175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3107 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  100 
 
 		 771 aa  1560    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2836  protein of unknown function DUF1680  51.43 
 
 		 614 aa  579  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  51.61 
 
 		 846 aa  577  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0478  protein of unknown function DUF1680  37.6 
 
 		 641 aa  391  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.216473  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  37.38 
 
 		 955 aa  363  7.0000000000000005e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01470  hypothetical protein  35.7 
 
 		 783 aa  349  1e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0778  Acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  34.55 
 
 		 803 aa  347  4e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.163489 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2153  protein of unknown function DUF1680  34.23 
 
 		 792 aa  340  5e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.299284  normal  0.0915146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1422  protein of unknown function DUF1680  33.12 
 
 		 760 aa  332  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428296  normal  0.497833 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1993  hypothetical protein  33.44 
 
 		 795 aa  332  2e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0573537  hitchhiker  0.00434895 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1982  hypothetical protein  33.44 
 
 		 795 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0591519  hitchhiker  0.000518937 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2080  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  33.12 
 
 		 795 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.254608  hitchhiker  0.00000268125 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4617  protein of unknown function DUF1680  32.93 
 
 		 1025 aa  323  9.999999999999999e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602011  normal  0.370298 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3876  hypothetical protein  30.19 
 
 		 765 aa  322  1.9999999999999998e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3214  hypothetical protein  38.58 
 
 		 844 aa  322  1.9999999999999998e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.77483  normal  0.454399 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0363  protein of unknown function DUF1680  33.81 
 
 		 744 aa  270  5e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1194  protein of unknown function DUF1680  33.66 
 
 		 749 aa  238  2e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4712  protein of unknown function DUF1680  32.4 
 
 		 881 aa  237  6e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11690  hypothetical protein  31.85 
 
 		 752 aa  236  8e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0997  protein of unknown function DUF1680  29.23 
 
 		 597 aa  234  5e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1859  protein of unknown function DUF1680  39.3 
 
 		 736 aa  176  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0062  protein of unknown function DUF1680  29.66 
 
 		 596 aa  153  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.560227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0320  hypothetical protein  26.09 
 
 		 607 aa  144  7e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.280201  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0164  hypothetical protein  26.59 
 
 		 602 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.935603  normal  0.0626406 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  53.28 
 
 		 963 aa  141  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1938  protein of unknown function DUF1680  27.07 
 
 		 711 aa  137  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6977  hypothetical protein  48.89 
 
 		 897 aa  124  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449457  normal  0.690746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4959  Ricin B lectin  35.6 
 
 		 576 aa  102  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.572354  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  44.26 
 
 		 582 aa  99.4  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  40.14 
 
 		 503 aa  98.6  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  41.79 
 
 		 474 aa  97.1  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  40.15 
 
 		 691 aa  96.7  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2242  protein of unknown function DUF1680  24.16 
 
 		 652 aa  95.5  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  40.74 
 
 		 482 aa  92.8  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  37.04 
 
 		 412 aa  92.8  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.97 
 
 		 507 aa  92.8  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  43.26 
 
 		 510 aa  92.4  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  36.23 
 
 		 571 aa  89.7  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  36.81 
 
 		 737 aa  89.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  39.71 
 
 		 537 aa  89  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  38.69 
 
 		 1413 aa  87  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.97 
 
 		 520 aa  87  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  37.96 
 
 		 566 aa  85.5  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  39.42 
 
 		 430 aa  84.7  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  40.15 
 
 		 495 aa  83.6  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4720  protein of unknown function DUF1680  25.17 
 
 		 655 aa  82.8  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.827878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2748  protein of unknown function DUF1680  31.25 
 
 		 684 aa  81.6  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0072487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2738  protein of unknown function DUF1680  25.9 
 
 		 680 aa  80.5  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0391777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0969  hypothetical protein  24.93 
 
 		 634 aa  80.5  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00300565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3930  protein of unknown function DUF1680  25.31 
 
