63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1194 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1194  protein of unknown function DUF1680  100 
 
 
749 aa  1464    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11690  hypothetical protein  62.23 
 
 
752 aa  871    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0778  Acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  40.85 
 
 
803 aa  540  9.999999999999999e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.163489 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1422  protein of unknown function DUF1680  40.29 
 
 
760 aa  536  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428296  normal  0.497833 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3876  hypothetical protein  35.48 
 
 
765 aa  514  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2153  protein of unknown function DUF1680  37.81 
 
 
792 aa  515  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.299284  normal  0.0915146 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1993  hypothetical protein  39.34 
 
 
795 aa  509  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0573537  hitchhiker  0.00434895 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1982  hypothetical protein  39.34 
 
 
795 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0591519  hitchhiker  0.000518937 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2080  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  39.42 
 
 
795 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.254608  hitchhiker  0.00000268125 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0363  protein of unknown function DUF1680  41.5 
 
 
744 aa  473  1e-132  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3214  hypothetical protein  43.61 
 
 
844 aa  451  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.77483  normal  0.454399 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0478  protein of unknown function DUF1680  37.98 
 
 
641 aa  368  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.216473  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01470  hypothetical protein  34.47 
 
 
783 aa  306  1.0000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  28.71 
 
 
955 aa  266  7e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  33.66 
 
 
771 aa  239  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2836  protein of unknown function DUF1680  35.81 
 
 
614 aa  233  8.000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  32.53 
 
 
846 aa  218  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4712  protein of unknown function DUF1680  31.07 
 
 
881 aa  174  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0997  protein of unknown function DUF1680  26.29 
 
 
597 aa  155  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4617  protein of unknown function DUF1680  24.66 
 
 
1025 aa  148  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602011  normal  0.370298 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0320  hypothetical protein  26.05 
 
 
607 aa  109  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.280201  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0164  hypothetical protein  25.09 
 
 
602 aa  84  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.935603  normal  0.0626406 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3930  protein of unknown function DUF1680  32.82 
 
 
640 aa  79.3  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1938  protein of unknown function DUF1680  27.58 
 
 
711 aa  76.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1859  protein of unknown function DUF1680  27.56 
 
 
736 aa  69.3  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3893  hypothetical protein  26.47 
 
 
651 aa  67.8  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4064  hypothetical protein  26.27 
 
 
651 aa  67.4  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4720  protein of unknown function DUF1680  24.14 
 
 
655 aa  67.4  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.827878  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3957  hypothetical protein  26.27 
 
 
651 aa  66.6  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  0.86497 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4002  hypothetical protein  26.89 
 
 
651 aa  67  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.563325 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3877  hypothetical protein  26.27 
 
 
651 aa  66.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4835  protein of unknown function DUF1680  24.1 
 
 
648 aa  63.9  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4097  hypothetical protein  23.88 
 
 
672 aa  61.2  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121081  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3909  hypothetical protein  25.85 
 
 
656 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.921384 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03438  conserved hypothetical protein  25.32 
 
 
659 aa  58.9  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03389  hypothetical protein  25.32 
 
 
667 aa  58.9  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0062  protein of unknown function DUF1680  25.04 
 
 
596 aa  58.5  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.560227 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4952  hypothetical protein  25.21 
 
 
656 aa  58.5  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4474  protein of unknown function DUF1680  28.63 
 
 
636 aa  58.2  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7232  protein of unknown function DUF1680  23.91 
 
 
666 aa  57.8  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00213031  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01840  hypothetical protein  30.36 
 
 
643 aa  57  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2720  protein of unknown function DUF1680  25.74 
 
 
640 aa  55.8  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2133  protein of unknown function DUF1680  25.8 
 
 
673 aa  54.3  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401427  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0643  hypothetical protein  26.58 
 
 
620 aa  53.9  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000119693  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0635  protein of unknown function DUF1680  23.89 
 
 
656 aa  53.5  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4996  protein of unknown function DUF1680  24.58 
 
 
800 aa  53.9  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0292235  normal  0.0722722 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1151  protein of unknown function DUF1680  29.78 
 
 
679 aa  52.4  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3619  protein of unknown function DUF1680  29.61 
 
 
640 aa  51.6  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6525  protein of unknown function DUF1680  25.78 
 
 
647 aa  51.2  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0294245 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3907  protein of unknown function DUF1680  28.76 
 
 
648 aa  50.8  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.373018 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4148  protein of unknown function DUF1680  26.13 
 
 
652 aa  50.8  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.834889  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2143  hypothetical protein  28.32 
 
 
648 aa  50.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.56985  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5347  protein of unknown function DUF1680  24.07 
 
 
686 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611947  normal  0.22403 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0668  hypothetical protein  26.58 
 
 
620 aa  49.3  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2738  protein of unknown function DUF1680  26.97 
 
 
680 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0391777  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4989  protein of unknown function DUF1680  25.45 
 
 
647 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0192762 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2215  protein of unknown function DUF1680  26.61 
 
 
638 aa  48.9  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0969  hypothetical protein  24.49 
 
 
634 aa  48.9  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00300565  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1696  hypothetical protein  26.86 
 
 
634 aa  47.4  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.298068 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0591  hypothetical protein  22.31 
 
 
646 aa  47.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000770924  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3839  hypothetical protein  25.37 
 
 
654 aa  45.8  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254825  normal  0.0525361 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2242  protein of unknown function DUF1680  23.41 
 
 
652 aa  45.4  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2748  protein of unknown function DUF1680  24.35 
 
 
684 aa  45.4  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0072487  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>