151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2996 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  100 
 
 		 853 aa  1742    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  45.8 
 
 		 869 aa  669    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  48.88 
 
 		 468 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  49.75 
 
 		 705 aa  379  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  31.39 
 
 		 673 aa  152  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2319  family 5 glycoside hydrolase  28.53 
 
 		 456 aa  127  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182404  normal  0.298559 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07770  conserved hypothetical protein  31.27 
 
 		 847 aa  124  9e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.622601  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  34.29 
 
 		 601 aa  121  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  48.78 
 
 		 1132 aa  114  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2693  glycoside hydrolase family protein  28.37 
 
 		 489 aa  114  8.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  41.73 
 
 		 1167 aa  113  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02120  expressed protein  30.17 
 
 		 470 aa  111  5e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  32.3 
 
 		 551 aa  105  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4149  glycoside hydrolase family 5  30.52 
 
 		 590 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.533031  normal  0.39445 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4045  glycoside hydrolase family 5  33.76 
 
 		 573 aa  102  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39320  endoglucanase family 5 glycoside hydrolase  30 
 
 		 481 aa  101  6e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0943  glycoside hydrolase family protein  29.12 
 
 		 493 aa  99  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  33.99 
 
 		 982 aa  95.1  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4512  Carbohydrate binding family 6  42.19 
 
 		 1391 aa  95.1  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472745 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66312  Endo-1,4-beta-glucanase  26.84 
 
 		 481 aa  95.1  5e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0233843 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  38.02 
 
 		 673 aa  93.6  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07130  glucan 1,3-beta-glucosidase  30.4 
 
 		 368 aa  93.6  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.486796  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  40.91 
 
 		 461 aa  93.2  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  37.5 
 
 		 610 aa  92.8  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  40.15 
 
 		 536 aa  93.2  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  38.52 
 
 		 639 aa  91.7  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  39.02 
 
 		 389 aa  91.3  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  25.56 
 
 		 863 aa  90.5  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  39.17 
 
 		 726 aa  90.1  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39160  Endoglucanase C (EGC) (Endo-1,4-beta-glucanase) (Cellulase C)  26.97 
 
 		 483 aa  88.2  6e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.151498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0862  Glucan 1,3-beta-glucosidase  28.3 
 
 		 368 aa  87  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168056  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04052  beta-1,3-exoglucosidase (Eurofung)  29.07 
 
 		 486 aa  85.9  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.137005  normal  0.167106 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2832  hypothetical protein  37.21 
 
 		 877 aa  85.9  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0897926  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2920  hypothetical protein  28.22 
 
 		 551 aa  86.3  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000907563  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  25.34 
 
 		 1115 aa  85.1  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  31.25 
 
 		 503 aa  85.1  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  30.11 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  41.32 
 
 		 541 aa  84.3  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  33.54 
 
 		 550 aa  83.6  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  34.93 
 
 		 918 aa  80.9  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  39.67 
 
 		 884 aa  80.9  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  39.67 
 
 		 957 aa  80.5  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.67 
 
 		 933 aa  77.4  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3927  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  33.1 
 
 		 465 aa  77  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  34.96 
 
 		 1091 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  39.17 
 
 		 383 aa  74.7  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  33.33 
 
 		 1356 aa  74.3  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02900  cytoplasm protein, putative  28.37 
 
 		 498 aa  74.3  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  31.94 
 
 		 819 aa  73.6  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.24 
 
 		 1321 aa  73.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  39.42 
 
 		 1338 aa  73.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  33.96 
 
 		 1024 aa  72.8  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  33.8 
 
 		 870 aa  72.4  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78873  Glucan 1,3-beta-glucosidase precursor (Exo-1,3-beta-glucanase)  26.91 
 
 		 438 aa  72.4  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  32.64 
 
 		 802 aa  72.4  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  40.4 
 
 		 823 aa  72  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  37.96 
 
 		 948 aa  72  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  37.5 
 
 		 569 aa  70.5  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  34.03 
 
 		 1799 aa  70.5  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3260  hypothetical protein  35.04 
 
 		 500 aa  70.1  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293464 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  32.43 
 
 		 801 aa  70.1  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  31.21 
 
 		 845 aa  69.7  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1290  endoglucanase  29.38 
 
 		 393 aa  69.3  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00901224  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  32.64 
 
 		 1380 aa  68.6  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57399  exo-1,3-beta-glucanase  27.2 
 
 		 458 aa  68.2  0.0000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.514091 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03150  cellulase, putative  30.94 
 
 		 431 aa  68.2  0.0000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1938  endoglucanase  24.68 
 
 		 401 aa  67.8  0.0000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07533  Beta-1,3-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AVZ7]  29.03 
 
 		 831 aa  67.4  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0180474  normal  0.0747834 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0847  endoglucanase  31.07 
 
 		 382 aa  67.4  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  31.25 
 
 		 719 aa  66.6  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04840  exo-beta-1,3-glucanase  26.96 
 
 		 827 aa  62.8  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.226873  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  31.13 
 
 		 777 aa  62.4  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  32.17 
 
 		 840 aa  61.6  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  33.33 
 
 		 855 aa  61.6  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  31.75 
 
 		 954 aa  61.6  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  35.11 
 
 		 1295 aa  60.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  29.73 
 
 		 524 aa  60.5  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1073  glycoside hydrolase family protein  27.67 
 
 		 329 aa  60.8  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  29.86 
 
 		 1732 aa  60.8  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  35.58 
 
 		 786 aa  60.1  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  25.19 
 
 		 501 aa  58.9  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  26.92 
 
 		 930 aa  58.2  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  36.17 
 
 		 2554 aa  58.5  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  31.39 
 
 		 1707 aa  58.2  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  25.12 
 
 		 335 aa  58.2  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  25.2 
 
 		 3295 aa  58.2  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  31.21 
 
 		 1262 aa  57.8  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  31.05 
 
 		 919 aa  57.8  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  27.41 
 
 		 335 aa  57.4  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00790  glucan 1,3-beta-glucosidase, putative  25.46 
 
 		 402 aa  56.2  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.221095  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01760  hypothetical protein  27.67 
 
 		 725 aa  56.6  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  29.37 
 
 		 1234 aa  56.6  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  26.05 
 
 		 1004 aa  56.6  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0671  glycoside hydrolase family 5  27.81 
 
 		 331 aa  55.5  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0431  Carbohydrate binding family 6  34.69 
 
 		 966 aa  55.5  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.174739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0943  ribosomal protein S5  26.84 
 
 		 1316 aa  55.1  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215001 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  28.26 
 
 		 522 aa  55.5  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0234  glycoside hydrolase family 5  28.21 
 
 		 328 aa  55.1  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03777  Endo-beta-1,6-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B6Q3]  25.36 
 
 		 409 aa  54.7  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  28.37 
 
 		 1035 aa  54.3  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>