213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5300 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_5217  peptidase S45 penicillin amidase  65.03 
 
 		 787 aa  1069    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  65.37 
 
 		 788 aa  1063    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  100 
 
 		 795 aa  1626    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  94.84 
 
 		 795 aa  1532    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5398  penicillin amidase  70.3 
 
 		 803 aa  1177    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111495  hitchhiker  0.00200209 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  61.7 
 
 		 809 aa  1030    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03980  hypothetical protein  67.97 
 
 		 795 aa  1129    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0396  hypothetical protein  69.1 
 
 		 795 aa  1147    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0301  peptidase S45 penicillin amidase  65.41 
 
 		 787 aa  1067    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.916585  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  65.07 
 
 		 792 aa  1090    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5071  peptidase S45, penicillin amidase  65.16 
 
 		 788 aa  1078    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0502  peptidase S45, penicillin amidase  36.48 
 
 		 795 aa  536  1e-151  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.269122  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  29.58 
 
 		 817 aa  318  3e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  31.66 
 
 		 821 aa  317  5e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  30.24 
 
 		 827 aa  311  2e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  29.75 
 
 		 827 aa  309  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  30.51 
 
 		 829 aa  306  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  28.84 
 
 		 796 aa  305  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  28.82 
 
 		 796 aa  304  5.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  28.33 
 
 		 796 aa  303  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  28.82 
 
 		 796 aa  303  8.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  28.82 
 
 		 796 aa  303  8.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  28.33 
 
 		 796 aa  301  3e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  29.87 
 
 		 843 aa  300  8e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  28.73 
 
 		 796 aa  300  1e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  28.57 
 
 		 796 aa  298  3e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  32.08 
 
 		 769 aa  297  5e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  30.2 
 
 		 804 aa  293  6e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  28.79 
 
 		 821 aa  293  7e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  28.62 
 
 		 796 aa  293  1e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  28.33 
 
 		 796 aa  292  2e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  30.3 
 
 		 810 aa  288  4e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0269  penicillin amidase  31.87 
 
 		 789 aa  281  3e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.29223 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  29.69 
 
 		 803 aa  280  8e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  29.17 
 
 		 819 aa  271  4e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  29.99 
 
 		 854 aa  270  8.999999999999999e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  28.55 
 
 		 819 aa  268  2.9999999999999995e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  28.87 
 
 		 813 aa  266  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  30.33 
 
 		 787 aa  263  6.999999999999999e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  28.22 
 
 		 818 aa  262  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  28.93 
 
 		 818 aa  261  4e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  28.06 
 
 		 855 aa  260  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  29.67 
 
 		 783 aa  259  1e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1594  peptidase S45 penicillin amidase  30.17 
 
 		 836 aa  258  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2798  penicillin amidase  27.94 
 
 		 848 aa  258  4e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000130023  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4805  peptidase S45 penicillin amidase  29.19 
 
 		 844 aa  257  5e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  29.08 
 
 		 779 aa  254  4.0000000000000004e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0038  peptidase S45 penicillin amidase  29.05 
 
 		 807 aa  252  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2814  peptidase S45 penicillin amidase  29.15 
 
 		 870 aa  251  3e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.893736  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1414  penicillin amidase  27.69 
 
 		 837 aa  250  6e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.290325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50980  putative penicillin amidase  27.48 
 
 		 847 aa  250  9e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.646025  hitchhiker  0.000000127919 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  28.37 
 
 		 770 aa  248  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4349  putative penicillin amidase  27.43 
 
 		 847 aa  248  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  27.16 
 
 		 811 aa  248  4e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1553  penicillin amidase  30.16 
 
 		 774 aa  244  3e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19340  Peptidase S45, penicillin amidase family  28.64 
 
 		 839 aa  241  4e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  26.83 
 
 		 808 aa  239  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5635  penicillin amidase (peptidase S45)  29.1 
 
 		 812 aa  237  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3370  penicillin amidase  28.8 
 
 		 822 aa  235  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1354  penicillin amidase  27.25 
 
 		 829 aa  236  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4404  peptidase S45, penicillin amidase  26.33 
 
 		 903 aa  235  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.676732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  28.1 
 
 		 809 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4133  penicillin amidase family protein  27.83 
 
 		 824 aa  233  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.699184  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2452  penicillin amidase  27.57 
 
 		 889 aa  232  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288116  normal  0.271218 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  26.71 
 
 		 857 aa  231  4e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  28.27 
 
 		 823 aa  231  4e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1644  penicillin amidase  28.16 
 
 		 854 aa  228  3e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1213  peptidase S45, penicillin amidase  27.44 
 
 		 816 aa  228  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.951411 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2327  penicillin amidase  26.37 
 
 		 826 aa  226  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00682213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  27.49 
 
 		 806 aa  224  4.9999999999999996e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6210  peptidase S45 penicillin amidase  27.21 
 
 		 858 aa  223  7e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  28.03 
 
 		 809 aa  223  9e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0858  penicillin acylase  26.23 
 
 		 780 aa  222  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.459366  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0788  penicillin amidase  27.57 
 
 		 872 aa  220  7e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3478  peptidase S45 penicillin amidase  28.31 
 
 		 847 aa  218  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4309  peptidase S45 penicillin amidase  26.96 
 
 		 809 aa  217  8e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4199  peptidase S45 penicillin amidase  26.96 
 
 		 809 aa  217  8e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3871  penicillin amidase  26.66 
 
 		 824 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1448  penicillin amidase  26.76 
 
 		 823 aa  216  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2999  peptidase S45 penicillin amidase  27.06 
 
 		 807 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2845  putative penicillin acylase (penicillin amidase)  26.64 
 
 		 823 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0835  peptidase S45 penicillin amidase  28.38 
 
 		 856 aa  213  7.999999999999999e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0497714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1565  acylase precursor  26.28 
 
 		 827 aa  213  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0134254  normal  0.042074 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  28.79 
 
 		 821 aa  211  6e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3277  penicillin amidase  27.47 
 
 		 782 aa  209  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1495  penicillin amidase  26.02 
 
 		 821 aa  209  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.505124  normal  0.225613 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3360  peptidase S45 penicillin amidase  27.22 
 
 		 833 aa  206  1e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545108  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3459  peptidase S45 penicillin amidase  25.95 
 
 		 885 aa  204  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0402135  hitchhiker  0.000204801 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  26.5 
 
 		 864 aa  201  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1174  penicillin amidase  26.35 
 
 		 874 aa  201  5e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.141613 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3025  penicillin acylase II  27.39 
 
 		 786 aa  195  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0898  peptidase S45 penicillin amidase  27.11 
 
 		 785 aa  194  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177532 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0371  putative penicillin amidase  29.46 
 
 		 837 aa  187  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1726  penicillin acylase  29.46 
 
 		 837 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0887  putative penicillin amidase  29.29 
 
 		 837 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1174  putative penicillin amidase  29.29 
 
 		 837 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0278  putative penicillin amidase  29.46 
 
 		 837 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23695  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2152  putative penicillin amidase  29.29 
 
 		 837 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1877  putative penicillin amidase  29.29 
 
 		 823 aa  185  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0792  putative penicillin amidase  27.59 
 
 		 796 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>