30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2733 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2733  coagulation factor 5/8 type domain protein  100 
 
 
778 aa  1616    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1181  hypothetical protein  32.13 
 
 
447 aa  204  6e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3110  hypothetical protein  31.07 
 
 
452 aa  191  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2732  methyltransferase FkbM family  42.96 
 
 
361 aa  109  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2886  hypothetical protein  30.18 
 
 
258 aa  99.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.86298  hitchhiker  0.00766026 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0639  hypothetical protein  26.64 
 
 
249 aa  85.9  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0386  fucolectin tachylectin-4 pentraxin-1  34.76 
 
 
465 aa  85.9  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3709  hypothetical protein  27.05 
 
 
818 aa  75.9  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.156868 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2877  hypothetical protein  27.5 
 
 
317 aa  72.4  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4517  hypothetical protein  31.66 
 
 
461 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1766  hypothetical protein  26.03 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0265564  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3849  hypothetical protein  33.57 
 
 
509 aa  67  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.430064 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0983  FkbM family methyltransferase  34.48 
 
 
416 aa  66.6  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171365  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1182  hypothetical protein  27.27 
 
 
414 aa  64.7  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1428  hypothetical protein  27.84 
 
 
206 aa  62.4  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.311882  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6675  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.83 
 
 
929 aa  58.2  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4476  Alpha-L-fucosidase  29.86 
 
 
731 aa  55.1  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766125  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  33.33 
 
 
433 aa  53.9  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3212  coagulation factor 5/8 type-like  34.31 
 
 
425 aa  51.6  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  30.77 
 
 
999 aa  50.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_28503  predicted protein  29.08 
 
 
345 aa  49.3  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.35 
 
 
674 aa  48.9  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.23 
 
 
722 aa  48.5  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1997  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.97 
 
 
541 aa  48.1  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.95 
 
 
858 aa  47  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_93976  hypothetical protein  28.37 
 
 
323 aa  46.2  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  28.57 
 
 
1441 aa  46.6  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2466  hypothetical protein  27.65 
 
 
940 aa  45.8  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.17 
 
 
1158 aa  45.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.4 
 
 
962 aa  44.3  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>