108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1480 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  57.22 
 
 
962 aa  649    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  100 
 
 
722 aa  1452    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  63.93 
 
 
850 aa  884    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1518  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  55.94 
 
 
734 aa  598  1e-170  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000763318  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  46.63 
 
 
755 aa  597  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0398  secreted protein  49.83 
 
 
640 aa  539  9.999999999999999e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1676  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  48.66 
 
 
648 aa  540  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  49.19 
 
 
732 aa  526  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  48.36 
 
 
918 aa  509  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3740  secreted protein  48.54 
 
 
640 aa  499  1e-140  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253884  hitchhiker  0.00713649 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2395  Fibronectin type III domain protein  48.44 
 
 
844 aa  489  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527977  decreased coverage  0.000101055 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1669  secreted protein  46.77 
 
 
622 aa  482  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180028  normal  0.687449 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1775  S-layer domain-containing protein  44.31 
 
 
2117 aa  480  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.83614  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1385  secreted protein  46.55 
 
 
627 aa  482  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.195328  decreased coverage  0.000365007 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0054  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  46.32 
 
 
537 aa  471  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.53 
 
 
940 aa  455  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6657  secreted protein  46.19 
 
 
645 aa  451  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.214737 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1718  secreted protein  48.61 
 
 
562 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.644639  normal  0.917754 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2668  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  43.74 
 
 
652 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0200  hypothetical protein  32.65 
 
 
726 aa  282  1e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5709  hypothetical protein  34.89 
 
 
722 aa  279  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  53.85 
 
 
581 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  60 
 
 
433 aa  161  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  57.59 
 
 
578 aa  157  6e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  56.25 
 
 
987 aa  157  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  60.74 
 
 
588 aa  154  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  53.55 
 
 
674 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  49.7 
 
 
571 aa  146  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  53.24 
 
 
1007 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3723  hypothetical protein  57.43 
 
 
449 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  56.1 
 
 
756 aa  138  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  60.74 
 
 
999 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  51.33 
 
 
1158 aa  135  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  59.68 
 
 
639 aa  135  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  45.68 
 
 
752 aa  130  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  55.65 
 
 
815 aa  128  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  50.39 
 
 
953 aa  124  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  49.61 
 
 
392 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  53.72 
 
 
819 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  48.82 
 
 
1441 aa  120  9e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.78 
 
 
971 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  48 
 
 
1070 aa  119  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.6 
 
 
1321 aa  119  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  45.86 
 
 
1338 aa  116  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6675  coagulation factor 5/8 type domain protein  51.22 
 
 
929 aa  116  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  43.38 
 
 
1581 aa  114  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  44.63 
 
 
637 aa  114  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.6 
 
 
984 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3212  peptidase S45 penicillin amidase  46.97 
 
 
1103 aa  112  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0203581  normal  0.139028 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  37.35 
 
 
732 aa  111  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2893  Alkaline phosphatase  48.09 
 
 
452 aa  110  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21156  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8724  Protein related to penicillin acylase-like protein  51.2 
 
 
1059 aa  110  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4824  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  41.07 
 
 
1117 aa  110  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.90345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  45.39 
 
 
801 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  48.8 
 
 
578 aa  109  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  38.97 
 
 
558 aa  107  8e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  52.34 
 
 
1564 aa  103  9e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3544  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  43.15 
 
 
471 aa  102  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  46.21 
 
 
1332 aa  101  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3281  coagulation factor 5/8 type-like  48.12 
 
 
487 aa  96.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5087  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  48.12 
 
 
487 aa  96.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.82 
 
 
729 aa  96.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  42.31 
 
 
4013 aa  97.1  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5195  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  47.37 
 
 
480 aa  96.3  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  36.97 
 
 
1059 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4855  coagulation factor 5/8 type domain protein  46.04 
 
 
472 aa  92  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3778  coagulation factor 5/8 type domain protein  46.04 
 
 
472 aa  92  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0933074  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0569  putative secreted protein  44.68 
 
 
470 aa  91.3  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  41.53 
 
 
879 aa  90.9  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.01 
 
 
915 aa  90.1  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5024  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  44.14 
 
 
470 aa  89.4  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.85 
 
 
1362 aa  89.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1525  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  41.96 
 
 
695 aa  88.6  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.299502  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4499  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  44.14 
 
 
470 aa  88.2  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  43.18 
 
 
1028 aa  87.4  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2796  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.81 
 
 
1139 aa  85.9  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.151007  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03685  signal peptide protein  46.21 
 
 
475 aa  85.1  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal  0.498425 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  36.6 
 
 
1471 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4863  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  52.11 
 
 
112 aa  80.9  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483102  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.52 
 
 
820 aa  77.8  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  37.1 
 
 
722 aa  77.8  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.48 
 
 
478 aa  74.3  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4979  coagulation factor 5/8 type domain protein  48.81 
 
 
1060 aa  72.8  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00350881  normal  0.0761827 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1444  extracellular solute-binding protein  37.59 
 
 
1184 aa  70.9  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.913527  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1702  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.48 
 
 
1038 aa  70.1  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3972  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.76 
 
 
929 aa  66.6  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.443016  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  36.89 
 
 
986 aa  63.5  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  36.43 
 
 
644 aa  62.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0553  discoidin domain-containing protein  32.8 
 
 
1061 aa  61.6  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326441  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  33.08 
 
 
1439 aa  58.9  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1157  hypothetical protein  50 
 
 
151 aa  57.4  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7141  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.09 
 
 
538 aa  54.3  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174227  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1751  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  33.56 
 
 
1088 aa  52.4  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.865218  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  33.02 
 
 
912 aa  52  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2680  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.27 
 
 
1055 aa  49.7  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.434706  normal  0.896202 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2733  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.23 
 
 
778 aa  48.5  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3272  hypothetical protein  32.46 
 
 
552 aa  47.8  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000109169  hitchhiker  0.00653931 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0034  hypothetical protein  33.04 
 
 
768 aa  47.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00883  discoidin domain protein  30.39 
 
 
1044 aa  47  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0432744  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  30.43 
 
 
899 aa  46.6  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>