117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6977 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6977  hypothetical protein  100 
 
 		 897 aa  1807    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449457  normal  0.690746 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04809  Glutaminase A [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVX8]  40.61 
 
 		 688 aa  492  1e-137  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000377599  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10959  glutaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09910)  31.68 
 
 		 738 aa  326  1e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.126465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1580  L-glutaminase  34.72 
 
 		 817 aa  317  4e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.358797 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4171  L-glutaminase  34.78 
 
 		 827 aa  317  5e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000373381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6191  hypothetical protein  34.96 
 
 		 855 aa  311  4e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.802957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6639  hypothetical protein  31.74 
 
 		 821 aa  277  8e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04901  glutaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10910)  33.06 
 
 		 819 aa  224  8e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.71555 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  52.59 
 
 		 963 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  48.89 
 
 		 771 aa  125  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  44.78 
 
 		 412 aa  112  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  45.86 
 
 		 503 aa  106  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  35.37 
 
 		 571 aa  102  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  43.61 
 
 		 537 aa  103  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.85 
 
 		 474 aa  101  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  43.61 
 
 		 582 aa  100  9e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  44.36 
 
 		 566 aa  100  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4959  Ricin B lectin  43.61 
 
 		 576 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.572354  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  42.66 
 
 		 411 aa  100  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  37.86 
 
 		 430 aa  96.7  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.69 
 
 		 507 aa  96.7  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  36.23 
 
 		 691 aa  92  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  40.6 
 
 		 507 aa  92  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.86 
 
 		 520 aa  91.7  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  35.25 
 
 		 495 aa  90.9  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  35.46 
 
 		 401 aa  89.4  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  38.16 
 
 		 943 aa  84.3  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  34.33 
 
 		 737 aa  84.3  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  39.85 
 
 		 510 aa  84.3  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  37.59 
 
 		 507 aa  84  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  36.23 
 
 		 1139 aa  82.8  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  39.69 
 
 		 436 aa  80.5  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  31.82 
 
 		 563 aa  80.1  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  38.46 
 
 		 789 aa  80.1  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  34.59 
 
 		 957 aa  80.1  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.58 
 
 		 466 aa  79.3  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  33.08 
 
 		 884 aa  78.6  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  34.85 
 
 		 514 aa  78.6  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  33.83 
 
 		 1413 aa  78.2  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  46.67 
 
 		 618 aa  77.8  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  36.84 
 
 		 472 aa  75.1  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  32.34 
 
 		 491 aa  75.1  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  32.33 
 
 		 503 aa  74.3  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  36.57 
 
 		 1187 aa  73.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  35.56 
 
 		 672 aa  73.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  38.71 
 
 		 647 aa  72.4  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4332  Ricin B lectin  32.09 
 
 		 615 aa  70.5  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.817761  normal  0.0720026 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  30.94 
 
 		 560 aa  69.7  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  36.13 
 
 		 1259 aa  70.1  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.34 
 
 		 507 aa  68.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  33.09 
 
 		 494 aa  67.8  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0859  Ricin B lectin  31.54 
 
 		 483 aa  67  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0329  Pectate lyase  27.97 
 
 		 445 aa  66.2  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0745769 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  34.35 
 
 		 569 aa  64.3  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  32.61 
 
 		 663 aa  63.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  28.26 
 
 		 695 aa  62.4  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2967  Ricin B lectin  26.87 
 
 		 230 aa  62  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  36.96 
 
 		 497 aa  62  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  27.87 
 
 		 476 aa  61.6  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1703  hypothetical protein  31.08 
 
 		 392 aa  60.8  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.595343 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  31.78 
 
 		 427 aa  59.3  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1625  Ricin B lectin  30.47 
 
 		 664 aa  58.5  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  32.84 
 
 		 2073 aa  58.2  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  33.33 
 
 		 806 aa  55.8  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  33.33 
 
 		 806 aa  55.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  33.33 
 
 		 806 aa  55.8  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  33.33 
 
 		 806 aa  55.8  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  33.33 
 
 		 806 aa  55.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 		 806 aa  55.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 		 806 aa  55.8  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  29.92 
 
 		 1567 aa  55.8  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  28.57 
 
 		 482 aa  55.1  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  33.59 
 
 		 794 aa  54.3  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.75 
 
 		 756 aa  53.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4828  Ricin B lectin  32 
 
 		 555 aa  52.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000773759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  30.4 
 
 		 824 aa  52.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.45 
 
 		 933 aa  52  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  25.95 
 
 		 648 aa  51.6  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5166  Ricin B lectin  32.65 
 
 		 642 aa  51.2  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400775  normal  0.0878066 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  29.69 
 
 		 487 aa  51.2  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  32.58 
 
 		 863 aa  50.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  28.8 
 
 		 391 aa  50.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  28.35 
 
 		 472 aa  50.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4926  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 748 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164927  normal  0.377281 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  30.26 
 
 		 806 aa  49.7  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  28.08 
 
 		 644 aa  49.7  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49706  predicted protein  26.9 
 
 		 1222 aa  49.3  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  33.33 
 
 		 414 aa  49.7  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  26.92 
 
 		 493 aa  49.3  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  30.3 
 
 		 982 aa  48.1  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  27.03 
 
 		 373 aa  48.1  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  26.29 
 
 		 490 aa  48.1  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  29.6 
 
 		 488 aa  47.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  27.88 
 
 		 548 aa  47.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  34.12 
 
 		 487 aa  47.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  26.77 
 
 		 492 aa  47.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1748  Ricin B lectin  37.3 
 
 		 1347 aa  47.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207372  normal  0.0116173 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4436  glucan 1,6-alpha-isomaltosidase  27.01 
 
 		 1172 aa  47  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  28.67 
 
 		 474 aa  47  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  27.64 
 
 		 489 aa  46.6  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>