58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1563 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1563  hypothetical protein  100 
 
 		 770 aa  1595    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156768  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1707  hypothetical protein  26.03 
 
 		 750 aa  228  4e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.358373  normal  0.023809 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1020  hypothetical protein  23.85 
 
 		 759 aa  177  9e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5006  Alpha-L-fucosidase  26.72 
 
 		 864 aa  177  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.9086 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2503  hypothetical protein  29.92 
 
 		 803 aa  172  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5237  alpha-L-fucosidase, putative, afc95A  31.18 
 
 		 742 aa  167  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6800  Alpha-L-fucosidase  24.01 
 
 		 778 aa  160  8e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000092205  unclonable  0.0000000000000164312 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  26.99 
 
 		 1193 aa  159  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4083  hypothetical protein  23.32 
 
 		 816 aa  155  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8217  Alpha-L-fucosidase  29.12 
 
 		 991 aa  154  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10376  conserved hypothetical protein  24.94 
 
 		 757 aa  154  7e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1878  Alpha-L-fucosidase  24.01 
 
 		 825 aa  152  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1435  hypothetical protein  28.01 
 
 		 790 aa  150  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.931563  normal  0.0505935 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1752  hypothetical protein  24.05 
 
 		 833 aa  150  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2698  Alpha-L-fucosidase  23.35 
 
 		 868 aa  148  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.447699  normal  0.17136 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  25.1 
 
 		 1479 aa  148  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3112  hypothetical protein  23.61 
 
 		 822 aa  147  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.31763  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2700  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  22.95 
 
 		 784 aa  145  4e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7192  Alpha-L-fucosidase  24.23 
 
 		 811 aa  143  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000769318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1395  hypothetical protein  26.16 
 
 		 758 aa  140  7e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00458705  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5141  hypothetical protein  24.25 
 
 		 741 aa  140  7e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2699  Alpha-L-fucosidase  22.25 
 
 		 825 aa  140  8.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000179914  normal  0.370363 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  23.45 
 
 		 1094 aa  138  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2174  hypothetical protein  28.64 
 
 		 646 aa  137  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.007459  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1856  glycoside hydrolase family protein  26.43 
 
 		 781 aa  136  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28510  hypothetical protein  26.08 
 
 		 773 aa  135  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5543  Alpha-L-fucosidase  23.49 
 
 		 841 aa  135  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0324078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0813  Alpha-L-fucosidase  22.95 
 
 		 786 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1120  hypothetical protein  26.06 
 
 		 796 aa  133  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2817  Alpha-L-fucosidase  25.49 
 
 		 940 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1256  hypothetical protein  22.91 
 
 		 768 aa  127  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.471083  normal  0.43863 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05400  hypothetical protein  27.29 
 
 		 856 aa  127  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0874  hypothetical protein  25.56 
 
 		 760 aa  124  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.272656  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0772  hypothetical protein  21.9 
 
 		 802 aa  124  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5029  hypothetical protein  25.25 
 
 		 948 aa  122  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0984885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1484  Alpha-L-fucosidase  26.94 
 
 		 842 aa  117  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3002  Alpha-L-fucosidase  27.22 
 
 		 809 aa  115  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2707  Trehalose and maltose hydrolase (possible phosphorylase)  25.33 
 
 		 765 aa  112  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0712554  normal  0.489106 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1192  hypothetical protein  25.77 
 
 		 837 aa  112  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0071  glycoside hydrolase family protein  25.16 
 
 		 835 aa  110  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1354  hypothetical protein  25.84 
 
 		 1139 aa  108  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2411  twin-arginine translocation pathway signal  25.11 
 
 		 824 aa  105  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06673  alpha-fucosidase (Eurofung)  26.32 
 
 		 831 aa  104  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00444703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  26.3 
 
 		 943 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  19.95 
 
 		 1164 aa  99.8  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0084  hypothetical protein  27.27 
 
 		 809 aa  97.8  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5679  Alpha-L-fucosidase  24.51 
 
 		 747 aa  97.8  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.357027 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4191  twin-arginine translocation pathway signal  24.46 
 
 		 808 aa  95.9  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.411949  normal  0.364475 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0429  twin-arginine translocation pathway signal  25.4 
 
 		 781 aa  94.7  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.767202 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2555  hypothetical protein  24.11 
 
 		 804 aa  93.2  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29100  hypothetical protein  24.25 
 
 		 762 aa  87.4  9e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.142141  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0186  glycoside hydrolase family 95  25.17 
 
 		 788 aa  86.3  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.771982 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1614  hypothetical protein  21.85 
 
 		 753 aa  77  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126205  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5561  Alpha-L-fucosidase  22.92 
 
 		 757 aa  74.3  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1765  hypothetical protein  23.08 
 
 		 819 aa  73.2  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00969873  normal  0.0262945 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08149  Alpha-fucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU81]  22.59 
 
 		 809 aa  72.4  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.954517 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00113  hypothetical protein  35.63 
 
 		 116 aa  52.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.688258  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2146  hypothetical protein  39.06 
 
 		 784 aa  48.1  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.292237  normal  0.414458 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>