59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1395 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1020  hypothetical protein  48.29 
 
 		 759 aa  661    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1395  hypothetical protein  100 
 
 		 758 aa  1582    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00458705  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2700  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.73 
 
 		 784 aa  558  1e-157  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10376  conserved hypothetical protein  40.18 
 
 		 757 aa  555  1e-156  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0874  hypothetical protein  40.78 
 
 		 760 aa  549  1e-155  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.272656  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1484  Alpha-L-fucosidase  38.34 
 
 		 842 aa  519  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.29 
 
 		 1094 aa  509  1e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1752  hypothetical protein  38.92 
 
 		 833 aa  501  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1878  Alpha-L-fucosidase  38.31 
 
 		 825 aa  498  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2699  Alpha-L-fucosidase  37.98 
 
 		 825 aa  486  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000179914  normal  0.370363 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4083  hypothetical protein  38.27 
 
 		 816 aa  488  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5141  hypothetical protein  37.6 
 
 		 741 aa  480  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1256  hypothetical protein  36.48 
 
 		 768 aa  482  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.471083  normal  0.43863 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5006  Alpha-L-fucosidase  34.52 
 
 		 864 aa  480  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.9086 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1856  glycoside hydrolase family protein  37.01 
 
 		 781 aa  480  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2698  Alpha-L-fucosidase  37.97 
 
 		 868 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.447699  normal  0.17136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7192  Alpha-L-fucosidase  36.87 
 
 		 811 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000769318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0772  hypothetical protein  37.16 
 
 		 802 aa  466  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5543  Alpha-L-fucosidase  38.25 
 
 		 841 aa  468  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0324078  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5679  Alpha-L-fucosidase  37.91 
 
 		 747 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.357027 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06673  alpha-fucosidase (Eurofung)  36.12 
 
 		 831 aa  456  1e-127  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00444703 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6800  Alpha-L-fucosidase  36.59 
 
 		 778 aa  459  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000092205  unclonable  0.0000000000000164312 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  37 
 
 		 1479 aa  456  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2503  hypothetical protein  37.22 
 
 		 803 aa  454  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3112  hypothetical protein  35.07 
 
 		 822 aa  455  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.31763  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  37.89 
 
 		 1193 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0813  Alpha-L-fucosidase  35.95 
 
 		 786 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1435  hypothetical protein  35.23 
 
 		 790 aa  432  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.931563  normal  0.0505935 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  34.7 
 
 		 1164 aa  421  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0071  glycoside hydrolase family protein  35.5 
 
 		 835 aa  414  1e-114  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8217  Alpha-L-fucosidase  35.4 
 
 		 991 aa  413  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1354  hypothetical protein  33.25 
 
 		 1139 aa  414  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5237  alpha-L-fucosidase, putative, afc95A  35.79 
 
 		 742 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2817  Alpha-L-fucosidase  36.02 
 
 		 940 aa  397  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2411  twin-arginine translocation pathway signal  33.55 
 
 		 824 aa  391  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05400  hypothetical protein  30.22 
 
 		 856 aa  362  2e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3002  Alpha-L-fucosidase  30.21 
 
 		 809 aa  357  5.999999999999999e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0429  twin-arginine translocation pathway signal  33.04 
 
 		 781 aa  354  4e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.767202 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1192  hypothetical protein  40.04 
 
 		 837 aa  330  4e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0186  glycoside hydrolase family 95  28.44 
 
 		 788 aa  323  8e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.771982 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1120  hypothetical protein  29.63 
 
 		 796 aa  319  1e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2174  hypothetical protein  39.96 
 
 		 646 aa  308  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.007459  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28510  hypothetical protein  30.35 
 
 		 773 aa  295  3e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29100  hypothetical protein  29.68 
 
 		 762 aa  268  2.9999999999999995e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.142141  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4191  twin-arginine translocation pathway signal  29.23 
 
 		 808 aa  258  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.411949  normal  0.364475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2555  hypothetical protein  26.56 
 
 		 804 aa  236  8e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  27.2 
 
 		 943 aa  235  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1765  hypothetical protein  32.03 
 
 		 819 aa  235  2.0000000000000002e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00969873  normal  0.0262945 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08149  Alpha-fucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU81]  27.62 
 
 		 809 aa  234  5e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.954517 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0084  hypothetical protein  26.83 
 
 		 809 aa  180  7e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1614  hypothetical protein  24.38 
 
 		 753 aa  156  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126205  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1563  hypothetical protein  26.16 
 
 		 770 aa  140  7e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156768  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5561  Alpha-L-fucosidase  27.22 
 
 		 757 aa  136  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00114  expressed protein  34.54 
 
 		 262 aa  120  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1707  hypothetical protein  22.67 
 
 		 750 aa  81.3  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.358373  normal  0.023809 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00113  hypothetical protein  47.73 
 
 		 116 aa  75.5  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.688258  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3110  hypothetical protein  27.64 
 
 		 928 aa  65.1  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0237915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5029  hypothetical protein  23.57 
 
 		 948 aa  57.8  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0984885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2707  Trehalose and maltose hydrolase (possible phosphorylase)  21.87 
 
 		 765 aa  55.1  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0712554  normal  0.489106 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>