165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2737 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5219  hypothetical protein  66.56 
 
 		 1176 aa  1153    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2737  Ricin B lectin  100 
 
 		 1148 aa  2284    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285354  normal  0.294912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  78.89 
 
 		 726 aa  389  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4926  Ricin B lectin  49.27 
 
 		 748 aa  213  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164927  normal  0.377281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4874  Ricin B lectin  69.57 
 
 		 1049 aa  208  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524665  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  63.9 
 
 		 494 aa  168  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7461  Ig family protein  59.2 
 
 		 672 aa  159  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1270  Ig family protein  62.36 
 
 		 753 aa  144  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4148  Ig family protein  60.23 
 
 		 788 aa  141  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0784592  normal  0.172989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.08 
 
 		 933 aa  123  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40 
 
 		 1072 aa  120  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6403  Ig family protein  47.89 
 
 		 884 aa  119  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  64.91 
 
 		 688 aa  115  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  36.24 
 
 		 824 aa  110  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1197  PKD domain containing protein  54.19 
 
 		 2079 aa  108  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  46.41 
 
 		 1779 aa  108  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  61.06 
 
 		 815 aa  107  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  34.45 
 
 		 2402 aa  105  7e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3053  Ig family protein  48.63 
 
 		 3244 aa  101  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  56.57 
 
 		 674 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0136  Ig family protein  55.56 
 
 		 622 aa  101  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  62.77 
 
 		 1016 aa  99  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  65.52 
 
 		 962 aa  93.2  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5658  Ricin B lectin  37.91 
 
 		 840 aa  90.5  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  71.88 
 
 		 778 aa  89.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  41.21 
 
 		 1672 aa  87.4  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7207  Ig family protein  66.67 
 
 		 710 aa  85.5  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  45.45 
 
 		 1673 aa  85.1  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  77.92 
 
 		 518 aa  85.1  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  34.38 
 
 		 476 aa  79.7  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  39.01 
 
 		 887 aa  79  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.67 
 
 		 1321 aa  76.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  54.76 
 
 		 1338 aa  75.1  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  37.5 
 
 		 648 aa  73.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  39.39 
 
 		 1879 aa  72.8  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4498  Ig family protein  35.79 
 
 		 1232 aa  70.1  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2678  cell wall anchor domain-containing protein  35.71 
 
 		 2271 aa  69.3  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2734  cell wall anchor domain-containing protein  35.71 
 
 		 2271 aa  69.3  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  31.97 
 
 		 1567 aa  69.3  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  33.59 
 
 		 672 aa  68.9  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0417  Ig family protein  43.56 
 
 		 592 aa  68.9  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  40.86 
 
 		 618 aa  68.2  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  34.24 
 
 		 1222 aa  67  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  33.33 
 
 		 3542 aa  66.2  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3316  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.21 
 
 		 692 aa  65.9  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  33.09 
 
 		 806 aa  65.5  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  33.09 
 
 		 806 aa  65.5  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  33.09 
 
 		 806 aa  65.5  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  33.09 
 
 		 806 aa  65.5  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  33.09 
 
 		 806 aa  65.5  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  33.09 
 
 		 806 aa  65.5  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  33.09 
 
 		 806 aa  65.5  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  30.34 
 
 		 806 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2281  serine threonine rich antigen  38.73 
 
 		 1870 aa  63.9  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  34.51 
 
 		 494 aa  63.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2202  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.05 
 
 		 597 aa  63.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176046  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  40.45 
 
 		 497 aa  62.8  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  34.88 
 
 		 3563 aa  62.4  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6876  glycoside hydrolase family 76  31.47 
 
 		 514 aa  62  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0933  hypothetical protein  36.81 
 
 		 2636 aa  62  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49706  predicted protein  36.72 
 
 		 1222 aa  61.6  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  27.96 
 
 		 963 aa  60.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  32 
 
 		 507 aa  60.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0929  Ig family protein  31.37 
 
 		 1025 aa  60.5  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  40.35 
 
 		 2802 aa  60.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  30.16 
 
 		 507 aa  60.1  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  37.7 
 
 		 574 aa  59.7  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  32.8 
 
 		 436 aa  59.3  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  31.43 
 
 		 794 aa  59.3  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4374  Ig family protein  35.57 
 
 		 731 aa  58.9  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  29.5 
 
 		 957 aa  58.5  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.07 
 
 		 474 aa  58.2  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  30.15 
 
 		 401 aa  57.8  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0847  galactose oxidase-related protein  31.47 
 
 		 805 aa  57.8  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  31.62 
 
 		 563 aa  57.8  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1758  lectin repeat-containing protein  31.47 
 
 		 807 aa  57.4  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.16 
 
 		 11716 aa  57.4  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1368  galactose oxidase-related protein  31.47 
 
 		 858 aa  57.8  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0445018  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0506  galactose oxidase-related protein  31.47 
 
 		 800 aa  57.4  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1572  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  31.47 
 
 		 858 aa  57.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1597  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  31.47 
 
 		 858 aa  57.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0650  galactose oxidase-related protein  31.47 
 
 		 800 aa  57.4  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.173202  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1856  glycoside hydrolase family protein  23.67 
 
 		 781 aa  57.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  34.86 
 
 		 691 aa  58.2  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1731  Ricin B lectin  28.57 
 
 		 172 aa  57  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.563976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  32.31 
 
 		 482 aa  57  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  32.54 
 
 		 472 aa  56.2  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1752  hypothetical protein  23.77 
 
 		 833 aa  55.8  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  30.16 
 
 		 507 aa  56.2  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.86 
 
 		 756 aa  55.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0772  hypothetical protein  29.31 
 
 		 802 aa  55.8  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  38.32 
 
 		 943 aa  55.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  31.08 
 
 		 801 aa  55.5  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  30.2 
 
 		 695 aa  55.1  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  28.06 
 
 		 884 aa  55.1  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0071  glycoside hydrolase family protein  32.5 
 
 		 835 aa  55.1  0.000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  28.32 
 
 		 491 aa  54.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  34.92 
 
 		 560 aa  54.3  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  30.82 
 
 		 490 aa  54.3  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  30.23 
 
 		 493 aa  54.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>