119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0600 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8724  Protein related to penicillin acylase-like protein  56.89 
 
 		 1059 aa  1025    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1853  Penicillin amidase  46.97 
 
 		 926 aa  714    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.267516 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3441  peptidase S45 penicillin amidase  55.67 
 
 		 975 aa  978    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.830206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0600  Penicillin amidase  100 
 
 		 970 aa  1979    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3212  peptidase S45 penicillin amidase  56.03 
 
 		 1103 aa  1056    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0203581  normal  0.139028 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  57.99 
 
 		 1070 aa  1019    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14090  penicilin amidase  55.92 
 
 		 951 aa  1057    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2701  peptidase S45 penicillin amidase  30.86 
 
 		 820 aa  311  2.9999999999999997e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066786  decreased coverage  0.00737149 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3142  penicillin amidase  24.02 
 
 		 812 aa  116  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  26.89 
 
 		 769 aa  104  8e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  25 
 
 		 804 aa  103  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4813  penicillin amidase  24.61 
 
 		 790 aa  103  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.911238  normal  0.40468 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  25.57 
 
 		 803 aa  100  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3360  peptidase S45 penicillin amidase  24 
 
 		 833 aa  99.8  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545108  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  25.88 
 
 		 770 aa  97.4  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0920  peptidase S45, penicillin amidase  24.38 
 
 		 825 aa  97.4  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  25.46 
 
 		 779 aa  91.3  8e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  25.67 
 
 		 783 aa  89.7  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  24.83 
 
 		 787 aa  83.2  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  24.72 
 
 		 792 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  25.13 
 
 		 813 aa  81.3  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0396  hypothetical protein  23.82 
 
 		 795 aa  80.9  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  26.15 
 
 		 819 aa  80.9  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  25.32 
 
 		 806 aa  80.9  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03980  hypothetical protein  23.66 
 
 		 795 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21490  penicilin amidase  24.26 
 
 		 841 aa  79.3  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3370  penicillin amidase  25.67 
 
 		 822 aa  76.6  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  27.29 
 
 		 864 aa  75.9  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  24.16 
 
 		 818 aa  75.1  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  25.07 
 
 		 818 aa  75.1  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5071  peptidase S45, penicillin amidase  22.01 
 
 		 788 aa  74.7  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0269  penicillin amidase  24.55 
 
 		 789 aa  74.7  0.000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.29223 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  24.29 
 
 		 810 aa  72.4  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  23.17 
 
 		 795 aa  72  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  23.65 
 
 		 821 aa  72  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5635  penicillin amidase (peptidase S45)  26.45 
 
 		 812 aa  71.6  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  24.77 
 
 		 854 aa  71.6  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0301  peptidase S45 penicillin amidase  21.58 
 
 		 787 aa  70.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.916585  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  25.35 
 
 		 795 aa  68.9  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0858  penicillin acylase  24.79 
 
 		 780 aa  68.6  0.0000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.459366  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  22.34 
 
 		 808 aa  67.8  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0772  hypothetical protein  22.2 
 
 		 810 aa  67.4  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  23.99 
 
 		 788 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  25.57 
 
 		 809 aa  67  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1553  penicillin amidase  26.11 
 
 		 774 aa  66.2  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275425  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1089  penicillin amidase family protein  23.66 
 
 		 761 aa  65.5  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5217  peptidase S45 penicillin amidase  23.8 
 
 		 787 aa  65.1  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  23.94 
 
 		 823 aa  65.5  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  24.56 
 
 		 796 aa  65.1  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3277  penicillin amidase  24.17 
 
 		 782 aa  64.7  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0898  peptidase S45 penicillin amidase  25.14 
 
 		 785 aa  63.9  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177532 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2114  penicillin acylase-like protein  25.77 
 
 		 774 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  25.51 
 
 		 827 aa  63.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1644  penicillin amidase  23.22 
 
 		 854 aa  62.8  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1877  putative penicillin amidase  33.85 
 
 		 823 aa  61.6  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1726  penicillin acylase  33.85 
 
 		 837 aa  61.6  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0887  putative penicillin amidase  33.85 
 
 		 837 aa  61.6  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1174  putative penicillin amidase  33.85 
 
 		 837 aa  61.6  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0371  putative penicillin amidase  33.85 
 
 		 837 aa  61.6  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2152  putative penicillin amidase  33.85 
 
 		 837 aa  61.6  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0278  putative penicillin amidase  33.85 
 
 		 837 aa  61.6  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23695  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4199  peptidase S45 penicillin amidase  24.95 
 
 		 809 aa  61.6  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4309  peptidase S45 penicillin amidase  24.95 
 
 		 809 aa  61.6  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2814  peptidase S45 penicillin amidase  25.68 
 
 		 870 aa  60.8  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.893736  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  23.79 
 
 		 827 aa  60.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  23.21 
 
 		 855 aa  60.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  24.32 
 
 		 817 aa  60.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2999  peptidase S45 penicillin amidase  22.43 
 
 		 807 aa  60.1  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3892  penicillin amidase  28.63 
 
 		 947 aa  59.3  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  32.28 
 
 		 796 aa  59.7  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  21.35 
 
 		 811 aa  59.7  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  32.31 
 
 		 796 aa  58.5  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  22.41 
 
 		 809 aa  58.9  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  25.59 
 
 		 796 aa  58.2  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  31.54 
 
 		 796 aa  58.2  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  31.54 
 
 		 796 aa  58.2  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  31.54 
 
 		 796 aa  58.2  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  31.54 
 
 		 796 aa  58.2  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  31.54 
 
 		 796 aa  58.2  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  25.19 
 
 		 809 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  24.2 
 
 		 819 aa  57.8  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0038  peptidase S45 penicillin amidase  23.42 
 
 		 807 aa  57.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5398  penicillin amidase  27.11 
 
 		 803 aa  57  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111495  hitchhiker  0.00200209 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  23.3 
 
 		 857 aa  56.6  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1448  penicillin amidase  23.98 
 
 		 823 aa  55.5  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0502  peptidase S45, penicillin amidase  27.91 
 
 		 795 aa  55.1  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.269122  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  30 
 
 		 796 aa  54.7  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  27 
 
 		 829 aa  54.3  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2845  putative penicillin acylase (penicillin amidase)  23.98 
 
 		 823 aa  54.3  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3996  peptidase S45 penicillin amidase  24.42 
 
 		 947 aa  53.9  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  23.77 
 
 		 821 aa  53.5  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1565  acylase precursor  35.09 
 
 		 827 aa  53.5  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0134254  normal  0.042074 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4037  peptidase S45 penicillin amidase  27.73 
 
 		 947 aa  53.5  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4754  peptidase S45 penicillin amidase  25.47 
 
 		 792 aa  53.5  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11589  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4404  peptidase S45, penicillin amidase  26.34 
 
 		 903 aa  52.8  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.676732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1495  penicillin amidase  24.12 
 
 		 821 aa  52.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.505124  normal  0.225613 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2327  penicillin amidase  27.86 
 
 		 826 aa  50.8  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00682213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2452  penicillin amidase  23.51 
 
 		 889 aa  50.8  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288116  normal  0.271218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  26.47 
 
 		 843 aa  50.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1354  penicillin amidase  30.05 
 
 		 829 aa  50.1  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342409  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>