58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2411 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2411  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 824 aa  1648    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1878  Alpha-L-fucosidase  41.5 
 
 		 825 aa  590  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1752  hypothetical protein  41.17 
 
 		 833 aa  570  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3112  hypothetical protein  38.19 
 
 		 822 aa  569  1e-161  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.31763  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5543  Alpha-L-fucosidase  39.87 
 
 		 841 aa  545  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0324078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2698  Alpha-L-fucosidase  38.51 
 
 		 868 aa  531  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.447699  normal  0.17136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0813  Alpha-L-fucosidase  38.08 
 
 		 786 aa  530  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0772  hypothetical protein  38.44 
 
 		 802 aa  528  1e-148  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05400  hypothetical protein  40.89 
 
 		 856 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1256  hypothetical protein  38.64 
 
 		 768 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.471083  normal  0.43863 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2700  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.72 
 
 		 784 aa  466  9.999999999999999e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5006  Alpha-L-fucosidase  36.76 
 
 		 864 aa  464  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.9086 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2699  Alpha-L-fucosidase  36.57 
 
 		 825 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000179914  normal  0.370363 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4083  hypothetical protein  34.16 
 
 		 816 aa  451  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1020  hypothetical protein  37.11 
 
 		 759 aa  451  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.7 
 
 		 1094 aa  436  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1192  hypothetical protein  40.47 
 
 		 837 aa  437  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1484  Alpha-L-fucosidase  35.23 
 
 		 842 aa  439  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0429  twin-arginine translocation pathway signal  41.62 
 
 		 781 aa  437  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.767202 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10376  conserved hypothetical protein  38.66 
 
 		 757 aa  434  1e-120  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7192  Alpha-L-fucosidase  35.92 
 
 		 811 aa  427  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000769318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1856  glycoside hydrolase family protein  34.94 
 
 		 781 aa  422  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5141  hypothetical protein  37.63 
 
 		 741 aa  421  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3002  Alpha-L-fucosidase  38.96 
 
 		 809 aa  413  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5679  Alpha-L-fucosidase  38.72 
 
 		 747 aa  411  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.357027 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1395  hypothetical protein  33.55 
 
 		 758 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00458705  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0071  glycoside hydrolase family protein  32.69 
 
 		 835 aa  405  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1354  hypothetical protein  35.84 
 
 		 1139 aa  402  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1435  hypothetical protein  33.6 
 
 		 790 aa  401  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.931563  normal  0.0505935 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2817  Alpha-L-fucosidase  37.28 
 
 		 940 aa  395  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  34.06 
 
 		 1164 aa  392  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  32.99 
 
 		 1193 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2174  hypothetical protein  51.22 
 
 		 646 aa  386  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.007459  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  32.47 
 
 		 1479 aa  372  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0874  hypothetical protein  31 
 
 		 760 aa  369  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.272656  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29100  hypothetical protein  38.51 
 
 		 762 aa  367  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.142141  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2503  hypothetical protein  32.68 
 
 		 803 aa  367  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6800  Alpha-L-fucosidase  32.63 
 
 		 778 aa  365  2e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000092205  unclonable  0.0000000000000164312 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8217  Alpha-L-fucosidase  35.75 
 
 		 991 aa  365  3e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5237  alpha-L-fucosidase, putative, afc95A  37.22 
 
 		 742 aa  364  4e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4191  twin-arginine translocation pathway signal  39.59 
 
 		 808 aa  364  5.0000000000000005e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.411949  normal  0.364475 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06673  alpha-fucosidase (Eurofung)  34.96 
 
 		 831 aa  350  4e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00444703 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1120  hypothetical protein  32.02 
 
 		 796 aa  332  2e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1765  hypothetical protein  32.57 
 
 		 819 aa  316  9.999999999999999e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00969873  normal  0.0262945 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0186  glycoside hydrolase family 95  30.15 
 
 		 788 aa  278  3e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.771982 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08149  Alpha-fucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU81]  30.15 
 
 		 809 aa  264  4e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.954517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  29.64 
 
 		 943 aa  249  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28510  hypothetical protein  31.26 
 
 		 773 aa  231  4e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2555  hypothetical protein  27.95 
 
 		 804 aa  215  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0084  hypothetical protein  27.79 
 
 		 809 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1614  hypothetical protein  28.52 
 
 		 753 aa  170  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126205  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5561  Alpha-L-fucosidase  31.01 
 
 		 757 aa  152  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1563  hypothetical protein  23.82 
 
 		 770 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156768  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00114  expressed protein  38.57 
 
 		 262 aa  118  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3110  hypothetical protein  24.5 
 
 		 928 aa  96.7  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0237915 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1707  hypothetical protein  20.4 
 
 		 750 aa  68.9  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.358373  normal  0.023809 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00113  hypothetical protein  35 
 
 		 116 aa  56.6  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.688258  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5219  hypothetical protein  23.03 
 
 		 1176 aa  49.3  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>