40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00883 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0553  discoidin domain-containing protein  39.6 
 
 		 1061 aa  733    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326441  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2680  coagulation factor 5/8 type domain protein  69.22 
 
 		 1055 aa  1485    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.434706  normal  0.896202 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00883  discoidin domain protein  100 
 
 		 1044 aa  2125    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0432744  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1547  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  68.98 
 
 		 1050 aa  1488    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.425239  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1604  hypothetical protein  69.64 
 
 		 1050 aa  1487    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.593088  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1702  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.74 
 
 		 1038 aa  351  3e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1988  hypothetical protein  21.87 
 
 		 725 aa  88.6  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2127  hypothetical protein  24.65 
 
 		 752 aa  71.6  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.655892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0789  hypothetical protein  23.78 
 
 		 765 aa  69.7  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2197  hypothetical protein  22.19 
 
 		 1083 aa  63.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.322196 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1525  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  34.91 
 
 		 695 aa  58.5  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.299502  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3212  peptidase S45 penicillin amidase  30.48 
 
 		 1103 aa  56.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0203581  normal  0.139028 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.01 
 
 		 953 aa  55.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  33.01 
 
 		 392 aa  55.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  34.15 
 
 		 1441 aa  54.7  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  30.51 
 
 		 637 aa  53.5  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  31.06 
 
 		 850 aa  52  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.41 
 
 		 971 aa  52  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6675  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.58 
 
 		 929 aa  51.6  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  27.87 
 
 		 1070 aa  51.6  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  31.25 
 
 		 801 aa  51.6  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  26.63 
 
 		 752 aa  51.6  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  32.11 
 
 		 433 aa  50.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.43 
 
 		 478 aa  49.7  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  26.18 
 
 		 732 aa  49.7  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.55 
 
 		 1564 aa  49.7  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0649  glycoside hydrolase 15-related protein  22.48 
 
 		 610 aa  47  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.39 
 
 		 722 aa  47  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.95 
 
 		 674 aa  46.2  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  28.57 
 
 		 1581 aa  46.2  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  32.67 
 
 		 4013 aa  45.8  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  25.68 
 
 		 999 aa  45.8  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8724  Protein related to penicillin acylase-like protein  28.85 
 
 		 1059 aa  45.8  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3613  glycosyltransferase  25.56 
 
 		 2769 aa  45.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0010  glycoside hydrolase 15-related  24.82 
 
 		 627 aa  45.4  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.148558  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  29.55 
 
 		 722 aa  45.4  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.65 
 
 		 1109 aa  45.4  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6094  Glycogen debranching protein-like protein  28.47 
 
 		 815 aa  45.1  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.709243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3972  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.36 
 
 		 929 aa  44.7  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.443016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  28.97 
 
 		 1028 aa  44.7  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>