132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4149 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4149  glycoside hydrolase family 5  100 
 
 		 590 aa  1208    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.533031  normal  0.39445 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  31.84 
 
 		 601 aa  248  3e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4045  glycoside hydrolase family 5  31.7 
 
 		 573 aa  237  6e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  35.73 
 
 		 1115 aa  223  9e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  26.01 
 
 		 863 aa  174  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2693  glycoside hydrolase family protein  26.87 
 
 		 489 aa  156  9e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0943  glycoside hydrolase family protein  27.09 
 
 		 493 aa  150  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07770  conserved hypothetical protein  28.16 
 
 		 847 aa  126  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.622601  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2319  family 5 glycoside hydrolase  24.79 
 
 		 456 aa  124  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182404  normal  0.298559 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02120  expressed protein  23.73 
 
 		 470 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66312  Endo-1,4-beta-glucanase  28.75 
 
 		 481 aa  114  4.0000000000000004e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0233843 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39160  Endoglucanase C (EGC) (Endo-1,4-beta-glucanase) (Cellulase C)  26.88 
 
 		 483 aa  112  2.0000000000000002e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.151498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39320  endoglucanase family 5 glycoside hydrolase  27.41 
 
 		 481 aa  110  5e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  28.97 
 
 		 853 aa  107  7e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  29.92 
 
 		 869 aa  99  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  26.35 
 
 		 673 aa  91.7  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  25.13 
 
 		 705 aa  89.7  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  25.37 
 
 		 468 aa  87.4  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  26.91 
 
 		 343 aa  84  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0862  Glucan 1,3-beta-glucosidase  26.17 
 
 		 368 aa  82.8  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168056  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2490  2-isopropylmalate synthase  34.9 
 
 		 566 aa  79  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07130  glucan 1,3-beta-glucosidase  25.49 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.486796  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  28.57 
 
 		 982 aa  74.3  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  32.47 
 
 		 522 aa  73.9  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  32.9 
 
 		 581 aa  70.5  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  22.79 
 
 		 551 aa  70.5  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  33.33 
 
 		 1234 aa  70.1  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  28.41 
 
 		 918 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  33.54 
 
 		 1707 aa  68.9  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  34.44 
 
 		 1024 aa  68.2  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  28.98 
 
 		 468 aa  68.2  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04052  beta-1,3-exoglucosidase (Eurofung)  25.2 
 
 		 486 aa  67.4  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.137005  normal  0.167106 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  32.69 
 
 		 855 aa  67.4  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  24.34 
 
 		 332 aa  66.2  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  32.92 
 
 		 749 aa  66.6  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  34.38 
 
 		 1799 aa  66.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1779  Carbohydrate binding family 6  33.33 
 
 		 526 aa  65.1  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00214562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  28.22 
 
 		 930 aa  64.7  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0847  endoglucanase  26.49 
 
 		 382 aa  64.7  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  33.93 
 
 		 948 aa  64.3  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6252  Cellulase  23.2 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78873  Glucan 1,3-beta-glucosidase precursor (Exo-1,3-beta-glucanase)  26.64 
 
 		 438 aa  62.4  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3260  hypothetical protein  30.83 
 
 		 500 aa  62  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293464 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  30.3 
 
 		 1167 aa  61.6  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1290  endoglucanase  27.17 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00901224  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  34.18 
 
 		 1262 aa  60.8  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0888  glycoside hydrolase family protein  28.24 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  31.12 
 
 		 627 aa  60.5  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  28.48 
 
 		 1004 aa  59.7  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  33.12 
 
 		 1035 aa  59.7  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02900  cytoplasm protein, putative  22.85 
 
 		 498 aa  58.9  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  27.95 
 
 		 630 aa  58.9  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  29.05 
 
 		 550 aa  59.3  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  20.62 
 
 		 335 aa  59.3  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0234  glycoside hydrolase family 5  23.86 
 
 		 328 aa  58.9  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  31.25 
 
 		 954 aa  59.7  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  32.91 
 
 		 819 aa  59.3  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  31.87 
 
 		 840 aa  58.2  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  32.91 
 
 		 870 aa  58.2  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  33.1 
 
 		 845 aa  57.8  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  31.87 
 
 		 777 aa  57.8  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1511  glycoside hydrolase family protein  24.74 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  28.82 
 
 		 1295 aa  57.4  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  27.98 
 
 		 801 aa  57.4  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  31.65 
 
 		 1356 aa  57.4  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1073  glycoside hydrolase family protein  22.79 
 
 		 329 aa  56.6  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  33.14 
 
 		 919 aa  57  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  29.45 
 
 		 735 aa  57  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03150  cellulase, putative  24.87 
 
 		 431 aa  56.2  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1572  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  21.85 
 
 		 365 aa  56.2  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.16 
 
 		 933 aa  56.2  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  26.22 
 
 		 524 aa  55.5  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0987  glycoside hydrolase family protein  24.24 
 
 		 402 aa  55.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0923078  hitchhiker  0.00882175 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  29.95 
 
 		 798 aa  55.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  27.33 
 
 		 1387 aa  55.1  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  22.76 
 
 		 501 aa  55.1  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  34.01 
 
 		 823 aa  55.1  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  32.16 
 
 		 786 aa  54.7  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1471  glycoside hydrolase family protein  23.79 
 
 		 561 aa  53.9  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  24.82 
 
 		 525 aa  53.9  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  31.65 
 
 		 1380 aa  53.1  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  29.56 
 
 		 739 aa  53.5  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03300  hypothetical protein  22.29 
 
 		 526 aa  52.4  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.600103  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3317  glycoside hydrolase family protein  25.37 
 
 		 357 aa  52.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  32.64 
 
 		 802 aa  52.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2195  glycoside hydrolase family 5  27.4 
 
 		 337 aa  52  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0671  glycoside hydrolase family 5  24.72 
 
 		 331 aa  52  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3539  glycosidase, family 5  25 
 
 		 422 aa  52  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0431  Carbohydrate binding family 6  31.97 
 
 		 966 aa  52.4  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.174739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  22.27 
 
 		 584 aa  52  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  36.84 
 
 		 1132 aa  51.6  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03777  Endo-beta-1,6-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B6Q3]  20.7 
 
 		 409 aa  51.2  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  35.05 
 
 		 639 aa  51.2  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0077  glycoside hydrolase family 5  26.47 
 
 		 400 aa  50.4  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  22.74 
 
 		 312 aa  50.4  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0289  glycoside hydrolase family 5  24.46 
 
 		 378 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  28.16 
 
 		 1338 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  21.69 
 
 		 335 aa  49.7  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1099  glycoside hydrolase family 5  21.45 
 
 		 475 aa  49.7  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  31.47 
 
 		 2554 aa  49.3  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>