175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1428 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2130  hypothetical protein  48.46 
 
 		 758 aa  689    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.251457  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  100 
 
 		 1139 aa  2308    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7891  Endo-1,3(4)-beta-glucanase  51.96 
 
 		 971 aa  707    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.798967  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3302  glycoside hydrolase family 81  45.36 
 
 		 931 aa  650    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0660  glycoside hydrolase family protein  44.93 
 
 		 773 aa  595  1e-168  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1332  Endo-1,3(4)-beta-glucanase  43.17 
 
 		 1010 aa  556  1e-157  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137473  hitchhiker  0.00217358 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  39.03 
 
 		 1067 aa  509  9.999999999999999e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2834  glycosyl hydrolase-like  31.04 
 
 		 1238 aa  316  1.9999999999999998e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00529602  normal  0.0523238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2796  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.01 
 
 		 1139 aa  233  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.151007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1836  Endo-1,3(4)-beta-glucanase  31.59 
 
 		 699 aa  217  9e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000209584  normal  0.179835 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  55.42 
 
 		 1887 aa  189  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3152  Endo-1,3(4)-beta-glucanase  30.92 
 
 		 704 aa  165  5.0000000000000005e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.486668  hitchhiker  0.00279452 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0396  glycoside hydrolase family 81  26.96 
 
 		 638 aa  150  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.803037  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00472  putative endo beta 1,3 glucanase, GH81 family (Eurofung)  34.17 
 
 		 907 aa  138  6.0000000000000005e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.981548  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  50 
 
 		 401 aa  137  8e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  47.55 
 
 		 491 aa  137  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64411  endo-1,3-beta-glucanase Daughter Specific Expression 4  29.54 
 
 		 969 aa  134  1.0000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.644497 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42567  beta-glucan elicitor receptor  30.03 
 
 		 1208 aa  134  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.453891  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  44.81 
 
 		 474 aa  134  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  47.59 
 
 		 495 aa  128  7e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  46 
 
 		 507 aa  126  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  43.84 
 
 		 691 aa  124  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  48 
 
 		 430 aa  123  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.25 
 
 		 466 aa  123  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42898  endo-1,3-beta-glucanase  30.38 
 
 		 1058 aa  121  7.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.127603  normal  0.94847 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  47.01 
 
 		 436 aa  119  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  42.28 
 
 		 412 aa  118  7.999999999999999e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  37.91 
 
 		 563 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  42.95 
 
 		 2073 aa  116  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  43.15 
 
 		 520 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  43.88 
 
 		 411 aa  115  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  38.89 
 
 		 695 aa  115  7.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  41.48 
 
 		 476 aa  111  7.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  41.73 
 
 		 957 aa  111  7.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0232  Endo-1,3(4)-beta-glucanase  32.36 
 
 		 729 aa  111  8.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  43.17 
 
 		 571 aa  109  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  41.43 
 
 		 884 aa  110  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4332  Ricin B lectin  42.86 
 
 		 615 aa  109  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.817761  normal  0.0720026 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60116  endo-1,3-beta- glucanase  29.33 
 
 		 755 aa  108  7e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  29.17 
 
 		 1259 aa  108  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  41.73 
 
 		 566 aa  107  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  35.59 
 
 		 1413 aa  107  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  41.73 
 
 		 497 aa  106  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5674  Ricin B lectin  35.6 
 
 		 425 aa  106  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510311 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  31.37 
 
 		 789 aa  104  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  39.86 
 
 		 472 aa  103  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  38.36 
 
 		 863 aa  102  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  42.86 
 
 		 1187 aa  102  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  38.24 
 
 		 672 aa  99.8  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  36.91 
 
 		 982 aa  99.4  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  40.61 
 
 		 647 aa  98.6  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  40 
 
 		 560 aa  97.1  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0329  Pectate lyase  38.55 
 
 		 445 aa  95.5  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0745769 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  41.01 
 
 		 537 aa  95.1  7e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  41.13 
 
 		 582 aa  93.2  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1703  hypothetical protein  36.69 
 
 		 392 aa  92.4  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.595343 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0859  Ricin B lectin  37.68 
 
 		 483 aa  92.4  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  36.73 
 
 		 514 aa  90.9  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  34.75 
 
 		 569 aa  90.5  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  35.37 
 
 		 507 aa  90.5  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  38.13 
 
 		 943 aa  90.1  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  36.99 
 
 		 648 aa  89.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  37.96 
 
 		 507 aa  89  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.05 
 
 		 507 aa  89  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  38.62 
 
 		 494 aa  87.8  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 503 aa  87  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3068  Ricin B lectin  33.11 
 
 		 489 aa  84.7  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  35.58 
 
 		 474 aa  83.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6977  hypothetical protein  36.23 
 
 		 897 aa  82.8  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449457  normal  0.690746 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  33.91 
 
 		 503 aa  81.6  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  33.81 
 
 		 510 aa  81.6  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2967  Ricin B lectin  31.72 
 
 		 230 aa  79.7  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1625  Ricin B lectin  35.42 
 
 		 664 aa  79  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174665  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  35.77 
 
 		 618 aa  78.2  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  37.04 
 
 		 487 aa  76.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  32.84 
 
 		 493 aa  75.5  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  35.51 
 
 		 771 aa  74.3  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  38.58 
 
 		 492 aa  74.3  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  34.04 
 
 		 737 aa  73.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  34.84 
 
 		 963 aa  73.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46976  endo-1,3-beta-glucosidase  28.63 
 
 		 918 aa  70.9  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  38.4 
 
 		 489 aa  70.1  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  32.33 
 
 		 1567 aa  69.7  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  34.06 
 
 		 663 aa  65.9  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  32.08 
 
 		 794 aa  65.9  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.16 
 
 		 756 aa  65.5  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  30.77 
 
 		 487 aa  65.5  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  37.12 
 
 		 489 aa  65.5  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  32.56 
 
 		 806 aa  64.7  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  32.56 
 
 		 806 aa  64.7  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  32.56 
 
 		 806 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  32.56 
 
 		 806 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  32.56 
 
 		 806 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  32.56 
 
 		 806 aa  64.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  32.56 
 
 		 806 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  35.2 
 
 		 801 aa  63.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  31.5 
 
 		 1141 aa  62.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 469 aa  63.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  28.86 
 
 		 644 aa  62.4  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  31.98 
 
 		 374 aa  62.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>