126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1643 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  100 
 
 		 563 aa  1143    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  63.41 
 
 		 560 aa  649    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1869  parallel beta-helix repeat protein  68.68 
 
 		 384 aa  479  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08927  conserved hypothetical protein  44.03 
 
 		 355 aa  267  4e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.096319 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  44.37 
 
 		 582 aa  200  6e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3897  Parallel beta-helix repeat protein  39.4 
 
 		 414 aa  195  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00247458  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  49.47 
 
 		 474 aa  164  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  47.62 
 
 		 466 aa  162  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  47.5 
 
 		 430 aa  161  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3900  hypothetical protein  36.88 
 
 		 731 aa  160  8e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.020807  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0329  Pectate lyase  46.59 
 
 		 445 aa  154  5.9999999999999996e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0745769 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  53.69 
 
 		 507 aa  149  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  55.24 
 
 		 401 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3906  Ricin B lectin  29.87 
 
 		 744 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0306743  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  52.45 
 
 		 495 aa  136  9e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  46.53 
 
 		 691 aa  130  9.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  44.37 
 
 		 491 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  45.14 
 
 		 520 aa  121  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  40 
 
 		 412 aa  117  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  44.16 
 
 		 1139 aa  114  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  40.88 
 
 		 571 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1703  hypothetical protein  36.16 
 
 		 392 aa  103  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.595343 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  39.86 
 
 		 957 aa  103  9e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4332  Ricin B lectin  40.15 
 
 		 615 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.817761  normal  0.0720026 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  45.11 
 
 		 497 aa  100  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  40.88 
 
 		 507 aa  98.6  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  37.78 
 
 		 884 aa  98.2  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  41.72 
 
 		 436 aa  98.2  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  41.61 
 
 		 411 aa  97.8  5e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  38.61 
 
 		 647 aa  96.7  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  36.71 
 
 		 503 aa  96.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  37.96 
 
 		 507 aa  94.4  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  32.97 
 
 		 1259 aa  94  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  38.57 
 
 		 695 aa  93.2  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  33.13 
 
 		 472 aa  92.4  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  40.91 
 
 		 943 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  37.67 
 
 		 537 aa  90.9  6e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  38.64 
 
 		 569 aa  88.6  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  34.84 
 
 		 789 aa  87.4  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  37.06 
 
 		 514 aa  86.7  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  32.76 
 
 		 1413 aa  84  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2967  Ricin B lectin  34.25 
 
 		 230 aa  83.2  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0859  Ricin B lectin  38.21 
 
 		 483 aa  80.5  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  31.72 
 
 		 503 aa  80.5  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6977  hypothetical protein  31.82 
 
 		 897 aa  80.5  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449457  normal  0.690746 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5674  Ricin B lectin  40 
 
 		 425 aa  80.5  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510311 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  32.14 
 
 		 2073 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  40.46 
 
 		 618 aa  79  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  37.5 
 
 		 494 aa  79.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  35.66 
 
 		 566 aa  77.8  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  32.69 
 
 		 474 aa  77  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  35.29 
 
 		 1187 aa  75.1  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  32.33 
 
 		 963 aa  74.3  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  36.59 
 
 		 427 aa  73.6  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  37.88 
 
 		 476 aa  72.8  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  35.77 
 
 		 648 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  31.47 
 
 		 1016 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  33.58 
 
 		 771 aa  68.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  35.53 
 
 		 794 aa  68.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  36.17 
 
 		 737 aa  68.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  33.33 
 
 		 663 aa  68.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  34.85 
 
 		 672 aa  67.8  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  33.58 
 
 		 510 aa  67.8  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  31.3 
 
 		 1141 aa  67  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  30.17 
 
 		 482 aa  64.7  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1075  Ricin B lectin  36.54 
 
 		 239 aa  63.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.71 
 
 		 756 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0964  Ricin B lectin  39.56 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  29.92 
 
 		 487 aa  59.7  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  33.58 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  31.47 
 
 		 982 aa  58.2  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  31.76 
 
 		 709 aa  58.2  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  29.53 
 
 		 1567 aa  58.2  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  34.85 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1625  Ricin B lectin  26.7 
 
 		 664 aa  58.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  34 
 
 		 492 aa  57.4  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  34.65 
 
 		 824 aa  57.4  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.57 
 
 		 507 aa  57.4  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2737  Ricin B lectin  31.62 
 
 		 1148 aa  57  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285354  normal  0.294912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  31.71 
 
 		 489 aa  55.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  34.11 
 
 		 498 aa  55.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7940  hypothetical protein  30.67 
 
 		 573 aa  55.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  30.71 
 
 		 863 aa  54.3  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4959  Ricin B lectin  29.1 
 
 		 576 aa  54.3  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.572354  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1748  Ricin B lectin  38.67 
 
 		 1347 aa  52.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207372  normal  0.0116173 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  31.5 
 
 		 472 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  33.33 
 
 		 803 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4828  Ricin B lectin  26.32 
 
 		 555 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000773759 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  32 
 
 		 522 aa  51.2  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49706  predicted protein  27.56 
 
 		 1222 aa  51.6  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1817  Ricin B lectin  29.7 
 
 		 400 aa  51.6  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599539  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  31.51 
 
 		 806 aa  51.2  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  31.51 
 
 		 806 aa  51.2  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  31.51 
 
 		 806 aa  51.2  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  31.51 
 
 		 806 aa  51.2  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  31.51 
 
 		 806 aa  51.2  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  31.51 
 
 		 806 aa  51.2  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  31.51 
 
 		 806 aa  51.2  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4177  Pectate lyase  27.91 
 
 		 430 aa  51.2  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  36.44 
 
 		 446 aa  50.8  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>