119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0488 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 		 1799 aa  3642    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  37.8 
 
 		 1262 aa  678    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  43.23 
 
 		 1035 aa  469  9.999999999999999e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  40.96 
 
 		 1234 aa  362  3e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  39.53 
 
 		 930 aa  347  1e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0130  hypothetical protein  40.08 
 
 		 568 aa  328  4.0000000000000003e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34689 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  44.7 
 
 		 869 aa  328  6e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  42.63 
 
 		 958 aa  327  1e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0129  hypothetical protein  39.76 
 
 		 587 aa  323  1.9999999999999998e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0105  Parallel beta-helix repeat protein  41.44 
 
 		 609 aa  319  3e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.28403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1542  hypothetical protein  44.31 
 
 		 458 aa  318  4e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.218031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0103  hypothetical protein  35.81 
 
 		 684 aa  221  8.999999999999998e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0677  hypothetical protein  35.09 
 
 		 486 aa  204  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0395736  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  41.79 
 
 		 954 aa  202  3e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0672  hypothetical protein  33.92 
 
 		 550 aa  199  4.0000000000000005e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.165731  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0431  Carbohydrate binding family 6  37.82 
 
 		 966 aa  198  8.000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.174739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0673  APHP domain-containing protein  33.49 
 
 		 857 aa  189  5e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  32.21 
 
 		 1132 aa  170  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1779  Carbohydrate binding family 6  30.97 
 
 		 526 aa  163  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00214562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  55.86 
 
 		 2554 aa  161  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  55.17 
 
 		 1732 aa  161  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  54.48 
 
 		 3295 aa  157  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  55.07 
 
 		 581 aa  156  4e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  52.74 
 
 		 845 aa  154  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  53.74 
 
 		 819 aa  154  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  51.81 
 
 		 802 aa  154  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4512  Carbohydrate binding family 6  23.86 
 
 		 1391 aa  153  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472745 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  30.65 
 
 		 916 aa  152  5e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  50.6 
 
 		 777 aa  152  6e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  53.42 
 
 		 870 aa  152  6e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  53.79 
 
 		 1380 aa  152  6e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  52.86 
 
 		 735 aa  152  7e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  52.05 
 
 		 840 aa  150  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  52.05 
 
 		 823 aa  149  5e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  31.9 
 
 		 918 aa  147  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  50 
 
 		 719 aa  147  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  46.03 
 
 		 786 aa  146  4e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  29.03 
 
 		 1338 aa  146  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.72 
 
 		 1321 aa  145  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  49.14 
 
 		 468 aa  145  5e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  27.48 
 
 		 1167 aa  145  8e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  45.63 
 
 		 1356 aa  144  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  44.97 
 
 		 627 aa  141  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  45.11 
 
 		 522 aa  140  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  43.5 
 
 		 875 aa  135  6.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  30.14 
 
 		 569 aa  134  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  30.08 
 
 		 1707 aa  133  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  28.7 
 
 		 982 aa  132  7.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  44 
 
 		 749 aa  125  7e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  39.88 
 
 		 801 aa  125  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  47.74 
 
 		 627 aa  124  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  48.32 
 
 		 919 aa  121  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  42.04 
 
 		 798 aa  119  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  43.42 
 
 		 948 aa  114  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1386  hypothetical protein  28.49 
 
 		 494 aa  114  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.556451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  41.08 
 
 		 739 aa  112  9.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  39.47 
 
 		 1387 aa  109  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  28.48 
 
 		 863 aa  107  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0686  periplasmic copper-binding  41.33 
 
 		 461 aa  105  7e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.36 
 
 		 933 aa  104  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  38.93 
 
 		 630 aa  97.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  30.16 
 
 		 1004 aa  97.4  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  25.94 
 
 		 673 aa  97.1  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  38.31 
 
 		 524 aa  96.3  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  42.19 
 
 		 1024 aa  95.9  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  26.86 
 
 		 610 aa  94  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  36.99 
 
 		 550 aa  92.8  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  38.29 
 
 		 1295 aa  92.4  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  37.24 
 
 		 855 aa  91.3  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  35.36 
 
 		 972 aa  90.1  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3260  hypothetical protein  35.62 
 
 		 500 aa  82.4  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293464 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2052  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.23 
 
 		 491 aa  79.3  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  33.07 
 
 		 726 aa  76.3  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  30.14 
 
 		 1091 aa  75.9  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0242  Band 7 protein  30.77 
 
 		 681 aa  71.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  32.14 
 
 		 705 aa  71.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  39.39 
 
 		 639 aa  70.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2832  hypothetical protein  23.71 
 
 		 877 aa  70.5  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0897926  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  34.03 
 
 		 853 aa  68.9  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3070  hypothetical protein  29.63 
 
 		 233 aa  67.8  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4149  glycoside hydrolase family 5  33.54 
 
 		 590 aa  67.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.533031  normal  0.39445 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3237  cellulase  36.11 
 
 		 630 aa  66.6  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000087335  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  34.51 
 
 		 383 aa  66.6  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3238  hypothetical protein  30.82 
 
 		 652 aa  63.2  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000359216  normal  0.364609 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3239  cellulase  32.41 
 
 		 638 aa  61.6  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00277111  normal  0.266356 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  24.59 
 
 		 869 aa  60.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  35.92 
 
 		 461 aa  60.1  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  23.75 
 
 		 679 aa  59.7  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  32.88 
 
 		 1015 aa  59.7  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  25.3 
 
 		 884 aa  59.3  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1175  agarase  25.76 
 
 		 598 aa  58.2  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000232044  unclonable  0.000000011081 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  29.58 
 
 		 503 aa  58.2  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  28 
 
 		 965 aa  55.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  27.89 
 
 		 928 aa  55.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  27.05 
 
 		 957 aa  54.7  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  28.05 
 
 		 541 aa  53.1  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  29.2 
 
 		 389 aa  52.8  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  26.6 
 
 		 536 aa  52.4  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2490  2-isopropylmalate synthase  31.47 
 
 		 566 aa  52  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  36.05 
 
 		 1441 aa  51.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>