36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1175 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1175  agarase  100 
 
 		 598 aa  1214    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000232044  unclonable  0.000000011081 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2655  agarase  38.82 
 
 		 1335 aa  177  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0452542  normal  0.27666 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4512  Carbohydrate binding family 6  28.05 
 
 		 1391 aa  67.4  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472745 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  27.9 
 
 		 918 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2832  hypothetical protein  26.53 
 
 		 877 aa  66.2  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0897926  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  29.59 
 
 		 673 aa  63.2  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  27.43 
 
 		 1234 aa  62  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0824  glycoside hydrolase family protein  25.86 
 
 		 454 aa  61.2  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000871412  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  27.98 
 
 		 863 aa  60.5  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  28.03 
 
 		 610 aa  58.9  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  25.08 
 
 		 1799 aa  58.5  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  25.86 
 
 		 1262 aa  58.2  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  25.83 
 
 		 982 aa  57.4  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  25 
 
 		 1167 aa  56.2  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  21.12 
 
 		 930 aa  55.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0880  glycoside hydrolase family protein  26.35 
 
 		 333 aa  55.5  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.395386  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2825  glycoside hydrolase family protein  28.81 
 
 		 492 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  25.78 
 
 		 954 aa  55.1  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  30.33 
 
 		 524 aa  54.3  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  40.43 
 
 		 522 aa  53.9  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  28.23 
 
 		 639 aa  51.2  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  28.26 
 
 		 705 aa  50.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  27.72 
 
 		 1338 aa  50.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  31.06 
 
 		 541 aa  49.7  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  30.5 
 
 		 468 aa  47.4  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  30.37 
 
 		 855 aa  47.4  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  27.57 
 
 		 1035 aa  45.8  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  24.39 
 
 		 1091 aa  45.4  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  30.61 
 
 		 869 aa  45.4  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  32.48 
 
 		 1004 aa  45.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  31.2 
 
 		 884 aa  44.7  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  30 
 
 		 461 aa  44.3  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.3 
 
 		 1321 aa  44.3  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  27.42 
 
 		 1132 aa  44.3  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  22.97 
 
 		 503 aa  43.5  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  31.52 
 
 		 819 aa  43.5  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>