95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3613 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5841  putative carbohydrate binding  41.48 
 
 		 2730 aa  1742    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4245  glycosyltransferase 36  45.22 
 
 		 2860 aa  1322    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3489  hypothetical protein  86.71 
 
 		 2761 aa  4501    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4340  glycosyltransferase 36  45.27 
 
 		 3021 aa  1284    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0108  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  44.87 
 
 		 2864 aa  2336    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.602283  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2737  glycosyltransferase 36  44.55 
 
 		 2864 aa  2084    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2993  glycosyltransferase 36  44.36 
 
 		 1303 aa  1016    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3155  glycosyltransferase 36  45.56 
 
 		 2870 aa  2337    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0124  glycosyltransferase 36  44.97 
 
 		 2888 aa  2335    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4026  glycosyltransferase 36  48.71 
 
 		 2748 aa  1355    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4173  glycosyltransferase 36  45.23 
 
 		 2839 aa  2308    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1870  glycosyltransferase 36  44.37 
 
 		 2864 aa  2093    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3139  glycosyltransferase 36  59.7 
 
 		 2842 aa  3117    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3285  glycosyltransferase 36  41.1 
 
 		 2880 aa  1984    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4370  beta (1-->2) glucan biosynthesis protein  45.49 
 
 		 2833 aa  2283    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2577  putative carbohydrate binding  37.29 
 
 		 2823 aa  1920    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0980  putative carbohydrate binding  42.01 
 
 		 2887 aa  1359    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3379  putative carbohydrate binding  48.98 
 
 		 2758 aa  1324    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0623  glycosyltransferase 36  47.05 
 
 		 2929 aa  1374    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2133  glycosyltransferase 36  43.48 
 
 		 2881 aa  2028    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1711  glycosyltransferase 36  54.69 
 
 		 2874 aa  2720    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3888  glycosyltransferase 36  54.58 
 
 		 2875 aa  2764    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3845  glycosyltransferase 36  44.51 
 
 		 2839 aa  2272    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3296  glycosyltransferase 36  48.55 
 
 		 2747 aa  1372    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1221  glycosyltransferase 36  43.77 
 
 		 2922 aa  1410    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0111  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  45.42 
 
 		 2732 aa  2279    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.888748  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2046  putative carbohydrate binding:glycosyltransferase 36:glycosyltransferase 36 associated  46.94 
 
 		 2932 aa  1392    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1304  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  48.78 
 
 		 2859 aa  1373    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3613  glycosyltransferase  100 
 
 		 2769 aa  5519    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1183  glycosyltransferase 36  41.81 
 
 		 2905 aa  2001    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3184  glycosyltransferase 36  48.97 
 
 		 2748 aa  1317    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1675  glycosyltransferase 36  38.93 
 
 		 2786 aa  1816    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0791  putative carbohydrate binding  42.18 
 
 		 2716 aa  1119    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3667  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  40.41 
 
 		 2793 aa  1748    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1517  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  55.24 
 
 		 2901 aa  2835    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302513  normal  0.43916 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1346  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  61.16 
 
 		 2868 aa  3221    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2531  glycosyltransferase 36  59.96 
 
 		 2845 aa  3189    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5267  glycosyltransferase 36  54.1 
 
 		 2868 aa  2738    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2188  glycosyltransferase 36  45.82 
 
 		 2916 aa  1373    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3706  glycosyltransferase 36  42.9 
 
 		 2453 aa  726    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5592  glycosyltransferase 36  54.27 
 
 		 2831 aa  2707    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4755  putative carbohydrate binding  42.53 
 
 		 2779 aa  1919    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3093  glycosyltransferase 36  39.68 
 
 		 2731 aa  1702    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1306  cyclic beta 1-2 glucan synthase  41.15 
 
 		 2884 aa  2151    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3648  glycosyltransferase 36 associated  51.6 
 
 		 624 aa  586  1.0000000000000001e-165  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0091  glycosyltransferase 36  37.38 
 
 		 849 aa  484  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00140222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0953  glycosyltransferase 36  34.63 
 
 		 786 aa  468  9.999999999999999e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.862285  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1364  glycosyltransferase 36  31.39 
 
 		 785 aa  307  2.0000000000000002e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19760  glycosyltransferase 36  28.33 
 
