28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2707 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2707  Trehalose and maltose hydrolase (possible phosphorylase)  100 
 
 
765 aa  1584    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0712554  normal  0.489106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5029  hypothetical protein  32.53 
 
 
948 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0984885  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1563  hypothetical protein  25.33 
 
 
770 aa  112  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156768  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1707  hypothetical protein  21.36 
 
 
750 aa  84  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.358373  normal  0.023809 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  23.86 
 
 
1193 aa  82  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7192  Alpha-L-fucosidase  21.43 
 
 
811 aa  78.2  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000769318  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3112  hypothetical protein  24.8 
 
 
822 aa  65.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.31763  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28510  hypothetical protein  21.36 
 
 
773 aa  61.2  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4083  hypothetical protein  20.15 
 
 
816 aa  60.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  21.7 
 
 
1164 aa  60.1  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1856  glycoside hydrolase family protein  23.04 
 
 
781 aa  60.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6800  Alpha-L-fucosidase  21.89 
 
 
778 aa  55.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000092205  unclonable  0.0000000000000164312 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0071  glycoside hydrolase family protein  23.72 
 
 
835 aa  55.5  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1395  hypothetical protein  21.87 
 
 
758 aa  54.7  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00458705  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5237  alpha-L-fucosidase, putative, afc95A  22.15 
 
 
742 aa  53.9  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139912  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  24.74 
 
 
1094 aa  53.9  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1484  Alpha-L-fucosidase  19.55 
 
 
842 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8217  Alpha-L-fucosidase  21.99 
 
 
991 aa  53.5  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  21.14 
 
 
1479 aa  53.1  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1878  Alpha-L-fucosidase  22.26 
 
 
825 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1354  hypothetical protein  23.63 
 
 
1139 aa  49.7  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2503  hypothetical protein  22.63 
 
 
803 aa  49.3  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20212  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5219  hypothetical protein  20.29 
 
 
1176 aa  49.3  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2742  hypothetical protein  21.73 
 
 
770 aa  48.9  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1752  hypothetical protein  21.24 
 
 
833 aa  49.3  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187912  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1020  hypothetical protein  19.87 
 
 
759 aa  49.3  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1120  hypothetical protein  22.56 
 
 
796 aa  48.9  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06673  alpha-fucosidase (Eurofung)  22 
 
 
831 aa  48.1  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00444703 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>