250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4174 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  100 
 
 		 957 aa  1942    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  83.8 
 
 		 884 aa  795    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2188  peptidase domain protein  51.28 
 
 		 692 aa  546  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000255141  hitchhiker  0.000237212 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  66.06 
 
 		 541 aa  290  7e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4332  Ricin B lectin  49.38 
 
 		 615 aa  232  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.817761  normal  0.0720026 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  45.93 
 
 		 1187 aa  219  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  49.55 
 
 		 536 aa  209  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3289  PKD repeat-containing protein  36.98 
 
 		 995 aa  192  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745526  hitchhiker  0.000000829414 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  65.08 
 
 		 389 aa  179  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  28.22 
 
 		 1141 aa  165  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3927  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  59.52 
 
 		 465 aa  159  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  38.6 
 
 		 726 aa  156  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  40.64 
 
 		 1132 aa  147  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  53.97 
 
 		 610 aa  144  6e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  57.85 
 
 		 383 aa  139  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  46.38 
 
 		 569 aa  127  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  48.78 
 
 		 673 aa  125  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4552  putative curculin-like lectin  31 
 
 		 852 aa  120  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.602066  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  42.34 
 
 		 1167 aa  114  7.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  41.73 
 
 		 1139 aa  111  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  45.54 
 
 		 461 aa  105  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  41.48 
 
 		 507 aa  105  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  39.86 
 
 		 563 aa  103  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  35 
 
 		 705 aa  102  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  41.48 
 
 		 401 aa  102  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.75 
 
 		 474 aa  102  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  40 
 
 		 982 aa  100  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3651  glycoside hydrolase family 76  54.65 
 
 		 613 aa  99.4  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  38.96 
 
 		 412 aa  98.6  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2832  hypothetical protein  41.8 
 
 		 877 aa  98.2  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0897926  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  40.44 
 
 		 430 aa  98.2  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  38.33 
 
 		 863 aa  97.8  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  35.17 
 
 		 503 aa  97.8  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  41.48 
 
 		 639 aa  96.3  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  37.04 
 
 		 571 aa  95.1  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2185  beta and gamma crystallin  53.93 
 
 		 483 aa  95.1  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421381  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4512  Carbohydrate binding family 6  32.97 
 
 		 1391 aa  95.5  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472745 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  36.76 
 
 		 691 aa  95.1  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  37.69 
 
 		 1259 aa  94.4  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.71 
 
 		 520 aa  94.4  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  35.81 
 
 		 569 aa  93.6  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  40.58 
 
 		 495 aa  91.7  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  37.88 
 
 		 491 aa  90.5  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  38.46 
 
 		 436 aa  88.2  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  42.06 
 
 		 503 aa  87.8  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  40 
 
 		 470 aa  87.8  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  41.04 
 
 		 469 aa  87.8  9e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  32.96 
 
 		 550 aa  85.9  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  36.09 
 
 		 497 aa  84.7  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3094  beta and gamma crystallin  42.59 
 
 		 450 aa  84.7  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2581  hypothetical protein  43.18 
 
 		 484 aa  84.3  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000219453  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.56 
 
 		 466 aa  84  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  36.59 
 
 		 869 aa  83.6  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  39.13 
 
 		 514 aa  82.4  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  40.32 
 
 		 411 aa  81.6  0.00000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  39.67 
 
 		 853 aa  80.5  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  39.23 
 
 		 501 aa  80.5  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  37.4 
 
 		 582 aa  80.9  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6977  hypothetical protein  34.59 
 
 		 897 aa  80.5  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449457  normal  0.690746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5224  Carbohydrate binding family 6  35.82 
 
 		 566 aa  79.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.34 
 
 		 472 aa  79  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  42.11 
 
 		 918 aa  78.6  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  32.09 
 
 		 507 aa  78.2  0.0000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 494 aa  77.4  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  34.81 
 
 		 560 aa  77.4  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  25.2 
 
 		 789 aa  76.6  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  28.99 
 
 		 1413 aa  75.1  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  37.59 
 
 		 951 aa  75.1  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  36.72 
 
 		 618 aa  74.7  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  38 
 
 		 845 aa  74.7  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  29.41 
 
 		 507 aa  74.7  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  34.59 
 
 		 1444 aa  74.7  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.39 
 
 		 933 aa  74.7  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 672 aa  74.7  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  32.39 
 
 		 695 aa  73.9  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  37.96 
 
 		 490 aa  73.9  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  33.82 
 
 		 943 aa  73.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  31.11 
 
 		 476 aa  73.6  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  39 
 
 		 823 aa  72.8  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  37.86 
 
 		 802 aa  72  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  37.29 
 
 		 948 aa  71.6  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  30.66 
 
 		 537 aa  71.6  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0329  Pectate lyase  34.03 
 
 		 445 aa  71.2  0.00000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0745769 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5674  Ricin B lectin  34.46 
 
 		 425 aa  71.2  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510311 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  38 
 
 		 1380 aa  70.9  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  36.89 
 
 		 819 aa  70.9  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  35.85 
 
 		 719 aa  71.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  37.17 
 
 		 1024 aa  70.1  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  29.63 
 
 		 566 aa  69.7  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4959  Ricin B lectin  33.57 
 
 		 576 aa  70.1  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.572354  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1779  Carbohydrate binding family 6  29.32 
 
 		 526 aa  70.5  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00214562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1703  hypothetical protein  32.8 
 
 		 392 aa  69.7  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.595343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 1016 aa  69.7  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  35.29 
 
 		 1356 aa  68.9  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  37.31 
 
 		 498 aa  69.3  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  32.54 
 
 		 912 aa  68.6  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0859  Ricin B lectin  30 
 
 		 483 aa  68.6  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  34.96 
 
 		 1091 aa  68.9  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  45 
 
 		 1295 aa  68.6  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1911  carbohydrate-binding family 6 protein  32.12 
 
 		 1290 aa  68.2  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.374482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>