 		 784 aa  301  2e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3274  glycosyltransferase 36  28.66 
 
 		 822 aa  299  5e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0459  glycosyltransferase 36  29.25 
 
 		 790 aa  299  5e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0148  glycosyltransferase 36  28.89 
 
 		 822 aa  296  3e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0233043 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0141  cellulose degradation product phosphorylase  27.55 
 
 		 801 aa  296  5e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0968  glycosyltransferase 36  27.48 
 
 		 813 aa  294  2e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.547767  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0951  glycosyltransferase 36  27.48 
 
 		 813 aa  294  2e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0220582  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1053  glycosyltransferase 36  28.52 
 
 		 829 aa  293  5.0000000000000004e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.753195  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002578  chitobiose phosphorylase  27.11 
 
 		 802 aa  290  4e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1363  glycosyltransferase 36  28.57 
 
 		 815 aa  285  8.000000000000001e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03431  hypothetical protein  27.16 
 
 		 802 aa  284  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2584  chitobiose phosphorylase (glycosyl transferase)  26.92 
 
 		 762 aa  283  3e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0275  cellobiose phosphorylase  27.78 
 
 		 811 aa  281  9e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0460  glycosyltransferase 36  27.93 
 
 		 811 aa  281  9e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2312  glycosyltransferase 36  29.42 
 
 		 797 aa  281  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26995 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1439  glycosyltransferase 36  27.44 
 
 		 784 aa  278  1.0000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1318  cellobiose phosphorylase  26.52 
 
 		 811 aa  272  8.999999999999999e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0462617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2310  glycosyltransferase 36  29.14 
 
 		 794 aa  267  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.587423  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2616  glycosyltransferase 36  27.85 
 
 		 827 aa  267  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.294292  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19750  glycosyltransferase 36  26.25 
 
 		 819 aa  266  3e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1745  glycosyltransferase 36  26.07 
 
 		 815 aa  254  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.414629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0649  glycosyl transferase 36  26.52 
 
 		 811 aa  254  2e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0225062  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0430  glycosyltransferase 36  26.56 
 
 		 831 aa  252  7e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.948087  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0648  glycosyl transferase 36  27 
 
 		 809 aa  249  4e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000072507  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3854  glycosyltransferase 36  24.94 
 
 		 797 aa  249  4e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1929  glycosyltransferase 36  26.28 
 
 		 797 aa  249  6e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2109  glycosyltransferase 36  25.5 
 
 		 811 aa  241  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1744  glycosyltransferase 36  27.22 
 
 		 823 aa  239  7e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2354  glycosyltransferase 36  25.22 
 
 		 796 aa  224  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3412  glycosyltransferase 36  25.65 
 
 		 824 aa  213  4e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0906  NdvB protein  26.27 
 
 		 788 aa  201  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000016442 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02749  NdvB protein  28.43 
 
 		 801 aa  192  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3696  cyclic beta 1-2 glucan synthetase domain-containing protein  24.59 
 
 		 802 aa  167  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0510  hypothetical protein  27.55 
 
 		 536 aa  117  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3150  hypothetical protein  25.93 
 
 		 541 aa  103  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30460  hypothetical protein  26.52 
 
 		 754 aa  98.2  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0534112  normal  0.427386 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2989  glycosyltransferase 36  21.38 
 
 		 984 aa  82.4  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.684465  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3575  hypothetical protein  39.69 
 
 		 536 aa  75.9  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0524  hypothetical protein  23.28 
 
 		 459 aa  74.3  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00628478  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0585  hypothetical protein  23.28 
 
 		 459 aa  74.3  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0392402  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1072  hypothetical protein  24.26 
 
 		 459 aa  73.2  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1586  hypothetical protein  24.72 
 
 		 1136 aa  65.9  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.707632  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5665  hypothetical protein  23.46 
 
 		 1100 aa  65.9  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06430  cellobiose phosphorylase  24.49 
 
 		 1145 aa  53.5  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6606  hypothetical protein  23.08 
 
 		 1094 aa  50.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814353 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4220  hypothetical protein  23.8 
 
 		 1169 aa  49.7  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2456  hypothetical protein  28.24 
 
 		 1076 aa  47.4  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>