 aa  215  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.893736  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0788  penicillin amidase  31.41 
 
 		 872 aa  214  5.999999999999999e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1644  penicillin amidase  29.71 
 
 		 854 aa  207  4e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3025  penicillin acylase II  27.61 
 
 		 786 aa  204  5e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  27.55 
 
 		 827 aa  203  7e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  28.84 
 
 		 827 aa  203  9e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  27.5 
 
 		 864 aa  203  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0858  penicillin acylase  25.88 
 
 		 780 aa  201  3.9999999999999996e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.459366  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3370  penicillin amidase  27.96 
 
 		 822 aa  197  5.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  30.83 
 
 		 809 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2914  penicillin amidase  26.79 
 
 		 770 aa  196  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  28.18 
 
 		 813 aa  196  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  31.35 
 
 		 809 aa  196  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6210  peptidase S45 penicillin amidase  31.76 
 
 		 858 aa  193  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1174  penicillin amidase  26.08 
 
 		 874 aa  189  2e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.141613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  29.8 
 
 		 855 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1397  penicillin amidase  26.87 
 
 		 762 aa  178  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2008  putative penicillin amidase  27.82 
 
 		 790 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.276522  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0502  peptidase S45, penicillin amidase  24.7 
 
 		 795 aa  175  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.269122  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4805  peptidase S45 penicillin amidase  26.19 
 
 		 844 aa  175  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2163  peptidase  27.68 
 
 		 815 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.703029  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0038  peptidase S45 penicillin amidase  26.88 
 
 		 807 aa  174  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2028  putative penicillin amidase  27.41 
 
 		 790 aa  173  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3540  penicillin amidase  27.58 
 
 		 768 aa  173  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2669  penicillin amidase  28.18 
 
 		 782 aa  172  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4309  peptidase S45 penicillin amidase  26.31 
 
 		 809 aa  171  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4199  peptidase S45 penicillin amidase  26.31 
 
 		 809 aa  171  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1038  penicillin amidase, putative  27.54 
 
 		 783 aa  171  6e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.383648  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  25.87 
 
 		 795 aa  171  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1484  putative penicillin amidase  27.54 
 
 		 790 aa  170  7e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251017  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0153  putative penicillin amidase  27.54 
 
 		 790 aa  170  7e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.877859  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1011  putative penicillin amidase  27.54 
 
 		 790 aa  170  7e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03980  hypothetical protein  25.53 
 
 		 795 aa  169  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1213  peptidase S45, penicillin amidase  26.72 
 
 		 816 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.951411 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0835  peptidase S45 penicillin amidase  26.78 
 
 		 856 aa  168  4e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0497714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02441  putative hydrolase  26.15 
 
 		 776 aa  167  5.9999999999999996e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.135854  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4181  penicillin amidase  26.59 
 
 		 831 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  25.16 
 
 		 795 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  36.96 
 
 		 854 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0612  peptidase S45 penicillin amidase  31.62 
 
 		 815 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.928673  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3277  penicillin amidase  26.95 
 
 		 782 aa  166  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5217  peptidase S45 penicillin amidase  25.61 
 
 		 787 aa  165  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1089  penicillin amidase family protein  25.59 
 
 		 761 aa  164  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5071  peptidase S45, penicillin amidase  25.47 
 
 		 788 aa  164  6e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0396  hypothetical protein  25.3 
 
 		 795 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0953  peptidase  30.67 
 
 		 886 aa  162  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0631  penicillin amidase, putative  32.21 
 
 		 797 aa  161  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1354  penicillin amidase  26.19 
 
 		 829 aa  161  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3220  penicillin amidase  24.8 
 
 		 768 aa  161  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1495  penicillin amidase  25.4 
 
 		 821 aa  161  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.505124  normal  0.225613 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0792  putative penicillin amidase  30.67 
 
 		 796 aa  161  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  27.71 
 
 		 792 aa  160  6e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0780  peptidase  30.67 
 
 		 796 aa  160  7e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0301  peptidase S45 penicillin amidase  24.8 
 
 		 787 aa  160  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.916585  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  25.14 
 
 		 788 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3361  peptidase S45 penicillin amidase  29.91 
 
 		 769 aa  159  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.272902 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3478  peptidase S45 penicillin amidase  29.7 
 
 		 847 aa  159  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2798  penicillin amidase  26.64 
 
 		 848 aa  158  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000130023  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1565  acylase precursor  26.15 
 
 		 827 aa  158  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0134254  normal  0.042074 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4002  penicillin amidase  26.64 
 
 		 818 aa  157  7e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.307952 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>