123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4959 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4959  Ricin B lectin  100 
 
 		 576 aa  1146    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.572354  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2137  cellulosome enzyme, dockerin type I  33.98 
 
 		 790 aa  205  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1740  hypothetical protein  28.41 
 
 		 885 aa  172  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01850  Ig-like domain-containing protein  31.18 
 
 		 1323 aa  161  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.854355  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0632  hypothetical protein  27.09 
 
 		 809 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0657  hypothetical protein  27.09 
 
 		 809 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2607  hypothetical protein  32.99 
 
 		 755 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.459804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4926  Ricin B lectin  26.46 
 
 		 748 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164927  normal  0.377281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3593  hypothetical protein  29.29 
 
 		 723 aa  120  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.27604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  40.88 
 
 		 963 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  34.3 
 
 		 771 aa  104  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6977  hypothetical protein  43.61 
 
 		 897 aa  101  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449457  normal  0.690746 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  41.3 
 
 		 566 aa  99  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  37.86 
 
 		 582 aa  89.4  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  39.42 
 
 		 412 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  35.97 
 
 		 537 aa  84.7  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  35.66 
 
 		 411 aa  84.3  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  34.33 
 
 		 571 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  35 
 
 		 507 aa  82.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  37.78 
 
 		 510 aa  81.6  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07117  conserved hypothetical protein  25.48 
 
 		 458 aa  78.6  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  31.85 
 
 		 691 aa  78.2  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  34.53 
 
 		 503 aa  77.8  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  28.81 
 
 		 1413 aa  77.4  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  34.25 
 
 		 569 aa  76.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.59 
 
 		 520 aa  75.5  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  31.79 
 
 		 494 aa  75.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  32.03 
 
 		 503 aa  75.1  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.53 
 
 		 474 aa  74.3  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  35.07 
 
 		 495 aa  72.8  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  36.23 
 
 		 824 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  31.85 
 
 		 514 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  32.35 
 
 		 507 aa  72  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  32.17 
 
 		 884 aa  71.6  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  30.5 
 
 		 507 aa  71.6  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  32.39 
 
 		 737 aa  71.2  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  33.57 
 
 		 957 aa  70.5  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.09 
 
 		 507 aa  69.7  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.8 
 
 		 756 aa  69.3  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.15 
 
 		 466 aa  68.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  33.33 
 
 		 430 aa  66.6  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  31.43 
 
 		 474 aa  66.6  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  34.56 
 
 		 482 aa  66.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  32.03 
 
 		 487 aa  64.7  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  28.68 
 
 		 672 aa  64.3  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  32.85 
 
 		 2073 aa  63.5  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  30.87 
 
 		 695 aa  63.5  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  29.85 
 
 		 401 aa  62.4  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  32.56 
 
 		 472 aa  61.6  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  31.13 
 
 		 943 aa  62  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  30.88 
 
 		 491 aa  62  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0859  Ricin B lectin  31.97 
 
 		 483 aa  61.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  33.06 
 
 		 1259 aa  60.8  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  32.19 
 
 		 1187 aa  60.5  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1625  Ricin B lectin  33.11 
 
 		 664 aa  60.1  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  32.59 
 
 		 500 aa  60.1  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4332  Ricin B lectin  33.11 
 
 		 615 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.817761  normal  0.0720026 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0329  Pectate lyase  31.25 
 
 		 445 aa  57.8  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0745769 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  30.88 
 
 		 1139 aa  57  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  28.99 
 
 		 436 aa  55.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  39.81 
 
 		 663 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  30.28 
 
 		 493 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  29.1 
 
 		 563 aa  55.5  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  33.33 
 
 		 380 aa  55.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  30.88 
 
 		 492 aa  54.3  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4177  Pectate lyase  33.82 
 
 		 430 aa  54.3  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  31.34 
 
 		 547 aa  54.3  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  30.83 
 
 		 461 aa  53.9  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  28.36 
 
 		 560 aa  53.5  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2967  Ricin B lectin  25.93 
 
 		 230 aa  53.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  35.11 
 
 		 498 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  27.74 
 
 		 1016 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  30.43 
 
 		 427 aa  52.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  25.79 
 
 		 1567 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  31.58 
 
 		 647 aa  52.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  24.28 
 
 		 497 aa  52.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  30.34 
 
 		 490 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5674  Ricin B lectin  30.91 
 
 		 425 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  31.06 
 
 		 468 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  33.6 
 
 		 489 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  30.08 
 
 		 472 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  34.09 
 
 		 493 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  37.66 
 
 		 801 aa  51.6  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5658  Ricin B lectin  30.3 
 
 		 840 aa  51.6  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6876  glycoside hydrolase family 76  36.49 
 
 		 514 aa  51.6  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  29.61 
 
 		 469 aa  51.6  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  29.37 
 
 		 806 aa  51.2  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  29.37 
 
 		 806 aa  51.2  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  29.37 
 
 		 806 aa  51.2  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  29.37 
 
 		 806 aa  51.2  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  29.37 
 
 		 806 aa  51.2  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  29.37 
 
 		 806 aa  51.2  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  29.37 
 
 		 806 aa  51.2  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  29.65 
 
 		 487 aa  50.8  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  27.54 
 
 		 789 aa  50.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1572  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  29.58 
 
 		 858 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  29.38 
 
 		 368 aa  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  29.86 
 
 		 1141 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1395  galactose oxidase  29.85 
 
 		 1100 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.610012  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  29.85 
 
 		 558 aa  48.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>