65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0363 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0363  protein of unknown function DUF1680  100 
 
 		 744 aa  1507    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1422  protein of unknown function DUF1680  40.75 
 
 		 760 aa  545  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428296  normal  0.497833 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3876  hypothetical protein  37.9 
 
 		 765 aa  541  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0778  Acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  39.72 
 
 		 803 aa  525  1e-147  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.163489 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2153  protein of unknown function DUF1680  39.95 
 
 		 792 aa  514  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.299284  normal  0.0915146 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1993  hypothetical protein  41.08 
 
 		 795 aa  513  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0573537  hitchhiker  0.00434895 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2080  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  40.91 
 
 		 795 aa  514  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.254608  hitchhiker  0.00000268125 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1982  hypothetical protein  41.08 
 
 		 795 aa  511  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0591519  hitchhiker  0.000518937 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1194  protein of unknown function DUF1680  41.26 
 
 		 749 aa  479  1e-134  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11690  hypothetical protein  40.89 
 
 		 752 aa  473  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3214  hypothetical protein  39.92 
 
 		 844 aa  461  9.999999999999999e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.77483  normal  0.454399 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0478  protein of unknown function DUF1680  38.28 
 
 		 641 aa  376  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.216473  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01470  hypothetical protein  33.75 
 
 		 783 aa  292  1e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2836  protein of unknown function DUF1680  34.88 
 
 		 614 aa  276  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  32.51 
 
 		 955 aa  273  1e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  33.81 
 
 		 771 aa  270  7e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  32.45 
 
 		 846 aa  261  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4617  protein of unknown function DUF1680  28.42 
 
 		 1025 aa  180  8e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602011  normal  0.370298 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4712  protein of unknown function DUF1680  29.26 
 
 		 881 aa  142  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0997  protein of unknown function DUF1680  23.88 
 
 		 597 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0320  hypothetical protein  24.09 
 
 		 607 aa  102  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.280201  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1859  protein of unknown function DUF1680  31.3 
 
 		 736 aa  99.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0164  hypothetical protein  25.55 
 
 		 602 aa  94.4  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.935603  normal  0.0626406 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5347  protein of unknown function DUF1680  25.8 
 
 		 686 aa  72.4  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611947  normal  0.22403 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1696  hypothetical protein  26.32 
 
 		 634 aa  72  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.298068 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0062  protein of unknown function DUF1680  26.53 
 
 		 596 aa  71.6  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.560227 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2907  protein of unknown function DUF1680  26.63 
 
 		 659 aa  68.9  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0376366  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2215  protein of unknown function DUF1680  24.21 
 
 		 638 aa  67  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2242  protein of unknown function DUF1680  23.98 
 
 		 652 aa  65.9  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0643  hypothetical protein  24.14 
 
 		 620 aa  64.3  0.000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000119693  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4996  protein of unknown function DUF1680  24.24 
 
 		 800 aa  63.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0292235  normal  0.0722722 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0668  hypothetical protein  23.86 
 
 		 620 aa  62  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2720  protein of unknown function DUF1680  25.94 
 
 		 640 aa  61.6  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4989  protein of unknown function DUF1680  26.33 
 
 		 647 aa  61.2  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0192762 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4720  protein of unknown function DUF1680  24.74 
 
 		 655 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.827878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0969  hypothetical protein  24 
 
 		 634 aa  57.8  0.0000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00300565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3930  protein of unknown function DUF1680  30.59 
 
 		 640 aa  57.4  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0502  protein of unknown function DUF1680  23.26 
 
 		 617 aa  57.4  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.171957  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4162  hypothetical protein  24.57 
 
 		 640 aa  56.2  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549846 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3907  protein of unknown function DUF1680  27.65 
 
 		 648 aa  55.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.373018 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3619  protein of unknown function DUF1680  27.19 
 
 		 640 aa  55.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01840  hypothetical protein  24.39 
 
 		 643 aa  55.1  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4474  protein of unknown function DUF1680  25 
 
 		 636 aa  54.7  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3839  hypothetical protein  25.27 
 
 		 654 aa  53.5  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254825  normal  0.0525361 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2831  protein of unknown function DUF1680  25.06 
 
 		 629 aa  53.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2748  protein of unknown function DUF1680  22.96 
 
 		 684 aa  52.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0072487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4064  hypothetical protein  23.83 
 
 		 651 aa  52.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3893  hypothetical protein  23.83 
 
 		 651 aa  52  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4148  protein of unknown function DUF1680  25.17 
 
 		 652 aa  52  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.834889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3877  hypothetical protein  23.83 
 
 		 651 aa  52  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3957  hypothetical protein  23.83 
 
 		 651 aa  51.6  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  0.86497 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4002  hypothetical protein  24.26 
 
 		 651 aa  51.2  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.563325 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03438  conserved hypothetical protein  23.4 
 
 		 659 aa  50.8  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7232  protein of unknown function DUF1680  21.49 
 
 		 666 aa  50.8  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00213031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03389  hypothetical protein  23.4 
 
 		 667 aa  50.8  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4952  hypothetical protein  23.4 
 
 		 656 aa  50.8  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3909  hypothetical protein  23.4 
 
 		 656 aa  50.8  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0910  hypothetical protein  25.64 
 
 		 665 aa  49.7  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.027132  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2133  protein of unknown function DUF1680  23.33 
 
 		 673 aa  49.3  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4835  protein of unknown function DUF1680  23.26 
 
 		 648 aa  48.5  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2143  hypothetical protein  26.79 
 
 		 648 aa  48.1  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.56985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1535  hypothetical protein  24.23 
 
 		 742 aa  48.1  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0635  protein of unknown function DUF1680  22.66 
 
 		 656 aa  47.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6525  protein of unknown function DUF1680  25.34 
 
 		 647 aa  45.8  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0294245 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1126  protein of unknown function DUF1680  22.53 
 
 		 628 aa  45.4  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>