46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3070 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3070  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  484  1e-136  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  38.57 
 
 		 845 aa  68.6  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  30.69 
 
 		 1799 aa  67.4  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  35.07 
 
 		 2554 aa  66.2  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1779  Carbohydrate binding family 6  33.33 
 
 		 526 aa  65.9  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00214562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  35.71 
 
 		 1732 aa  64.3  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  35.61 
 
 		 1380 aa  64.7  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  35.76 
 
 		 870 aa  65.1  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  28.28 
 
 		 801 aa  63.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  36.36 
 
 		 1356 aa  63.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  33.58 
 
 		 3295 aa  62.8  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  27.08 
 
 		 524 aa  62.8  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  34.75 
 
 		 840 aa  62.8  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  34.27 
 
 		 823 aa  62.4  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  34.51 
 
 		 777 aa  60.8  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  35.61 
 
 		 819 aa  60.1  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  34.09 
 
 		 802 aa  58.9  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  28.21 
 
 		 1295 aa  58.5  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  30.89 
 
 		 1035 aa  57.8  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  28 
 
 		 1338 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  27.6 
 
 		 918 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  35.9 
 
 		 786 aa  55.8  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  32.52 
 
 		 1234 aa  54.3  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  30.23 
 
 		 581 aa  53.5  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  32 
 
 		 1262 aa  53.5  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  32 
 
 		 627 aa  53.1  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  30.23 
 
 		 522 aa  52.4  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  31.82 
 
 		 719 aa  52  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  30 
 
 		 468 aa  52  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  32.26 
 
 		 735 aa  52  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.62 
 
 		 1321 aa  52  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  35.64 
 
 		 954 aa  51.2  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.5 
 
 		 933 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2052  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.55 
 
 		 491 aa  49.3  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  26.29 
 
 		 630 aa  48.9  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  29.75 
 
 		 930 aa  48.9  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  26.49 
 
 		 739 aa  48.1  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  28.69 
 
 		 1132 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  24.86 
 
 		 948 aa  47  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  25.41 
 
 		 798 aa  46.2  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0431  Carbohydrate binding family 6  30.51 
 
 		 966 aa  45.4  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.174739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  57.58 
 
 		 919 aa  44.7  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  23.94 
 
 		 855 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  29.6 
 
 		 749 aa  42.4  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  25.23 
 
 		 705 aa  42  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  26.29 
 
 		 982 aa  42  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>