213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2999 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2999  peptidase S45 penicillin amidase  100 
 
 
807 aa  1673    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  43.88 
 
 
808 aa  645    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  44.06 
 
 
811 aa  663    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  43.3 
 
 
818 aa  617  1e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0772  hypothetical protein  39.16 
 
 
810 aa  561  1e-158  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  31.49 
 
 
796 aa  364  3e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  31.49 
 
 
796 aa  364  3e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  31.35 
 
 
796 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  31.08 
 
 
796 aa  363  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  31.22 
 
 
796 aa  363  1e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  31.08 
 
 
796 aa  362  1e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  30.82 
 
 
796 aa  362  2e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  30.72 
 
 
796 aa  361  3e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  30.6 
 
 
796 aa  360  4e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  30.56 
 
 
796 aa  357  5e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  31.29 
 
 
783 aa  354  5e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  32.37 
 
 
804 aa  350  4e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  31.41 
 
 
770 aa  348  2e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  32.55 
 
 
803 aa  344  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  31.86 
 
 
827 aa  332  2e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  30.73 
 
 
779 aa  330  5.0000000000000004e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  31.41 
 
 
769 aa  328  3e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  31.3 
 
 
827 aa  327  5e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  32.05 
 
 
829 aa  316  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  29.95 
 
 
821 aa  313  7.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0858  penicillin acylase  30.36 
 
 
780 aa  310  5.9999999999999995e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.459366  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0269  penicillin amidase  31.41 
 
 
789 aa  310  6.999999999999999e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.29223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  30.28 
 
 
855 aa  306  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  29.7 
 
 
854 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  30.48 
 
 
817 aa  305  3.0000000000000004e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  30.85 
 
 
821 aa  303  7.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  30.32 
 
 
787 aa  298  3e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  29.04 
 
 
843 aa  297  4e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1644  penicillin amidase  29.98 
 
 
854 aa  295  3e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  27.94 
 
 
857 aa  294  5e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  30.64 
 
 
864 aa  293  8e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6210  peptidase S45 penicillin amidase  33.45 
 
 
858 aa  293  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329512  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2814  peptidase S45 penicillin amidase  29.22 
 
 
870 aa  289  1e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.893736  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4404  peptidase S45, penicillin amidase  28 
 
 
903 aa  287  5.999999999999999e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.676732  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0788  penicillin amidase  30.68 
 
 
872 aa  284  4.0000000000000003e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3459  peptidase S45 penicillin amidase  29.1 
 
 
885 aa  282  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0402135  hitchhiker  0.000204801 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4884  peptidase S45 penicillin amidase  30 
 
 
906 aa  276  1.0000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  29.73 
 
 
813 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  29.77 
 
 
818 aa  274  4.0000000000000004e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1553  penicillin amidase  27.48 
 
 
774 aa  273  6e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275425  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  29.43 
 
 
810 aa  273  1e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0835  peptidase S45 penicillin amidase  29.24 
 
 
856 aa  270  5.9999999999999995e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0497714  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  32.47 
 
 
823 aa  270  7e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3360  peptidase S45 penicillin amidase  28.61 
 
 
833 aa  268  2.9999999999999995e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545108  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0038  peptidase S45 penicillin amidase  30.56 
 
 
807 aa  267  8e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3370  penicillin amidase  28.9 
 
 
822 aa  265  3e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  30.01 
 
 
819 aa  263  1e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1174  penicillin amidase  28.08 
 
 
874 aa  261  3e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.141613 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2452  penicillin amidase  32.41 
 
 
889 aa  261  4e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288116  normal  0.271218 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  29.22 
 
 
819 aa  261  4e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3277  penicillin amidase  28.5 
 
 
782 aa  254  4.0000000000000004e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  29.17 
 
 
806 aa  253  8.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  30.68 
 
 
809 aa  253  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1588  penicillin amidase  29.66 
 
 
693 aa  250  9e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0427638 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  30.98 
 
 
809 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1448  penicillin amidase  27.05 
 
 
823 aa  247  6.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0371  putative penicillin amidase  26.89 
 
 
837 aa  247  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2845  putative penicillin acylase (penicillin amidase)  27.08 
 
 
823 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1877  putative penicillin amidase  26.77 
 
 
823 aa  245  3e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0887  putative penicillin amidase  26.77 
 
 
837 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1174  putative penicillin amidase  26.77 
 
 
837 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2152  putative penicillin amidase  26.77 
 
 
837 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0278  putative penicillin amidase  26.77 
 
 
837 aa  244  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23695  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1726  penicillin acylase  26.77 
 
 
837 aa  244  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1495  penicillin amidase  27.12 
 
 
821 aa  240  8e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.505124  normal  0.225613 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1846  penicillin amidase  28.69 
 
 
698 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.275998 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  28.5 
 
 
792 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3025  penicillin acylase II  27.33 
 
 
786 aa  233  1e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2327  penicillin amidase  28.12 
 
 
826 aa  232  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00682213  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2798  penicillin amidase  24.64 
 
 
848 aa  231  5e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000130023  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1594  peptidase S45 penicillin amidase  28.23 
 
 
836 aa  228  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5635  penicillin amidase (peptidase S45)  26.46 
 
 
812 aa  229  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4309  peptidase S45 penicillin amidase  25.82 
 
 
809 aa  227  7e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4199  peptidase S45 penicillin amidase  25.82 
 
 
809 aa  227  7e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4805  peptidase S45 penicillin amidase  27.5 
 
 
844 aa  226  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5398  penicillin amidase  28.83 
 
 
803 aa  224  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111495  hitchhiker  0.00200209 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  27.88 
 
 
809 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  27.74 
 
 
795 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  27.42 
 
 
795 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1565  acylase precursor  27.14 
 
 
827 aa  214  4.9999999999999996e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0134254  normal  0.042074 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0961  penicillin amidase  26.37 
 
 
804 aa  214  4.9999999999999996e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0396  hypothetical protein  27.31 
 
 
795 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2114  penicillin acylase-like protein  29.64 
 
 
774 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0502  peptidase S45, penicillin amidase  26.56 
 
 
795 aa  214  7.999999999999999e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.269122  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1354  penicillin amidase  25.99 
 
 
829 aa  212  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342409  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0612  peptidase S45 penicillin amidase  27.49 
 
 
815 aa  211  5e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.928673  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2302  peptidase S45 penicillin amidase  26.09 
 
 
831 aa  209  1e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50980  putative penicillin amidase  25.15 
 
 
847 aa  209  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.646025  hitchhiker  0.000000127919 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21490  penicilin amidase  25.91 
 
 
841 aa  209  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0301  peptidase S45 penicillin amidase  26.24 
 
 
787 aa  209  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.916585  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  31.49 
 
 
821 aa  207  5e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  26.5 
 
 
788 aa  204  6e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19340  Peptidase S45, penicillin amidase family  26.31 
 
 
839 aa  203  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1765  peptidase S45 penicillin amidase  26.81 
 
 
777 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4245  peptidase S45 penicillin amidase  27.91 
 
 
784 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423428  normal  0.359084 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>