119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7479 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 		 918 aa  1800    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  57.22 
 
 		 732 aa  620  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  51.89 
 
 		 962 aa  602  1.0000000000000001e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  51.28 
 
 		 850 aa  554  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1518  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  51.46 
 
 		 734 aa  550  1e-155  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000763318  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  48.36 
 
 		 722 aa  483  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1676  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  44.54 
 
 		 648 aa  486  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1385  secreted protein  46.62 
 
 		 627 aa  476  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.195328  decreased coverage  0.000365007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.66 
 
 		 755 aa  469  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6657  secreted protein  45.12 
 
 		 645 aa  456  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.214737 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1718  secreted protein  47.93 
 
 		 562 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.644639  normal  0.917754 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1775  S-layer domain-containing protein  43.92 
 
 		 2117 aa  449  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.83614  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0054  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  43.13 
 
 		 537 aa  444  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0398  secreted protein  44.79 
 
 		 640 aa  444  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2395  Fibronectin type III domain protein  45.41 
 
 		 844 aa  437  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527977  decreased coverage  0.000101055 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3740  secreted protein  42.91 
 
 		 640 aa  411  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253884  hitchhiker  0.00713649 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1669  secreted protein  42.03 
 
 		 622 aa  404  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180028  normal  0.687449 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  59.78 
 
 		 1338 aa  382  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  62.73 
 
 		 1321 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2668  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.57 
 
 		 652 aa  374  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0200  hypothetical protein  35.33 
 
 		 726 aa  309  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5709  hypothetical protein  35.51 
 
 		 722 aa  298  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  63.64 
 
 		 933 aa  233  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1779  Carbohydrate binding family 6  32.69 
 
 		 526 aa  171  7e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00214562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  38.51 
 
 		 610 aa  169  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  33.7 
 
 		 673 aa  158  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  36.2 
 
 		 954 aa  158  4e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  34.38 
 
 		 982 aa  156  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  35.1 
 
 		 1262 aa  156  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  34.44 
 
 		 569 aa  154  5.9999999999999996e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4512  Carbohydrate binding family 6  34.32 
 
 		 1391 aa  151  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472745 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  36.21 
 
 		 1707 aa  149  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  35.4 
 
 		 1167 aa  149  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  33.43 
 
 		 1035 aa  148  5e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  31.98 
 
 		 1799 aa  144  6e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  33.03 
 
 		 630 aa  142  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0431  Carbohydrate binding family 6  29.53 
 
 		 966 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.174739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  30.99 
 
 		 930 aa  127  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  31.4 
 
 		 1234 aa  125  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  41.71 
 
 		 801 aa  119  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  43.92 
 
 		 819 aa  117  8.999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  43.87 
 
 		 870 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  45.58 
 
 		 1356 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  44.87 
 
 		 802 aa  114  6e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  30.69 
 
 		 863 aa  114  7.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  41.61 
 
 		 1295 aa  114  7.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  43.4 
 
 		 786 aa  114  7.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  42.58 
 
 		 524 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  45.52 
 
 		 845 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  44.74 
 
 		 823 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3260  hypothetical protein  39.56 
 
 		 500 aa  111  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293464 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2832  hypothetical protein  32.7 
 
 		 877 aa  110  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0897926  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  40.4 
 
 		 719 aa  109  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  43.33 
 
 		 840 aa  109  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  41.55 
 
 		 948 aa  108  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  32.89 
 
 		 855 aa  107  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  42.76 
 
 		 1380 aa  106  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  41.03 
 
 		 1132 aa  105  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  40.74 
 
 		 777 aa  104  7e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  33.91 
 
 		 581 aa  104  7e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  42.38 
 
 		 1732 aa  101  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  40.54 
 
 		 726 aa  100  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  40.13 
 
 		 3295 aa  98.6  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  37.87 
 
 		 705 aa  97.1  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  41.89 
 
 		 550 aa  97.1  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  41.72 
 
 		 2554 aa  97.1  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  40 
 
 		 798 aa  96.3  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  37.1 
 
 		 869 aa  95.9  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  35.53 
 
 		 972 aa  95.9  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  39.61 
 
 		 468 aa  95.5  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  30 
 
 		 1004 aa  95.1  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  32.38 
 
 		 1024 aa  94.4  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  36.31 
 
 		 735 aa  92.4  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  45.95 
 
 		 461 aa  90.9  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  39.04 
 
 		 749 aa  90.9  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  31.72 
 
 		 875 aa  89.7  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  39.47 
 
 		 522 aa  88.6  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  46.43 
 
 		 536 aa  89  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  25.57 
 
 		 1091 aa  88.6  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  40.32 
 
 		 639 aa  88.2  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  32.97 
 
 		 627 aa  88.2  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  42.98 
 
 		 389 aa  85.5  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  36.31 
 
 		 919 aa  85.1  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  33.77 
 
 		 739 aa  82.8  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  43.33 
 
 		 383 aa  82.4  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  34.93 
 
 		 853 aa  81.3  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  43.1 
 
 		 884 aa  81.3  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  42.24 
 
 		 957 aa  79  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  36.17 
 
 		 503 aa  77.4  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  35.08 
 
 		 541 aa  76.3  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  36.71 
 
 		 1387 aa  75.9  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3927  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  33.91 
 
 		 465 aa  70.9  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4149  glycoside hydrolase family 5  28.41 
 
 		 590 aa  69.7  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.533031  normal  0.39445 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  36.48 
 
 		 627 aa  68.2  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1175  agarase  27.9 
 
 		 598 aa  66.6  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000232044  unclonable  0.000000011081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3707  Carbohydrate binding family 6  32.34 
 
 		 1000 aa  64.7  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176968  normal  0.212982 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3237  cellulase  34.81 
 
 		 630 aa  62  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000087335  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3238  hypothetical protein  33.76 
 
 		 652 aa  58.9  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000359216  normal  0.364609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5224  Carbohydrate binding family 6  38.94 
 
 		 566 aa  58.9  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3070  hypothetical protein  27.6 
 
 		 233 aa  56.2  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>