48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1859 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1859  protein of unknown function DUF1680  100 
 
 
736 aa  1463    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2836  protein of unknown function DUF1680  42.03 
 
 
614 aa  201  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  39.16 
 
 
771 aa  177  9e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  35.58 
 
 
846 aa  167  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4617  protein of unknown function DUF1680  34.9 
 
 
1025 aa  154  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602011  normal  0.370298 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4712  protein of unknown function DUF1680  35.23 
 
 
881 aa  149  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2080  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  28.12 
 
 
795 aa  144  7e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.254608  hitchhiker  0.00000268125 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0478  protein of unknown function DUF1680  31.39 
 
 
641 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.216473  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  31.16 
 
 
955 aa  139  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1993  hypothetical protein  28.1 
 
 
795 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0573537  hitchhiker  0.00434895 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1982  hypothetical protein  28.1 
 
 
795 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0591519  hitchhiker  0.000518937 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0778  Acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  29.69 
 
 
803 aa  134  7.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.163489 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2153  protein of unknown function DUF1680  30.26 
 
 
792 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.299284  normal  0.0915146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1422  protein of unknown function DUF1680  27.2 
 
 
760 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428296  normal  0.497833 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3214  hypothetical protein  29.69 
 
 
844 aa  125  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.77483  normal  0.454399 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3876  hypothetical protein  25.84 
 
 
765 aa  123  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01470  hypothetical protein  29.32 
 
 
783 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6069  LamG domain-containing protein  36.57 
 
 
739 aa  105  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6366  putative transmembrane protein  36.57 
 
 
739 aa  102  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0997  protein of unknown function DUF1680  28.46 
 
 
597 aa  100  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0363  protein of unknown function DUF1680  31.3 
 
 
744 aa  99.4  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01652  putative transmembrane protein  37.42 
 
 
767 aa  88.2  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.993678  normal  0.0258768 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4814  putative transmembrane protein  33.89 
 
 
757 aa  87.8  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0164  hypothetical protein  27.1 
 
 
602 aa  85.1  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.935603  normal  0.0626406 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0062  protein of unknown function DUF1680  29.79 
 
 
596 aa  79.7  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.560227 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11690  hypothetical protein  29.57 
 
 
752 aa  75.5  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0704  Fibronectin type III domain protein  30.58 
 
 
718 aa  75.9  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1194  protein of unknown function DUF1680  27.56 
 
 
749 aa  69.3  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  29.7 
 
 
1013 aa  65.1  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0320  hypothetical protein  24.09 
 
 
607 aa  60.1  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.280201  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4996  protein of unknown function DUF1680  25.3 
 
 
800 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0292235  normal  0.0722722 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  29.05 
 
 
4761 aa  57  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4474  protein of unknown function DUF1680  22.36 
 
 
636 aa  54.7  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0591  hypothetical protein  23.67 
 
 
646 aa  54.7  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000770924  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01850  Ig-like domain-containing protein  27.7 
 
 
1323 aa  51.2  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.854355  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5932  protein of unknown function DUF1549  24.39 
 
 
1182 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453716  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0806  hypothetical protein  31.4 
 
 
1107 aa  49.7  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2242  protein of unknown function DUF1680  22.67 
 
 
652 aa  49.3  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3263  VcfQ-like protein  26.56 
 
 
1072 aa  48.9  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  23.24 
 
 
6678 aa  48.5  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2907  protein of unknown function DUF1680  25.86 
 
 
659 aa  48.5  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0376366  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2738  protein of unknown function DUF1680  22.02 
 
 
680 aa  47.4  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0391777  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1151  protein of unknown function DUF1680  24.12 
 
 
679 aa  47.4  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3228  hypothetical protein  28.57 
 
 
447 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.159328  normal  0.346325 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1938  protein of unknown function DUF1680  23.58 
 
 
711 aa  46.6  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32 
 
 
1064 aa  45.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0805  hypothetical protein  31.31 
 
 
202 aa  44.7  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4731  hypothetical protein  29.61 
 
 
2223 aa  44.3  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>