82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0910 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_0910  hypothetical protein  100 
 
 
665 aa  1402    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.027132  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4097  hypothetical protein  39.67 
 
 
672 aa  511  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121081  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2748  protein of unknown function DUF1680  40.09 
 
 
684 aa  501  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0072487  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2738  protein of unknown function DUF1680  39.47 
 
 
680 aa  490  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0391777  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2133  protein of unknown function DUF1680  39.67 
 
 
673 aa  492  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401427  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2215  protein of unknown function DUF1680  35.33 
 
 
638 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2242  protein of unknown function DUF1680  34.38 
 
 
652 aa  398  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2720  protein of unknown function DUF1680  33.9 
 
 
640 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0969  hypothetical protein  32.92 
 
 
634 aa  372  1e-101  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00300565  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0668  hypothetical protein  35.63 
 
 
620 aa  365  1e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4996  protein of unknown function DUF1680  33.98 
 
 
800 aa  360  3e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0292235  normal  0.0722722 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0643  hypothetical protein  34.3 
 
 
620 aa  353  5.9999999999999994e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000119693  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4148  protein of unknown function DUF1680  35.35 
 
 
652 aa  350  4e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.834889  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0502  protein of unknown function DUF1680  34.25 
 
 
617 aa  348  2e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.171957  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3909  hypothetical protein  30.63 
 
 
656 aa  347  5e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4952  hypothetical protein  30.63 
 
 
656 aa  343  5e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1126  protein of unknown function DUF1680  33.54 
 
 
628 aa  343  5.999999999999999e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03389  hypothetical protein  30.88 
 
 
667 aa  341  2e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03438  conserved hypothetical protein  30.88 
 
 
659 aa  342  2e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3619  protein of unknown function DUF1680  32.08 
 
 
640 aa  339  9e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7232  protein of unknown function DUF1680  31.37 
 
 
666 aa  336  5.999999999999999e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00213031  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4474  protein of unknown function DUF1680  32.48 
 
 
636 aa  335  1e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4835  protein of unknown function DUF1680  31.43 
 
 
648 aa  333  6e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3957  hypothetical protein  30.47 
 
 
651 aa  332  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  0.86497 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4002  hypothetical protein  30.63 
 
 
651 aa  331  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.563325 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4162  hypothetical protein  32.53 
 
 
640 aa  331  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.549846 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3893  hypothetical protein  30.47 
 
 
651 aa  330  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3907  protein of unknown function DUF1680  30.91 
 
 
648 aa  330  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.373018 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4064  hypothetical protein  30.47 
 
 
651 aa  330  6e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3877  hypothetical protein  30.47 
 
 
651 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4989  protein of unknown function DUF1680  31.55 
 
 
647 aa  329  1.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0192762 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6525  protein of unknown function DUF1680  31.15 
 
 
647 aa  326  8.000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0294245 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3930  protein of unknown function DUF1680  31.11 
 
 
640 aa  326  9e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0635  protein of unknown function DUF1680  31.52 
 
 
656 aa  322  9.999999999999999e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0591  hypothetical protein  30.93 
 
 
646 aa  319  1e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000770924  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4720  protein of unknown function DUF1680  31.89 
 
 
655 aa  317  5e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.827878  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2907  protein of unknown function DUF1680  31.25 
 
 
659 aa  309  9e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0376366  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01840  hypothetical protein  32.34 
 
 
643 aa  307  4.0000000000000004e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2143  hypothetical protein  29.55 
 
 
648 aa  307  4.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.56985  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1696  hypothetical protein  32.06 
 
 
634 aa  302  1e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.298068 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2831  protein of unknown function DUF1680  28.86 
 
 
629 aa  276  9e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1535  hypothetical protein  29.65 
 
 
742 aa  274  5.000000000000001e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0057  protein of unknown function DUF1680  27.53 
 
 
643 aa  264  4e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0839925 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1151  protein of unknown function DUF1680  34.54 
 
 
679 aa  262  2e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02820  hypothetical protein  28.77 
 
 
643 aa  254  5.000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.491149  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0407  protein of unknown function DUF1680  28.96 
 
 
633 aa  251  4e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3839  hypothetical protein  30.09 
 
 
654 aa  242  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254825  normal  0.0525361 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5347  protein of unknown function DUF1680  26.49 
 
 
686 aa  224  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611947  normal  0.22403 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05305  DUF1680 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G08910)  26.62 
 
 
629 aa  213  1e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0212  hypothetical protein  32.65 
 
 
397 aa  168  2.9999999999999998e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000517482  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3214  hypothetical protein  25.61 
 
 
844 aa  105  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.77483  normal  0.454399 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1254  protein of unknown function DUF1680  29.1 
 
 
684 aa  101  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.831647  normal  0.201869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2967  protein of unknown function DUF1680  30.91 
 
 
838 aa  99.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000186086  hitchhiker  0.000639223 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0164  hypothetical protein  26.5 
 
 
602 aa  97.1  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.935603  normal  0.0626406 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2035  protein of unknown function DUF1680  25.27 
 
 
678 aa  95.1  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1728  protein of unknown function DUF1680  28.93 
 
 
675 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.670849  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0320  hypothetical protein  23.36 
 
 
607 aa  92  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.280201  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1993  hypothetical protein  22.35 
 
 
795 aa  92  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0573537  hitchhiker  0.00434895 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0089  protein of unknown function DUF1680  21.36 
 
 
677 aa  88.2  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1982  hypothetical protein  23.09 
 
 
795 aa  88.6  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0591519  hitchhiker  0.000518937 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2080  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  21.84 
 
 
795 aa  87.4  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.254608  hitchhiker  0.00000268125 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0636  protein of unknown function DUF1680  26.01 
 
 
667 aa  85.9  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.788531 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  25.48 
 
 
955 aa  82  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4617  protein of unknown function DUF1680  24 
 
 
1025 aa  78.2  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602011  normal  0.370298 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0062  protein of unknown function DUF1680  23.79 
 
 
596 aa  78.6  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.560227 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01470  hypothetical protein  22.42 
 
 
783 aa  77.8  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1938  protein of unknown function DUF1680  22.97 
 
 
711 aa  77.4  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2153  protein of unknown function DUF1680  22.08 
 
 
792 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.299284  normal  0.0915146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1422  protein of unknown function DUF1680  20.22 
 
 
760 aa  76.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428296  normal  0.497833 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3876  hypothetical protein  19.46 
 
 
765 aa  74.3  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0478  protein of unknown function DUF1680  23.31 
 
 
641 aa  72.4  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.216473  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  24.4 
 
 
771 aa  69.3  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0778  Acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  27.44 
 
 
803 aa  68.2  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.163489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  21.61 
 
 
963 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2836  protein of unknown function DUF1680  25.69 
 
 
614 aa  65.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  25.19 
 
 
846 aa  57.8  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1480  protein of unknown function DUF1680  23.08 
 
 
632 aa  57.4  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311718  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3545  hypothetical protein  23.58 
 
 
663 aa  55.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.550366  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1342  hypothetical protein  21.81 
 
 
669 aa  53.9  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4712  protein of unknown function DUF1680  23.4 
 
 
881 aa  51.6  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0363  protein of unknown function DUF1680  25.64 
 
 
744 aa  49.7  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1194  protein of unknown function DUF1680  25.93 
 
 
749 aa  43.9  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  normal  0.159601 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>