91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4996 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1696  hypothetical protein  54.85 
 
 		 634 aa  727    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.298068 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7232  protein of unknown function DUF1680  51.33 
 
 		 666 aa  686    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00213031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4996  protein of unknown function DUF1680  100 
 
 		 800 aa  1675    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0292235  normal  0.0722722 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4720  protein of unknown function DUF1680  47.08 
 
 		 655 aa  617  1e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.827878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4835  protein of unknown function DUF1680  46.96 
 
 		 648 aa  585  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0635  protein of unknown function DUF1680  45.27 
 
 		 656 aa  541  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2215  protein of unknown function DUF1680  41.19 
 
 		 638 aa  479  1e-133  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0668  hypothetical protein  38.89 
 
 		 620 aa  464  1e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0643  hypothetical protein  38.33 
 
 		 620 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000119693  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4474  protein of unknown function DUF1680  37.84 
 
 		 636 aa  459  1e-127  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2720  protein of unknown function DUF1680  38.52 
 
 		 640 aa  456  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0502  protein of unknown function DUF1680  39.27 
 
 		 617 aa  443  1e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.171957  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0969  hypothetical protein  36.46 
 
 		 634 aa  437  1e-121  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00300565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3930  protein of unknown function DUF1680  38.74 
 
 		 640 aa  427  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2242  protein of unknown function DUF1680  36.36 
 
 		 652 aa  415  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3619  protein of unknown function DUF1680  37.18 
 
 		 640 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6525  protein of unknown function DUF1680  35.42 
 
 		 647 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0294245 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3907  protein of unknown function DUF1680  36.86 
 
 		 648 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.373018 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4162  hypothetical protein  37.22 
 
 		 640 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549846 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1126  protein of unknown function DUF1680  36.84 
 
 		 628 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2907  protein of unknown function DUF1680  35.54 
 
 		 659 aa  400  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0376366  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2738  protein of unknown function DUF1680  35.24 
 
 		 680 aa  392  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0391777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3893  hypothetical protein  33.53 
 
 		 651 aa  389  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3877  hypothetical protein  33.53 
 
 		 651 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3957  hypothetical protein  33.68 
 
 		 651 aa  389  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  0.86497 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4002  hypothetical protein  33.38 
 
 		 651 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.563325 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4064  hypothetical protein  33.53 
 
 		 651 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2143  hypothetical protein  34.55 
 
 		 648 aa  389  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.56985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4989  protein of unknown function DUF1680  35.09 
 
 		 647 aa  385  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0192762 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4952  hypothetical protein  32.79 
 
 		 656 aa  380  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03389  hypothetical protein  32.49 
 
 		 667 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03438  conserved hypothetical protein  32.5 
 
 		 659 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3909  hypothetical protein  32.49 
 
 		 656 aa  377  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2133  protein of unknown function DUF1680  34.39 
 
 		 673 aa  368  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2748  protein of unknown function DUF1680  32.62 
 
 		 684 aa  369  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0072487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0591  hypothetical protein  33.53 
 
 		 646 aa  364  3e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000770924  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0910  hypothetical protein  33.98 
 
 		 665 aa  360  4e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.027132  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5347  protein of unknown function DUF1680  34.72 
 
 		 686 aa  352  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611947  normal  0.22403 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4148  protein of unknown function DUF1680  35.74 
 
 		 652 aa  352  2e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.834889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4097  hypothetical protein  33.19 
 
 		 672 aa  348  2e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121081  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1535  hypothetical protein  35.34 
 
 		 742 aa  335  2e-90  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0057  protein of unknown function DUF1680  33.17 
 
 		 643 aa  324  3e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0839925 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1151  protein of unknown function DUF1680  39.37 
 
 		 679 aa  319  1e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02820  hypothetical protein  31.39 
 
 		 643 aa  302  1e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.491149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01840  hypothetical protein  31.74 
 
 		 643 aa  295  2e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05305  DUF1680 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G08910)  31.36 
 
 		 629 aa  293  1e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2831  protein of unknown function DUF1680  30 
 
