102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3260 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3260  hypothetical protein  100 
 
 		 500 aa  1035    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293464 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0695  hypothetical protein  54.09 
 
 		 313 aa  285  1.0000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.826864  unclonable  0.00000000538974 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  56.34 
 
 		 550 aa  161  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  54.74 
 
 		 1024 aa  154  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  44.51 
 
 		 1167 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  40.8 
 
 		 1707 aa  124  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  42.31 
 
 		 918 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  39.88 
 
 		 569 aa  108  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  41.5 
 
 		 801 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  43.57 
 
 		 948 aa  103  9e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  43.24 
 
 		 823 aa  103  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  34.76 
 
 		 982 aa  102  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  42.36 
 
 		 1356 aa  100  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  41.67 
 
 		 819 aa  99.8  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  41.89 
 
 		 719 aa  98.6  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  41.38 
 
 		 870 aa  99.4  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.51 
 
 		 933 aa  98.2  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  40.65 
 
 		 802 aa  97.8  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  42.47 
 
 		 1380 aa  95.5  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  39.58 
 
 		 845 aa  94.7  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  46.43 
 
 		 673 aa  94  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  34.84 
 
 		 524 aa  93.2  9e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  39.31 
 
 		 1004 aa  93.2  9e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  35.76 
 
 		 630 aa  91.7  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  38.36 
 
 		 1132 aa  91.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  37.96 
 
 		 863 aa  90.5  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  37.76 
 
 		 639 aa  90.5  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  37.42 
 
 		 786 aa  89.4  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  40.28 
 
 		 610 aa  89  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  38.51 
 
 		 777 aa  88.2  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  32.72 
 
 		 1234 aa  87.8  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  38.1 
 
 		 522 aa  87.8  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  38.16 
 
 		 972 aa  87  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  32.8 
 
 		 627 aa  87  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  40.28 
 
 		 840 aa  87  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  33.73 
 
 		 855 aa  86.7  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  36.55 
 
 		 726 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1779  Carbohydrate binding family 6  34.75 
 
 		 526 aa  85.1  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00214562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  44.55 
 
 		 461 aa  84.7  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  36.6 
 
 		 954 aa  84  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  39.06 
 
 		 705 aa  82  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  35.62 
 
 		 1799 aa  81.6  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2832  hypothetical protein  42.06 
 
 		 877 aa  81.3  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0897926  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  38.97 
 
 		 536 aa  80.9  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  32.08 
 
 		 468 aa  80.5  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  28.97 
 
 		 1262 aa  80.5  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  38.06 
 
 		 581 aa  80.5  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  35.53 
 
 		 919 aa  80.5  0.00000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4512  Carbohydrate binding family 6  33.11 
 
 		 1391 aa  80.1  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472745 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  31.33 
 
 		 930 aa  79.7  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  38.56 
 
 		 2554 aa  79.7  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  32.69 
 
 		 798 aa  79  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  38.89 
 
 		 1732 aa  79.3  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  33.33 
 
 		 1338 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  34.33 
 
 		 869 aa  78.2  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  38.39 
 
 		 1295 aa  78.6  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.05 
 
 		 1321 aa  78.2  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  38.19 
 
 		 735 aa  76.6  0.0000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0431  Carbohydrate binding family 6  31.9 
 
 		 966 aa  76.3  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.174739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  38.16 
 
 		 3295 aa  76.3  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  31.61 
 
 		 739 aa  74.3  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  37.18 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  36.11 
 
 		 749 aa  72.4  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  35.1 
 
 		 884 aa  71.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1445  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  32.53 
 
 		 473 aa  70.9  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  35.04 
 
 		 853 aa  70.5  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2920  hypothetical protein  34.04 
 
 		 551 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000907563  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3927  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  31.03 
 
 		 465 aa  69.7  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  37.76 
 
 		 541 aa  69.7  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  26.67 
 
 		 503 aa  69.3  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  35.48 
 
 		 1035 aa  68.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  30.56 
 
 		 1387 aa  68.2  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  35.21 
 
 		 957 aa  67.8  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  30.77 
 
 		 875 aa  67  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  28.33 
 
 		 1091 aa  67  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  34.78 
 
 		 627 aa  65.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2052  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.45 
 
 		 491 aa  64.7  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5224  Carbohydrate binding family 6  36.13 
 
 		 566 aa  63.9  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4149  glycoside hydrolase family 5  30.83 
 
 		 590 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.533031  normal  0.39445 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  36.36 
 
 		 383 aa  58.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3238  hypothetical protein  34.23 
 
 		 652 aa  55.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000359216  normal  0.364609 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0242  Band 7 protein  31.21 
 
 		 681 aa  55.1  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  28.68 
 
 		 470 aa  53.9  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  29.75 
 
 		 951 aa  53.5  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3237  cellulase  35.29 
 
 		 630 aa  52.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000087335  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3239  cellulase  32.88 
 
 		 638 aa  52.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00277111  normal  0.266356 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  29.37 
 
 		 490 aa  52.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  30.83 
 
 		 469 aa  51.2  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1911  carbohydrate-binding family 6 protein  25.74 
 
 		 1290 aa  50.8  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.374482  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  30 
 
 		 509 aa  50.4  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  32.5 
 
 		 912 aa  49.3  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  31.48 
 
 		 501 aa  49.3  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  31.25 
 
 		 965 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  27.94 
 
 		 524 aa  48.9  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  28.57 
 
 		 679 aa  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  28.76 
 
 		 928 aa  48.5  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  32.17 
 
 		 464 aa  47.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  32.73 
 
 		 618 aa  47  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  31.11 
 
 		 1444 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  36.84 
 
 		 1441 aa  44.3  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>