84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B3893 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03438  conserved hypothetical protein  86 
 
 
659 aa  1204    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2720  protein of unknown function DUF1680  51.85 
 
 
640 aa  698    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2907  protein of unknown function DUF1680  48.71 
 
 
659 aa  636    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0376366  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03389  hypothetical protein  86 
 
 
667 aa  1204    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4952  hypothetical protein  86.46 
 
 
656 aa  1209    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4064  hypothetical protein  99.08 
 
 
651 aa  1352    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3893  hypothetical protein  100 
 
 
651 aa  1367    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3877  hypothetical protein  99.23 
 
 
651 aa  1357    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4002  hypothetical protein  99.08 
 
 
651 aa  1358    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.563325 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3957  hypothetical protein  99.54 
 
 
651 aa  1362    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  0.86497 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3909  hypothetical protein  87.08 
 
 
656 aa  1215    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2242  protein of unknown function DUF1680  46.26 
 
 
652 aa  632  1e-180  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0591  hypothetical protein  45.71 
 
 
646 aa  600  1e-170  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000770924  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1535  hypothetical protein  42.05 
 
 
742 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3619  protein of unknown function DUF1680  41.68 
 
 
640 aa  500  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3907  protein of unknown function DUF1680  41.76 
 
 
648 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.373018 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4162  hypothetical protein  40.52 
 
 
640 aa  494  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.549846 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2143  hypothetical protein  38.59 
 
 
648 aa  490  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.56985  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6525  protein of unknown function DUF1680  38.69 
 
 
647 aa  481  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0294245 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4474  protein of unknown function DUF1680  40.36 
 
 
636 aa  476  1e-133  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2215  protein of unknown function DUF1680  40.92 
 
 
638 aa  478  1e-133  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3930  protein of unknown function DUF1680  38.98 
 
 
640 aa  471  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0635  protein of unknown function DUF1680  40.73 
 
 
656 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0502  protein of unknown function DUF1680  37.63 
 
 
617 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.171957  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0668  hypothetical protein  37.8 
 
 
620 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0643  hypothetical protein  37.52 
 
 
620 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000119693  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1126  protein of unknown function DUF1680  38.07 
 
 
628 aa  421  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4989  protein of unknown function DUF1680  37.61 
 
 
647 aa  420  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0192762 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0969  hypothetical protein  34.78 
 
 
634 aa  406  1.0000000000000001e-112  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00300565  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4835  protein of unknown function DUF1680  36.11 
 
 
648 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4720  protein of unknown function DUF1680  35.25 
 
 
655 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.827878  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7232  protein of unknown function DUF1680  34.13 
 
 
666 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00213031  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4996  protein of unknown function DUF1680  33.53 
 
 
800 aa  389  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0292235  normal  0.0722722 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0212  hypothetical protein  46.43 
 
 
397 aa  369  1e-101  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000517482  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1696  hypothetical protein  34.82 
 
 
634 aa  370  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.298068 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05305  DUF1680 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G08910)  32.49 
 
 
629 aa  349  1e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4148  protein of unknown function DUF1680  36.06 
 
 
652 aa  344  4e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.834889  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2738  protein of unknown function DUF1680  30.88 
 
 
680 aa  342  1e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0391777  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2748  protein of unknown function DUF1680  31.34 
 
 
684 aa  342  2e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0072487  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0910  hypothetical protein  30.47 
 
 
665 aa  330  4e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.027132  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2133  protein of unknown function DUF1680  28.64 
 
 
673 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401427  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4097  hypothetical protein  30.7 
 
 
672 aa  326  8.000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121081  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0057  protein of unknown function DUF1680  31.59 
 
 
643 aa  314  2.9999999999999996e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0839925 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5347  protein of unknown function DUF1680  31.6 
 
 
686 aa  310  4e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611947  normal  0.22403 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01840  hypothetical protein  32.15 
 
 
643 aa  299  9e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02820  hypothetical protein  31 
 
 
643 aa  299  9e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.491149  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0407  protein of unknown function DUF1680  30.62 
 
 
633 aa  291  2e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1151  protein of unknown function DUF1680  35.78 
 
 
679 aa  285  2.0000000000000002e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3839  hypothetical protein  34.21 
 
 
654 aa  280  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254825  normal  0.0525361 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2831  protein of unknown function DUF1680  31.62 
 
 
629 aa  278  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0164  hypothetical protein  29.85 
 
 
602 aa  114  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.935603  normal  0.0626406 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0320  hypothetical protein  29.02 
 
 
607 aa  113  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.280201  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1938  protein of unknown function DUF1680  26.36 
 
 
711 aa  103  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0478  protein of unknown function DUF1680  23.32 
 
 
641 aa  102  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.216473  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  27.8 
 
 
955 aa  98.6  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2967  protein of unknown function DUF1680  26.93 
 
 
838 aa  96.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000186086  hitchhiker  0.000639223 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01470  hypothetical protein  24.41 
 
 
783 aa  95.5  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1254  protein of unknown function DUF1680  25.3 
 
 
684 aa  92.8  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.831647  normal  0.201869 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3214  hypothetical protein  24.58 
 
 
844 aa  89.4  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.77483  normal  0.454399 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2080  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  26.22 
 
 
795 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.254608  hitchhiker  0.00000268125 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1422  protein of unknown function DUF1680  23.24 
 
 
760 aa  86.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428296  normal  0.497833 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1993  hypothetical protein  25.52 
 
 
795 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0573537  hitchhiker  0.00434895 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1982  hypothetical protein  25.52 
 
 
795 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0591519  hitchhiker  0.000518937 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0778  Acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  24.15 
 
 
803 aa  84.3  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.163489 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3545  hypothetical protein  22.51 
 
 
663 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.550366  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1728  protein of unknown function DUF1680  26.67 
 
 
675 aa  80.9  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.670849  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3876  hypothetical protein  19.58 
 
 
765 aa  80.5  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  24.9 
 
 
963 aa  80.1  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2836  protein of unknown function DUF1680  25.93 
 
 
614 aa  79.7  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1342  hypothetical protein  22.63 
 
 
669 aa  79.3  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4617  protein of unknown function DUF1680  21.63 
 
 
1025 aa  79.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602011  normal  0.370298 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0089  protein of unknown function DUF1680  22.69 
 
 
677 aa  79.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2153  protein of unknown function DUF1680  23.38 
 
 
792 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.299284  normal  0.0915146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2035  protein of unknown function DUF1680  22.13 
 
 
678 aa  76.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337709 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0636  protein of unknown function DUF1680  22.27 
 
 
667 aa  75.5  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.788531 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  24.54 
 
 
846 aa  69.3  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  23.53 
 
 
771 aa  68.2  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1194  protein of unknown function DUF1680  26.47 
 
 
749 aa  67.8  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1480  protein of unknown function DUF1680  23.7 
 
 
632 aa  65.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311718  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0062  protein of unknown function DUF1680  21.69 
 
 
596 aa  63.9  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.560227 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11690  hypothetical protein  22.74 
 
 
752 aa  55.1  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0363  protein of unknown function DUF1680  23.83 
 
 
744 aa  52.4  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0997  protein of unknown function DUF1680  20.49 
 
 
597 aa  50.4  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4712  protein of unknown function DUF1680  24.07 
 
 
881 aa  44.3  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>