 		 629 aa  284  4.0000000000000003e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0407  protein of unknown function DUF1680  29.16 
 
 		 633 aa  278  2e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3839  hypothetical protein  30.21 
 
 		 654 aa  264  4.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254825  normal  0.0525361 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0212  hypothetical protein  36.18 
 
 		 397 aa  229  2e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000517482  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0778  Acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  27.64 
 
 		 803 aa  117  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.163489 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1422  protein of unknown function DUF1680  24.87 
 
 		 760 aa  106  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428296  normal  0.497833 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3876  hypothetical protein  24.17 
 
 		 765 aa  103  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3214  hypothetical protein  23.88 
 
 		 844 aa  102  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.77483  normal  0.454399 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2080  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  25.6 
 
 		 795 aa  100  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.254608  hitchhiker  0.00000268125 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1982  hypothetical protein  25.6 
 
 		 795 aa  100  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0591519  hitchhiker  0.000518937 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1993  hypothetical protein  25.89 
 
 		 795 aa  100  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0573537  hitchhiker  0.00434895 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0478  protein of unknown function DUF1680  24.04 
 
 		 641 aa  97.4  9e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.216473  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0164  hypothetical protein  27.48 
 
 		 602 aa  96.3  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.935603  normal  0.0626406 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  22.04 
 
 		 955 aa  93.6  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0636  protein of unknown function DUF1680  26.77 
 
 		 667 aa  91.3  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.788531 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2153  protein of unknown function DUF1680  26.9 
 
 		 792 aa  90.5  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.299284  normal  0.0915146 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4617  protein of unknown function DUF1680  24.06 
 
 		 1025 aa  89.7  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602011  normal  0.370298 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1254  protein of unknown function DUF1680  24.61 
 
 		 684 aa  86.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.831647  normal  0.201869 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0320  hypothetical protein  24.32 
 
 		 607 aa  84  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.280201  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1938  protein of unknown function DUF1680  24.66 
 
 		 711 aa  84  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1728  protein of unknown function DUF1680  23.03 
 
 		 675 aa  82  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.670849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2035  protein of unknown function DUF1680  24.42 
 
 		 678 aa  80.1  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337709 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01470  hypothetical protein  22.64 
 
 		 783 aa  77  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4545  hypothetical protein  33.06 
 
 		 772 aa  76.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.402962  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2836  protein of unknown function DUF1680  23.81 
 
 		 614 aa  74.7  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4712  protein of unknown function DUF1680  24.62 
 
 		 881 aa  71.2  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  23.84 
 
 		 771 aa  67.8  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0089  protein of unknown function DUF1680  23.66 
 
 		 677 aa  67.4  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2967  protein of unknown function DUF1680  25.53 
 
 		 838 aa  65.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000186086  hitchhiker  0.000639223 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0363  protein of unknown function DUF1680  24.24 
 
 		 744 aa  63.5  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2448  putative secreted protein  31.09 
 
 		 1363 aa  63.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.903982 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0569  hypothetical protein  31.65 
 
 		 781 aa  62  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.220084 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0997  protein of unknown function DUF1680  19.79 
 
 		 597 aa  62  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  28.69 
 
 		 468 aa  58.9  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  23.08 
 
 		 846 aa  57  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1859  protein of unknown function DUF1680  26.46 
 
 		 736 aa  57  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0062  protein of unknown function DUF1680  21.38 
 
 		 596 aa  55.1  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.560227 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1194  protein of unknown function DUF1680  24.58 
 
 		 749 aa  53.9  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  25.95 
 
 		 527 aa  53.1  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1143  PKD domain containing protein  25.66 
 
 		 1309 aa  51.6  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1342  hypothetical protein  23.4 
 
 		 669 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1480  protein of unknown function DUF1680  22.99 
 
 		 632 aa  50.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01458  hypothetical protein  25.79 
 
 		 1419 aa  48.5  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.523698  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  21.43 
 
 		 963 aa  47.8  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3545  hypothetical protein  21.86 
 
 		 663 aa  47  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.550366  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>