36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2680 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0553  discoidin domain-containing protein  39.26 
 
 
1061 aa  741    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326441  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2680  coagulation factor 5/8 type domain protein  100 
 
 
1055 aa  2149    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.434706  normal  0.896202 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00883  discoidin domain protein  69.22 
 
 
1044 aa  1483    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0432744  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1547  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  59.75 
 
 
1050 aa  1296    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.425239  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1604  hypothetical protein  59.47 
 
 
1050 aa  1291    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.593088  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1702  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.9 
 
 
1038 aa  365  2e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2127  hypothetical protein  24.06 
 
 
752 aa  80.1  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.655892 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2197  hypothetical protein  24.04 
 
 
1083 aa  70.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.322196 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0789  hypothetical protein  23.19 
 
 
765 aa  70.1  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1988  hypothetical protein  22.12 
 
 
725 aa  70.5  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  36.63 
 
 
637 aa  58.9  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3212  peptidase S45 penicillin amidase  31.96 
 
 
1103 aa  58.9  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0203581  normal  0.139028 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.38 
 
 
478 aa  58.2  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  31.68 
 
 
1441 aa  56.2  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1525  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  34.29 
 
 
695 aa  55.8  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.299502  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  30.3 
 
 
722 aa  54.7  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1186  hypothetical protein  22.64 
 
 
757 aa  53.5  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  31.37 
 
 
392 aa  52.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  29.81 
 
 
1070 aa  52  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.32 
 
 
953 aa  51.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.53 
 
 
674 aa  50.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  32.23 
 
 
433 aa  50.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  32.26 
 
 
801 aa  50.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.27 
 
 
722 aa  49.3  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  29.7 
 
 
1471 aa  48.9  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6675  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.14 
 
 
929 aa  48.1  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.73 
 
 
984 aa  47  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  32.98 
 
 
987 aa  46.6  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  34.52 
 
 
850 aa  46.6  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  25.83 
 
 
999 aa  46.2  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  27.27 
 
 
1581 aa  46.2  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.76 
 
 
755 aa  46.2  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1444  extracellular solute-binding protein  34.07 
 
 
1184 aa  46.2  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.913527  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.25 
 
 
971 aa  45.4  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1517  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  26.04 
 
 
2901 aa  44.7  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302513  normal  0.43916 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.37 
 
 
962 aa  44.7  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>