221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0383 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  100 
 
 
401 aa  804    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  48.88 
 
 
374 aa  332  6e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  49.32 
 
 
368 aa  331  1e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4057  hypothetical protein  60.95 
 
 
261 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4516  cellulose-binding family II  56.44 
 
 
349 aa  234  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0447786  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2395  lipolytic protein G-D-S-L family  54.41 
 
 
311 aa  225  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00016801  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3163  lipolytic protein G-D-S-L family  55.09 
 
 
241 aa  223  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.384554  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  71.33 
 
 
507 aa  211  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  70.63 
 
 
495 aa  209  7e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  59.28 
 
 
474 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  37.16 
 
 
373 aa  190  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  65.73 
 
 
520 aa  182  9.000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  60.42 
 
 
691 aa  173  5e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  56.58 
 
 
466 aa  168  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2577  lipolytic protein G-D-S-L family  41.26 
 
 
681 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  58.62 
 
 
430 aa  157  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  55.24 
 
 
563 aa  150  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0798  lipolytic enzyme, G-D-S-L  38.96 
 
 
528 aa  149  7e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  50 
 
 
1139 aa  143  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  36.09 
 
 
1234 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  46.36 
 
 
491 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  32.58 
 
 
522 aa  123  6e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  48.95 
 
 
514 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  31.08 
 
 
503 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  45.99 
 
 
571 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0329  Pectate lyase  44.44 
 
 
445 aa  119  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0745769 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  47.89 
 
 
560 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  45.04 
 
 
436 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  33.33 
 
 
749 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  40 
 
 
412 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  47.29 
 
 
672 aa  113  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  35.32 
 
 
353 aa  113  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07158  conserved hypothetical protein  33.81 
 
 
366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.014159  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08314  conserved hypothetical protein  33.82 
 
 
1282 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0991  lipolytic protein G-D-S-L family  30.89 
 
 
828 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.978683  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2166  galactose oxidase-like protein  32.11 
 
 
759 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491286  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4332  Ricin B lectin  43.84 
 
 
615 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.817761  normal  0.0720026 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  44.85 
 
 
497 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1877  lipolytic protein G-D-S-L family  28.97 
 
 
576 aa  106  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6311  lipolytic protein G-D-S-L family  37.02 
 
 
688 aa  106  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  35.15 
 
 
366 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  40.76 
 
 
476 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  39.74 
 
 
1259 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  44.29 
 
 
411 aa  104  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06464  esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03170)  32.34 
 
 
921 aa  103  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  42.22 
 
 
884 aa  103  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  41.61 
 
 
566 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  41.48 
 
 
957 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  46.92 
 
 
618 aa  102  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  38.04 
 
 
1413 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2225  lipolytic protein G-D-S-L family  28.8 
 
 
378 aa  100  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0184317 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  38.69 
 
 
472 aa  98.6  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  43.07 
 
 
943 aa  97.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0748  lipolytic protein G-D-S-L family  35.75 
 
 
255 aa  97.1  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0859  Ricin B lectin  41.13 
 
 
483 aa  95.9  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09260  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
869 aa  95.5  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0483373  normal  0.056586 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1831  cellulose-binding family II  32.16 
 
 
374 aa  95.5  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2115  lipolytic protein G-D-S-L family  29.54 
 
 
329 aa  93.6  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04573  conserved hypothetical protein  32.37 
 
 
266 aa  92.4  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.751469  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  39.86 
 
 
494 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  38.27 
 
 
647 aa  92.4  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1703  hypothetical protein  36.62 
 
 
392 aa  92  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.595343 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  35.67 
 
 
695 aa  91.3  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2967  Ricin B lectin  35.86 
 
 
230 aa  90.9  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  35.54 
 
 
503 aa  90.1  7e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  36.49 
 
 
537 aa  89.7  8e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6977  hypothetical protein  35.46 
 
 
897 aa  89.7  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449457  normal  0.690746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  43.28 
 
 
1016 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.47 
 
 
507 aa  87.8  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  38.24 
 
 
507 aa  87.4  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  37.96 
 
 
582 aa  87.4  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  36.43 
 
 
737 aa  87.4  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  40.27 
 
 
648 aa  86.7  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4850  lipolytic protein G-D-S-L family  29.68 
 
 
253 aa  86.3  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  31.76 
 
 
468 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  37.75 
 
 
569 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  35.82 
 
 
507 aa  84.7  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  37.5 
 
 
789 aa  84.3  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  33.58 
 
 
2073 aa  82.8  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  36.81 
 
 
1187 aa  81.3  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  32.38 
 
 
358 aa  79.7  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  31.58 
 
 
963 aa  79.7  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  32.37 
 
 
510 aa  79  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  35.77 
 
 
982 aa  77.8  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5674  Ricin B lectin  36.5 
 
 
425 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.510311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  39.34 
 
 
489 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.8 
 
 
756 aa  73.6  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  35.77 
 
 
474 aa  73.6  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  35.07 
 
 
863 aa  72.4  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  34.18 
 
 
1567 aa  71.6  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  34.92 
 
 
824 aa  70.1  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  35.25 
 
 
771 aa  70.1  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49706  predicted protein  32.26 
 
 
1222 aa  69.3  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  36.29 
 
 
492 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  32.67 
 
 
663 aa  67  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  32.19 
 
 
493 aa  66.2  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  30.72 
 
 
482 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  35.2 
 
 
497 aa  63.9  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3068  Ricin B lectin  30.15 
 
 
489 aa  63.5  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4874  Ricin B lectin  35.04 
 
 
1049 aa  63.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524665  normal  0.633916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>