84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4064 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03438  conserved hypothetical protein  86 
 
 		 659 aa  1202    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2720  protein of unknown function DUF1680  52.01 
 
 		 640 aa  700    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03389  hypothetical protein  86 
 
 		 667 aa  1203    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4952  hypothetical protein  86.46 
 
 		 656 aa  1208    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4064  hypothetical protein  100 
 
 		 651 aa  1365    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3893  hypothetical protein  99.08 
 
 		 651 aa  1352    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3877  hypothetical protein  99.08 
 
 		 651 aa  1351    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4002  hypothetical protein  98.77 
 
 		 651 aa  1351    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.563325 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3957  hypothetical protein  98.77 
 
 		 651 aa  1350    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  0.86497 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3909  hypothetical protein  87.08 
 
 		 656 aa  1213    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2907  protein of unknown function DUF1680  48.55 
 
 		 659 aa  633  1e-180  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0376366  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2242  protein of unknown function DUF1680  46.42 
 
 		 652 aa  634  1e-180  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0591  hypothetical protein  45.55 
 
 		 646 aa  596  1e-169  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000770924  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1535  hypothetical protein  41.86 
 
 		 742 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3619  protein of unknown function DUF1680  41.27 
 
 		 640 aa  500  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3907  protein of unknown function DUF1680  40.98 
 
 		 648 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.373018 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4162  hypothetical protein  40.36 
 
 		 640 aa  491  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549846 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2143  hypothetical protein  38.59 
 
 		 648 aa  488  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.56985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6525  protein of unknown function DUF1680  38.85 
 
 		 647 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0294245 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2215  protein of unknown function DUF1680  40.92 
 
 		 638 aa  474  1e-132  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4474  protein of unknown function DUF1680  40.27 
 
 		 636 aa  473  1e-132  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3930  protein of unknown function DUF1680  38.83 
 
 		 640 aa  469  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0635  protein of unknown function DUF1680  40.61 
 
 		 656 aa  469  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0502  protein of unknown function DUF1680  37.52 
 
 		 617 aa  452  1e-125  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.171957  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0643  hypothetical protein  38.18 
 
 		 620 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000119693  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0668  hypothetical protein  37.8 
 
 		 620 aa  437  1e-121  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1126  protein of unknown function DUF1680  37.87 
 
 		 628 aa  421  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4989  protein of unknown function DUF1680  37.61 
 
 		 647 aa  421  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0192762 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4835  protein of unknown function DUF1680  35.22 
 
 		 648 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0969  hypothetical protein  34.93 
 
 		 634 aa  405  1e-111  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00300565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4720  protein of unknown function DUF1680  35.1 
 
 		 655 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.827878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7232  protein of unknown function DUF1680  33.98 
 
 		 666 aa  392  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00213031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4996  protein of unknown function DUF1680  33.53 
 
 		 800 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0292235  normal  0.0722722 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1696  hypothetical protein  34.97 
 
 		 634 aa  372  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.298068 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0212  hypothetical protein  46.43 
 
 		 397 aa  368  1e-100  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000517482  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05305  DUF1680 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G08910)  32.19 
 
 		 629 aa  348  1e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2738  protein of unknown function DUF1680  31.03 
 
 		 680 aa  343  4e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0391777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2748  protein of unknown function DUF1680  30.84 
 
 		 684 aa  340  4e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0072487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4148  protein of unknown function DUF1680  35.98 
 
 		 652 aa  340  5.9999999999999996e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.834889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0910  hypothetical protein  30.47 
 
 		 665 aa  330  6e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.027132  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2133  protein of unknown function DUF1680  29.93 
 
 		 673 aa  325  1e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4097  hypothetical protein  30.55 
 
 		 672 aa  323  7e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121081  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0057  protein of unknown function DUF1680  31.95 
 
 		 643 aa  317  5e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0839925 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5347  protein of unknown function DUF1680  31.6 
 
 		 686 aa  312  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611947  normal  0.22403 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01840  hypothetical protein  32.46 
 
 		 643 aa  303  5.000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02820  hypothetical protein  30.55 
 
 		 643 aa  290  6e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.491149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0407  protein of unknown function DUF1680  30.62 
 
 		 633 aa  289  1e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1151  protein of unknown function DUF1680  36.03 
 
 		 679 aa  288  2e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3839  hypothetical protein  33.68 
 
 		 654 aa  280  8e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254825  normal  0.0525361 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2831  protein of unknown function DUF1680  31.51 
 
 		 629 aa  275  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0164  hypothetical protein  24.5 
 
 		 602 aa  114  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.935603  normal  0.0626406 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0320  hypothetical protein  29.02 
 
 		 607 aa  113  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.280201  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1938  protein of unknown function DUF1680  26.36 
 
 		 711 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0478  protein of unknown function DUF1680  23.13 
 
 		 641 aa  99  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.216473  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01470  hypothetical protein  25.08 
 
 		 783 aa  97.4  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  27.08 
 
 		 955 aa  97.4  8e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2967  protein of unknown function DUF1680  26.63 
 
 		 838 aa  96.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000186086  hitchhiker  0.000639223 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1254  protein of unknown function DUF1680  25.5 
 
 		 684 aa  95.5  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.831647  normal  0.201869 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3214  hypothetical protein  24.5 
 
 		 844 aa  90.1  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.77483  normal  0.454399 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1422  protein of unknown function DUF1680  23.59 
 
 		 760 aa  88.2  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428296  normal  0.497833 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2080  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  26.22 
 
 		 795 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.254608  hitchhiker  0.00000268125 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3545  hypothetical protein  22.51 
 
 		 663 aa  84.7  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.550366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1982  hypothetical protein  25.52 
 
 		 795 aa  84  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0591519  hitchhiker  0.000518937 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1993  hypothetical protein  25.52 
 
 		 795 aa  84  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0573537  hitchhiker  0.00434895 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0778  Acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  22.79 
 
 		 803 aa  82.4  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.163489 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1728  protein of unknown function DUF1680  28.63 
 
 		 675 aa  82.4  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.670849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1342  hypothetical protein  22.73 
 
 		 669 aa  80.9  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2153  protein of unknown function DUF1680  23.66 
 
 		 792 aa  80.9  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.299284  normal  0.0915146 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2836  protein of unknown function DUF1680  27.69 
 
 		 614 aa  80.5  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3876  hypothetical protein  19.58 
 
 		 765 aa  79.7  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0089  protein of unknown function DUF1680  22.69 
 
 		 677 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  24.49 
 
 		 963 aa  78.2  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4617  protein of unknown function DUF1680  21.63 
 
 		 1025 aa  77.8  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602011  normal  0.370298 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2035  protein of unknown function DUF1680  22.13 
 
 		 678 aa  76.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337709 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0636  protein of unknown function DUF1680  22.27 
 
 		 667 aa  74.7  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.788531 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  24.54 
 
 		 846 aa  68.9  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1194  protein of unknown function DUF1680  26.27 
 
 		 749 aa  67.8  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  23.02 
 
 		 771 aa  67.8  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1480  protein of unknown function DUF1680  24.12 
 
 		 632 aa  65.5  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0062  protein of unknown function DUF1680  21.69 
 
 		 596 aa  64.3  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.560227 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0363  protein of unknown function DUF1680  23.83 
 
 		 744 aa  52.8  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11690  hypothetical protein  23.27 
 
 		 752 aa  52.8  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0997  protein of unknown function DUF1680  20.49 
 
 		 597 aa  49.7  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4712  protein of unknown function DUF1680  24.9 
 
 		 881 aa  49.3  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>