51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_11690 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1194  protein of unknown function DUF1680  62 
 
 
749 aa  878    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11690  hypothetical protein  100 
 
 
752 aa  1498    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0778  Acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  37.4 
 
 
803 aa  527  1e-148  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.163489 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1993  hypothetical protein  38.42 
 
 
795 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0573537  hitchhiker  0.00434895 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1982  hypothetical protein  38.42 
 
 
795 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0591519  hitchhiker  0.000518937 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2080  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  38.28 
 
 
795 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.254608  hitchhiker  0.00000268125 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2153  protein of unknown function DUF1680  38.67 
 
 
792 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.299284  normal  0.0915146 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3876  hypothetical protein  37.54 
 
 
765 aa  506  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1422  protein of unknown function DUF1680  37.03 
 
 
760 aa  508  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428296  normal  0.497833 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0363  protein of unknown function DUF1680  41.17 
 
 
744 aa  483  1e-135  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3214  hypothetical protein  40.27 
 
 
844 aa  431  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.77483  normal  0.454399 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0478  protein of unknown function DUF1680  37.83 
 
 
641 aa  365  2e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.216473  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01470  hypothetical protein  32.7 
 
 
783 aa  296  9e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  29.14 
 
 
955 aa  271  2.9999999999999997e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2836  protein of unknown function DUF1680  33.72 
 
 
614 aa  242  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  31.75 
 
 
771 aa  236  9e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  30.46 
 
 
846 aa  221  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4712  protein of unknown function DUF1680  30.51 
 
 
881 aa  165  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0997  protein of unknown function DUF1680  24.07 
 
 
597 aa  161  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4617  protein of unknown function DUF1680  26.18 
 
 
1025 aa  153  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602011  normal  0.370298 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0320  hypothetical protein  25.23 
 
 
607 aa  109  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.280201  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1859  protein of unknown function DUF1680  29.57 
 
 
736 aa  75.5  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1938  protein of unknown function DUF1680  25.21 
 
 
711 aa  73.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0164  hypothetical protein  22.71 
 
 
602 aa  73.2  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.935603  normal  0.0626406 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03438  conserved hypothetical protein  24.19 
 
 
659 aa  61.2  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03389  hypothetical protein  24.19 
 
 
667 aa  61.2  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3909  hypothetical protein  23.83 
 
 
656 aa  60.8  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4952  hypothetical protein  23.83 
 
 
656 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2242  protein of unknown function DUF1680  22.09 
 
 
652 aa  59.7  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3930  protein of unknown function DUF1680  26.29 
 
 
640 aa  57.8  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4720  protein of unknown function DUF1680  23.39 
 
 
655 aa  57  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.827878  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4474  protein of unknown function DUF1680  27.75 
 
 
636 aa  56.6  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4835  protein of unknown function DUF1680  20.66 
 
 
648 aa  55.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3893  hypothetical protein  22.74 
 
 
651 aa  54.7  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3957  hypothetical protein  22.74 
 
 
651 aa  54.7  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  0.86497 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4002  hypothetical protein  23.1 
 
 
651 aa  54.7  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.563325 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3877  hypothetical protein  22.74 
 
 
651 aa  53.5  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1151  protein of unknown function DUF1680  30 
 
 
679 aa  53.5  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0635  protein of unknown function DUF1680  23.65 
 
 
656 aa  52.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4064  hypothetical protein  23.27 
 
 
651 aa  52.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2907  protein of unknown function DUF1680  24 
 
 
659 aa  49.7  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0376366  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2143  hypothetical protein  23.1 
 
 
648 aa  46.2  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.56985  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0643  hypothetical protein  23.62 
 
 
620 aa  46.2  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000119693  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7232  protein of unknown function DUF1680  21.6 
 
 
666 aa  45.8  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00213031  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01840  hypothetical protein  28.33 
 
 
643 aa  45.4  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3907  protein of unknown function DUF1680  22.55 
 
 
648 aa  45.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.373018 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0668  hypothetical protein  21.9 
 
 
620 aa  45.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4162  hypothetical protein  22.06 
 
 
640 aa  44.7  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.549846 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0062  protein of unknown function DUF1680  26.89 
 
 
596 aa  44.7  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.560227 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1696  hypothetical protein  24.29 
 
 
634 aa  44.7  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.298068 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3619  protein of unknown function DUF1680  23.68 
 
 
640 aa  44.7  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>