212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA1089 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA1089  penicillin amidase family protein  100 
 
 
761 aa  1563    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1397  penicillin amidase  42.91 
 
 
762 aa  593  1e-168  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  33.46 
 
 
827 aa  340  5e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  33.96 
 
 
827 aa  338  2.9999999999999997e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5851  peptidase S45 penicillin amidase  31.96 
 
 
724 aa  337  3.9999999999999995e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390713  normal  0.0954334 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3458  penicillin amidase  33.88 
 
 
694 aa  316  9.999999999999999e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  30.68 
 
 
817 aa  316  9.999999999999999e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  30.25 
 
 
829 aa  304  5.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3370  penicillin amidase  30.39 
 
 
822 aa  303  6.000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  29.07 
 
 
821 aa  295  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0269  penicillin amidase  30.41 
 
 
789 aa  288  2.9999999999999996e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.29223 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  30.85 
 
 
770 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  27.32 
 
 
821 aa  285  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  29.51 
 
 
783 aa  278  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  28.88 
 
 
804 aa  278  3e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1644  penicillin amidase  28.45 
 
 
854 aa  278  4e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  30.98 
 
 
769 aa  277  6e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  28.59 
 
 
779 aa  276  1.0000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  29.36 
 
 
854 aa  274  4.0000000000000004e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  29.01 
 
 
857 aa  273  8.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  26.2 
 
 
796 aa  273  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3272  Penicillin amidase  30.87 
 
 
698 aa  272  1e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  26.44 
 
 
796 aa  272  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  26.82 
 
 
796 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  26.34 
 
 
796 aa  270  8e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  28.87 
 
 
803 aa  269  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  29.01 
 
 
855 aa  269  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  29.77 
 
 
787 aa  268  2.9999999999999995e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  26.02 
 
 
796 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  26.02 
 
 
796 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  26.02 
 
 
796 aa  268  4e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  26.05 
 
 
796 aa  268  4e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  26.02 
 
 
796 aa  268  4e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  25.86 
 
 
796 aa  267  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0858  penicillin acylase  25.92 
 
 
780 aa  265  4e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.459366  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1448  penicillin amidase  26.84 
 
 
823 aa  263  8e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4309  peptidase S45 penicillin amidase  27.74 
 
 
809 aa  262  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2845  putative penicillin acylase (penicillin amidase)  26.71 
 
 
823 aa  262  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5635  penicillin amidase (peptidase S45)  28.66 
 
 
812 aa  262  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4199  peptidase S45 penicillin amidase  27.74 
 
 
809 aa  262  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4245  peptidase S45 penicillin amidase  30.14 
 
 
784 aa  261  3e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423428  normal  0.359084 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1553  penicillin amidase  28.86 
 
 
774 aa  260  5.0000000000000005e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275425  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4754  peptidase S45 penicillin amidase  30.27 
 
 
792 aa  259  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11589  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2556  penicillin amidase  31.21 
 
 
702 aa  259  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102799  normal  0.386886 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  28.47 
 
 
864 aa  259  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0835  peptidase S45 penicillin amidase  28.71 
 
 
856 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0497714  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  28.81 
 
 
843 aa  253  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  26.2 
 
 
810 aa  252  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2745  penicillin amidase  31.32 
 
 
692 aa  251  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155883  decreased coverage  0.00157811 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2814  peptidase S45 penicillin amidase  26.87 
 
 
870 aa  248  2e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.893736  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3277  penicillin amidase  27.8 
 
 
782 aa  248  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1495  penicillin amidase  27.01 
 
 
821 aa  248  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.505124  normal  0.225613 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0772  hypothetical protein  26.27 
 
 
810 aa  244  3.9999999999999997e-63  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0038  peptidase S45 penicillin amidase  27.54 
 
 
807 aa  244  6e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0200  peptidase S45 penicillin amidase  29.38 
 
 
742 aa  239  1e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0864183 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  26.98 
 
 
818 aa  239  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  28.73 
 
 
813 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0898  peptidase S45 penicillin amidase  28.62 
 
 
785 aa  233  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.177532 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  28.35 
 
 
809 aa  232  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  26.13 
 
 
819 aa  232  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1565  acylase precursor  28.48 
 
 
827 aa  231  5e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0134254  normal  0.042074 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0788  penicillin amidase  28.06 
 
 
872 aa  230  6e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  29.72 
 
 
821 aa  230  7e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  29.38 
 
 
809 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  24.61 
 
 
811 aa  226  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  25.57 
 
 
819 aa  225  2e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1354  penicillin amidase  26.63 
 
 
829 aa  224  4e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342409  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2798  penicillin amidase  26.54 
 
 
848 aa  224  6e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000130023  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4404  peptidase S45, penicillin amidase  29.43 
 
 
903 aa  221  3.9999999999999997e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.676732  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  27.28 
 
 
806 aa  219  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3478  peptidase S45 penicillin amidase  28.2 
 
 
847 aa  216  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0502  peptidase S45, penicillin amidase  24.27 
 
 
795 aa  215  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.269122  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21490  penicilin amidase  25.48 
 
 
841 aa  214  3.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  26.98 
 
 
818 aa  211  6e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30580  penicilin amidase  30.39 
 
 
898 aa  209  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0787437  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  25.45 
 
 
823 aa  207  7e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2327  penicillin amidase  26.07 
 
 
826 aa  207  8e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00682213  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4805  peptidase S45 penicillin amidase  26.19 
 
 
844 aa  206  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3025  penicillin acylase II  27.44 
 
 
786 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  27.95 
 
 
808 aa  202  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50980  putative penicillin amidase  25.79 
 
 
847 aa  198  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.646025  hitchhiker  0.000000127919 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1147  penicillin amidase  26.45 
 
 
813 aa  195  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1108  acylase  26.19 
 
 
813 aa  193  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.77464  normal  0.714706 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4305  penicillin amidase  26.28 
 
 
813 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4349  putative penicillin amidase  27.56 
 
 
847 aa  193  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4002  penicillin amidase  27.15 
 
 
818 aa  192  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0278  putative penicillin amidase  30.97 
 
 
837 aa  191  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23695  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0371  putative penicillin amidase  30.97 
 
 
837 aa  191  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  26.42 
 
 
788 aa  190  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6210  peptidase S45 penicillin amidase  27.75 
 
 
858 aa  190  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329512  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5071  peptidase S45, penicillin amidase  26.42 
 
 
788 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1726  penicillin acylase  30.78 
 
 
837 aa  189  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1877  putative penicillin amidase  30.78 
 
 
823 aa  188  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0887  putative penicillin amidase  30.78 
 
 
837 aa  188  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1174  putative penicillin amidase  30.78 
 
 
837 aa  188  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2152  putative penicillin amidase  30.78 
 
 
837 aa  188  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2999  peptidase S45 penicillin amidase  24.39 
 
 
807 aa  188  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19340  Peptidase S45, penicillin amidase family  29.7 
 
 
839 aa  187  7e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1137  penicillin amidase  26.84 
 
 
813 aa  185  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.416343  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4133  penicillin amidase family protein  24.31 
 
 
824 aa  184  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.699184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>