100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2137 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 		 1262 aa  2566    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  40.38 
 
 		 1799 aa  632  1e-179  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1542  hypothetical protein  45.83 
 
 		 458 aa  354  7e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.218031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  46.11 
 
 		 1234 aa  289  2e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  41.11 
 
 		 1035 aa  288  4e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0130  hypothetical protein  38.91 
 
 		 568 aa  272  2.9999999999999997e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34689 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0105  Parallel beta-helix repeat protein  37.53 
 
 		 609 aa  263  1e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.28403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  35.9 
 
 		 958 aa  263  2e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0129  hypothetical protein  37.02 
 
 		 587 aa  251  6e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  37.83 
 
 		 930 aa  247  9e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  37.09 
 
 		 869 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  40.52 
 
 		 954 aa  215  3.9999999999999995e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0677  hypothetical protein  34.98 
 
 		 486 aa  200  1.0000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0395736  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0431  Carbohydrate binding family 6  34.9 
 
 		 966 aa  194  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.174739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0673  APHP domain-containing protein  34.18 
 
 		 857 aa  189  4e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0672  hypothetical protein  31.32 
 
 		 550 aa  187  8e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.165731  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0103  hypothetical protein  33.84 
 
 		 684 aa  176  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1779  Carbohydrate binding family 6  33.33 
 
 		 526 aa  161  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00214562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  45.64 
 
 		 522 aa  159  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  35.03 
 
 		 918 aa  157  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  53.42 
 
 		 823 aa  152  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  28.48 
 
 		 916 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  32.51 
 
 		 1338 aa  146  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  52.67 
 
 		 840 aa  146  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.06 
 
 		 1321 aa  145  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  52.82 
 
 		 845 aa  145  7e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  54.48 
 
 		 777 aa  144  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  52.05 
 
 		 870 aa  144  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  45.05 
 
 		 802 aa  144  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  47.65 
 
 		 627 aa  144  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  29.36 
 
 		 1167 aa  143  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  51.37 
 
 		 819 aa  141  7e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  50.67 
 
 		 1732 aa  141  7.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  50 
 
 		 2554 aa  140  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  48.17 
 
 		 719 aa  140  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  51.41 
 
 		 1380 aa  140  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  50.68 
 
 		 1356 aa  140  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  49.65 
 
 		 735 aa  138  8e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  45.14 
 
 		 468 aa  137  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  40.86 
 
 		 581 aa  134  7.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  32.94 
 
 		 1707 aa  134  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  48 
 
 		 3295 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  43.46 
 
 		 786 aa  132  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  43.45 
 
 		 875 aa  132  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  45.35 
 
 		 749 aa  129  5e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  46.5 
 
 		 801 aa  124  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  41.15 
 
 		 919 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1386  hypothetical protein  29.62 
 
 		 494 aa  122  6e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.556451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  45.45 
 
 		 630 aa  115  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  28.96 
 
 		 982 aa  114  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  30.21 
 
 		 569 aa  114  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.27 
 
 		 933 aa  110  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  31.34 
 
 		 1024 aa  105  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4512  Carbohydrate binding family 6  23.05 
 
 		 1391 aa  102  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472745 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  40 
 
 		 1387 aa  101  8e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  42.19 
 
 		 855 aa  100  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  38.07 
 
 		 948 aa  99.8  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  38.41 
 
 		 739 aa  97.8  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  27.27 
 
 		 863 aa  96.7  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  39.41 
 
 		 1132 aa  96.3  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  34.95 
 
 		 1295 aa  95.5  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  36.36 
 
 		 550 aa  94.7  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  42.13 
 
 		 627 aa  94.4  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  40.27 
 
 		 798 aa  94.7  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  31.34 
 
 		 673 aa  91.3  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  28.47 
 
 		 610 aa  88.2  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  38.35 
 
 		 524 aa  86.7  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  35.03 
 
 		 1004 aa  86.7  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3260  hypothetical protein  28.97 
 
 		 500 aa  80.5  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293464 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2832  hypothetical protein  27.9 
 
 		 877 aa  78.6  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0897926  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  41.26 
 
 		 639 aa  78.6  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0686  periplasmic copper-binding  32.64 
 
 		 461 aa  75.5  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  36.24 
 
 		 972 aa  70.5  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0242  Band 7 protein  34.01 
 
 		 681 aa  68.2  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2052  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.26 
 
 		 491 aa  64.7  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  35.78 
 
 		 726 aa  63.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1175  agarase  26.57 
 
 		 598 aa  63.5  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000232044  unclonable  0.000000011081 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  34.03 
 
 		 503 aa  63.2  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  31.46 
 
 		 869 aa  62.4  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  23.31 
 
 		 1091 aa  62  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4149  glycoside hydrolase family 5  33.96 
 
 		 590 aa  60.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.533031  normal  0.39445 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  31.21 
 
 		 853 aa  57.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  30.61 
 
 		 705 aa  57.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  34.74 
 
 		 536 aa  56.2  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26.47 
 
 		 945 aa  55.5  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  34.74 
 
 		 389 aa  54.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3070  hypothetical protein  32 
 
 		 233 aa  53.5  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  34.26 
 
 		 383 aa  52.8  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2490  2-isopropylmalate synthase  32.74 
 
 		 566 aa  52.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  35.71 
 
 		 1441 aa  52  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3237  cellulase  32.05 
 
 		 630 aa  50.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000087335  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  21.02 
 
 		 679 aa  48.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  29.29 
 
 		 884 aa  47.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  32.39 
 
 		 2073 aa  46.6  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  29.29 
 
 		 957 aa  46.6  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  30.85 
 
 		 1505 aa  46.6  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  31.21 
 
 		 1128 aa  45.8  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0671  hypothetical protein  53.85 
 
 		 119 aa  45.8  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.485621  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  33.98 
 
 		 541 aa  45.8  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  31.62 
 
 		 912 aa  45.1  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>