193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3803 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2555  hypothetical protein  56.68 
 
 		 804 aa  860    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  100 
 
 		 943 aa  1899    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1120  hypothetical protein  33.66 
 
 		 796 aa  366  1e-99  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  30.34 
 
 		 1479 aa  361  4e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1856  glycoside hydrolase family protein  31.05 
 
 		 781 aa  348  2e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.44 
 
 		 1094 aa  346  1e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  31.8 
 
 		 1193 aa  343  9e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8217  Alpha-L-fucosidase  33.29 
 
 		 991 aa  336  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5141  hypothetical protein  31.44 
 
 		 741 aa  335  3e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2503  hypothetical protein  32.19 
 
 		 803 aa  329  1.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1484  Alpha-L-fucosidase  31.67 
 
 		 842 aa  327  7e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6800  Alpha-L-fucosidase  29.97 
 
 		 778 aa  327  8.000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000092205  unclonable  0.0000000000000164312 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5679  Alpha-L-fucosidase  30.38 
 
 		 747 aa  327  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.357027 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7192  Alpha-L-fucosidase  31.61 
 
 		 811 aa  325  2e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000769318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4083  hypothetical protein  30.43 
 
 		 816 aa  324  4e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5237  alpha-L-fucosidase, putative, afc95A  31.73 
 
 		 742 aa  321  5e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1435  hypothetical protein  29.2 
 
 		 790 aa  315  2.9999999999999996e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.931563  normal  0.0505935 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1256  hypothetical protein  30.61 
 
 		 768 aa  315  3.9999999999999997e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.471083  normal  0.43863 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0772  hypothetical protein  29.12 
 
 		 802 aa  310  8e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  29.69 
 
 		 1164 aa  306  1.0000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2698  Alpha-L-fucosidase  29.38 
 
 		 868 aa  298  4e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.447699  normal  0.17136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2699  Alpha-L-fucosidase  29.46 
 
 		 825 aa  296  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000179914  normal  0.370363 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28510  hypothetical protein  31.33 
 
 		 773 aa  293  8e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1020  hypothetical protein  30.66 
 
 		 759 aa  292  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0813  Alpha-L-fucosidase  31.03 
 
 		 786 aa  292  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2700  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.77 
 
 		 784 aa  291  3e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5006  Alpha-L-fucosidase  27.81 
 
 		 864 aa  290  1e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.9086 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1878  Alpha-L-fucosidase  29.27 
 
 		 825 aa  287  5e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2817  Alpha-L-fucosidase  31.12 
 
 		 940 aa  282  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1354  hypothetical protein  27.86 
 
 		 1139 aa  269  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5543  Alpha-L-fucosidase  29.58 
 
 		 841 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0324078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3112  hypothetical protein  26.69 
 
 		 822 aa  263  1e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.31763  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1752  hypothetical protein  27.99 
 
 		 833 aa  261  6e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0874  hypothetical protein  27.97 
 
 		 760 aa  255  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.272656  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08149  Alpha-fucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU81]  29.15 
 
 		 809 aa  254  5.000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.954517 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10376  conserved hypothetical protein  28.24 
 
 		 757 aa  248  4.9999999999999997e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1395  hypothetical protein  27.06 
 
 		 758 aa  244  7.999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00458705  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2411  twin-arginine translocation pathway signal  29.24 
 
 		 824 aa  239  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0071  glycoside hydrolase family protein  26.58 
 
 		 835 aa  232  3e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05400  hypothetical protein  29.69 
 
 		 856 aa  228  5.0000000000000005e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06673  alpha-fucosidase (Eurofung)  26.88 
 
 		 831 aa  215  2.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00444703 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3002  Alpha-L-fucosidase  28.31 
 
 		 809 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0429  twin-arginine translocation pathway signal  27.26 
 
 		 781 aa  198  5.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.767202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2174  hypothetical protein  32.2 
 
 		 646 aa  192  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.007459  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0186  glycoside hydrolase family 95  26.39 
 
 		 788 aa  188  4e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.771982 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1192  hypothetical protein  31.79 
 
 		 837 aa  168  4e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1765  hypothetical protein  29.45 
 
 		 819 aa  160  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00969873  normal  0.0262945 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0084  hypothetical protein  24.29 
 
 		 809 aa  144  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4191  twin-arginine translocation pathway signal  30.95 
 
 		 808 aa  140  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.411949  normal  0.364475 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29100  hypothetical protein  28.21 
 
 		 762 aa  133  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.142141  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1614  hypothetical protein  26.02 
 
 		 753 aa  114  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126205  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  42.75 
 
 		 514 aa  108  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  44.6 
 
 		 691 aa  107  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  33.75 
 
 		 571 aa  101  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.04 
 
 		 474 aa  100  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1563  hypothetical protein  26.58 
 
 		 770 aa  100  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156768  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  42.96 
 
 		 507 aa  98.6  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  43.07 
 
 		 401 aa  97.8  7e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  42.03 
 
 		 430 aa  97.1  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  40.74 
 
 		 495 aa  95.5  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  44.85 
 
 		 1016 aa  95.1  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  36.54 
 
 		 412 aa  92  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  40.91 
 
 		 563 aa  91.3  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.5 
 
 		 466 aa  90.1  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.52 
 
 		 520 aa  89.4  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  38.13 
 
 		 1139 aa  89.7  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  36 
 
 		 491 aa  88.6  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  38.64 
 
 		 672 aa  88.2  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.94 
 
 		 756 aa  88.2  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  37.59 
 
 		 618 aa  86.3  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0329  Pectate lyase  35.85 
 
 		 445 aa  85.9  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0745769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  46.32 
 
 		 494 aa  85.9  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  35.57 
 
 		 436 aa  85.1  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  36.84 
 
 		 507 aa  85.1  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  31.9 
 
 		 476 aa  85.1  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  34.27 
 
 		 737 aa  85.1  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6977  hypothetical protein  38.16 
 
 		 897 aa  84  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449457  normal  0.690746 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.09 
 
 		 507 aa  83.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  36.23 
 
 		 411 aa  82.8  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  37.32 
 
 		 497 aa  82.4  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  33.83 
 
 		 503 aa  81.6  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  31.02 
 
 		 695 aa  80.5  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  36.23 
 
 		 472 aa  80.1  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  39.1 
 
 		 566 aa  79.3  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  34.07 
 
 		 507 aa  79.7  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  36.9 
 
 		 647 aa  78.2  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  38.4 
 
 		 824 aa  77  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  36.5 
 
 		 537 aa  77.4  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  37.7 
 
 		 1259 aa  75.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  33.33 
 
 		 884 aa  75.1  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  33.82 
 
 		 957 aa  73.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0859  Ricin B lectin  35.96 
 
 		 483 aa  73.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  28.36 
 
 		 771 aa  73.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  29.48 
 
 		 1413 aa  72.4  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5658  Ricin B lectin  34.09 
 
 		 840 aa  72.4  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  39.58 
 
 		 503 aa  72  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  41.05 
 
 		 493 aa  71.6  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5561  Alpha-L-fucosidase  25.27 
 
 		 757 aa  70.5  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  34.88 
 
 		 368 aa  70.5  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  31.85 
 
 		 963 aa  70.1  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>