 		 640 aa  80.1  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2133  protein of unknown function DUF1680  24.41 
 
 		 673 aa  79.7  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.46 
 
 		 466 aa  79.7  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0643  hypothetical protein  25.47 
 
 		 620 aa  79  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000119693  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4835  protein of unknown function DUF1680  25.35 
 
 		 648 aa  78.6  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3839  hypothetical protein  27.19 
 
 		 654 aa  78.2  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254825  normal  0.0525361 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  33.58 
 
 		 514 aa  78.2  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0635  protein of unknown function DUF1680  23.78 
 
 		 656 aa  77.4  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2720  protein of unknown function DUF1680  26.1 
 
 		 640 aa  77  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  37.7 
 
 		 411 aa  75.1  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01840  hypothetical protein  29.55 
 
 		 643 aa  75.5  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  35.29 
 
 		 427 aa  74.7  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  35.51 
 
 		 1139 aa  74.3  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  28.99 
 
 		 507 aa  74.3  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2215  protein of unknown function DUF1680  25.68 
 
 		 638 aa  74.3  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  28.99 
 
 		 507 aa  73.6  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4097  hypothetical protein  24.87 
 
 		 672 aa  73.6  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121081  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1342  hypothetical protein  29.94 
 
 		 669 aa  73.9  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0668  hypothetical protein  23.98 
 
 		 620 aa  73.2  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  33.1 
 
 		 494 aa  73.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  28.36 
 
 		 943 aa  72.8  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  35.48 
 
 		 1259 aa  71.2  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3957  hypothetical protein  23.86 
 
 		 651 aa  70.1  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  0.86497 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  38.81 
 
 		 560 aa  70.1  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  35.25 
 
 		 401 aa  70.1  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0910  hypothetical protein  24.4 
 
 		 665 aa  68.9  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.027132  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0502  protein of unknown function DUF1680  22.22 
 
 		 617 aa  69.3  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.171957  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  33.58 
 
 		 563 aa  68.9  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3893  hypothetical protein  23.53 
 
 		 651 aa  68.2  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4952  hypothetical protein  25 
 
 		 656 aa  68.6  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  31.43 
 
 		 957 aa  68.2  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1254  protein of unknown function DUF1680  26.35 
 
 		 684 aa  68.2  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.831647  normal  0.201869 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  33.33 
 
 		 618 aa  68.2  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2967  protein of unknown function DUF1680  27.75 
 
 		 838 aa  67.8  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000186086  hitchhiker  0.000639223 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4996  protein of unknown function DUF1680  23.84 
 
 		 800 aa  67.8  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0292235  normal  0.0722722 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  32.12 
 
 		 476 aa  67.8  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3909  hypothetical protein  24.7 
 
 		 656 aa  67.8  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4064  hypothetical protein  23.02 
 
 		 651 aa  67.8  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0636  protein of unknown function DUF1680  34.26 
 
 		 667 aa  67.8  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.788531 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1728  protein of unknown function DUF1680  28.48 
 
 		 675 aa  67.4  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.670849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4002  hypothetical protein  23.53 
 
 		 651 aa  67  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.563325 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2907  protein of unknown function DUF1680  26.49 
 
 		 659 aa  67  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0376366  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03438  conserved hypothetical protein  23.27 
 
 		 659 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4148  protein of unknown function DUF1680  29.59 
 
 		 652 aa  66.6  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.834889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1696  hypothetical protein  25.63 
 
 		 634 aa  66.2  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.298068 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3877  hypothetical protein  23.27 
 
 		 651 aa  66.6  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3619  protein of unknown function DUF1680  26.21 
 
 		 640 aa  66.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03389  hypothetical protein  25.17 
 
 		 667 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7232  protein of unknown function DUF1680  22.61 
 
 		 666 aa  65.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00213031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  33.08 
 
 		 794 aa  65.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  30.71 
 
 		 884 aa  64.7  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>