212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_5071 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  97.71 
 
 		 788 aa  1537    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  65.16 
 
 		 795 aa  1063    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  64.78 
 
 		 795 aa  1071    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5398  penicillin amidase  67.5 
 
 		 803 aa  1086    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111495  hitchhiker  0.00200209 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  60.15 
 
 		 809 aa  972    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03980  hypothetical protein  68.3 
 
 		 795 aa  1067    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0301  peptidase S45 penicillin amidase  89.95 
 
 		 787 aa  1427    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.916585  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5217  peptidase S45 penicillin amidase  91.61 
 
 		 787 aa  1460    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  66.16 
 
 		 792 aa  1066    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5071  peptidase S45, penicillin amidase  100 
 
 		 788 aa  1593    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0396  hypothetical protein  68.3 
 
 		 795 aa  1074    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0502  peptidase S45, penicillin amidase  37.37 
 
 		 795 aa  545  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.269122  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  31.57 
 
 		 817 aa  331  2e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  31.07 
 
 		 821 aa  316  9.999999999999999e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0269  penicillin amidase  33.42 
 
 		 789 aa  315  2.9999999999999996e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.29223 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  31.63 
 
 		 827 aa  311  4e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  27.5 
 
 		 796 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  28.21 
 
 		 796 aa  303  8.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  28.21 
 
 		 796 aa  303  8.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  28.36 
 
 		 796 aa  303  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  28.09 
 
 		 796 aa  303  1e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  30.06 
 
 		 827 aa  301  2e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  28.14 
 
 		 796 aa  301  3e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  27.85 
 
 		 796 aa  300  6e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  27.97 
 
 		 796 aa  298  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  27.74 
 
 		 796 aa  298  2e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  28.09 
 
 		 796 aa  299  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  29.8 
 
 		 829 aa  296  9e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  32.05 
 
 		 769 aa  295  2e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  30.55 
 
 		 821 aa  295  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  30.01 
 
 		 843 aa  294  5e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  31.09 
 
 		 783 aa  291  3e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  29.39 
 
 		 803 aa  282  1e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  29.51 
 
 		 854 aa  276  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  31.54 
 
 		 787 aa  275  4.0000000000000004e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  29.4 
 
 		 810 aa  272  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  27.53 
 
 		 804 aa  269  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  30.09 
 
 		 779 aa  268  2e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  29.09 
 
 		 855 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4805  peptidase S45 penicillin amidase  28.78 
 
 		 844 aa  268  4e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2798  penicillin amidase  27.33 
 
 		 848 aa  268  4e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000130023  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  30.01 
 
 		 770 aa  266  8.999999999999999e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  28.86 
 
 		 818 aa  261  3e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0858  penicillin acylase  27.82 
 
 		 780 aa  257  5e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.459366  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2814  peptidase S45 penicillin amidase  28.4 
 
 		 870 aa  255  2.0000000000000002e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.893736  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  28.41 
 
 		 819 aa  254  3e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  27.97 
 
 		 823 aa  253  6e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1644  penicillin amidase  30.71 
 
 		 854 aa  250  6e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1594  peptidase S45 penicillin amidase  28.5 
 
 		 836 aa  248  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  29.26 
 
 		 809 aa  248  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50980  putative penicillin amidase  26.73 
 
 		 847 aa  247  8e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.646025  hitchhiker  0.000000127919 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1553  penicillin amidase  29.43 
 
 		 774 aa  246  9.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2327  penicillin amidase  28.31 
 
 		 826 aa  244  3.9999999999999997e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00682213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  28.32 
 
 		 813 aa  243  9e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  27.18 
 
 		 818 aa  242  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1213  peptidase S45, penicillin amidase  27.64 
 
 		 816 aa  239  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.951411 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1448  penicillin amidase  28.22 
 
 		 823 aa  239  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6210  peptidase S45 penicillin amidase  28.07 
 
 		 858 aa  239  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  27.13 
 
 		 819 aa  238  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  28.15 
 
 		 809 aa  238  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2845  putative penicillin acylase (penicillin amidase)  28.22 
 
 		 823 aa  238  4e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4349  putative penicillin amidase  27.23 
 
 		 847 aa  238  4e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  26.68 
 
 		 811 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1495  penicillin amidase  27.59 
 
 		 821 aa  234  5e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.505124  normal  0.225613 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1414  penicillin amidase  26.46 
 
 		 837 aa  234  5e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.290325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  27.99 
 
 		 857 aa  234  6e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5635  penicillin amidase (peptidase S45)  28.88 
 
 		 812 aa  232  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19340  Peptidase S45, penicillin amidase family  27 
 
 		 839 aa  228  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2452  penicillin amidase  27.77 
 
 		 889 aa  228  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288116  normal  0.271218 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0038  peptidase S45 penicillin amidase  27.39 
 
 		 807 aa  225  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1565  acylase precursor  28.37 
 
 		 827 aa  224  4e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0134254  normal  0.042074 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4133  penicillin amidase family protein  26.98 
 
 		 824 aa  219  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.699184  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3370  penicillin amidase  28.05 
 
 		 822 aa  218  4e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1726  penicillin acylase  28.05 
 
 		 837 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0371  putative penicillin amidase  28.05 
 
 		 837 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0278  putative penicillin amidase  28.05 
 
 		 837 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23695  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1877  putative penicillin amidase  27.93 
 
 		 823 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3871  penicillin amidase  26.46 
 
 		 824 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0887  putative penicillin amidase  27.93 
 
 		 837 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1174  putative penicillin amidase  27.93 
 
 		 837 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2152  putative penicillin amidase  27.93 
 
 		 837 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  25.64 
 
 		 808 aa  214  7e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  26.35 
 
 		 806 aa  213  7.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  28.01 
 
 		 821 aa  211  4e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0835  peptidase S45 penicillin amidase  28.62 
 
 		 856 aa  210  7e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0497714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1354  penicillin amidase  26.55 
 
 		 829 aa  208  3e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3478  peptidase S45 penicillin amidase  26.89 
 
 		 847 aa  207  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4309  peptidase S45 penicillin amidase  26.81 
 
 		 809 aa  206  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4199  peptidase S45 penicillin amidase  26.81 
 
 		 809 aa  206  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3360  peptidase S45 penicillin amidase  26.5 
 
 		 833 aa  204  6e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545108  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3459  peptidase S45 penicillin amidase  27.85 
 
 		 885 aa  204  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0402135  hitchhiker  0.000204801 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3025  penicillin acylase II  27.9 
 
 		 786 aa  200  9e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3277  penicillin amidase  26.55 
 
 		 782 aa  198  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0831  penicillin amidase  33.84 
 
 		 829 aa  198  4.0000000000000005e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0438978 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1397  penicillin amidase  28.38 
 
 		 762 aa  197  6e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2999  peptidase S45 penicillin amidase  26.09 
 
 		 807 aa  197  8.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  26.84 
 
 		 864 aa  196  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4305  penicillin amidase  26.58 
 
 		 813 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1137  penicillin amidase  26.06 
 
 		 813 aa  194  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.416343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0898  peptidase S45 penicillin amidase  26.04 
 
 		 785 aa  193  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177532 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>