60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5237 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  46.11 
 
 		 1193 aa  667    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2503  hypothetical protein  49.05 
 
 		 803 aa  703    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  48.25 
 
 		 1479 aa  675    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5237  alpha-L-fucosidase, putative, afc95A  100 
 
 		 742 aa  1504    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8217  Alpha-L-fucosidase  55.97 
 
 		 991 aa  820    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1435  hypothetical protein  44.44 
 
 		 790 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.931563  normal  0.0505935 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2699  Alpha-L-fucosidase  40.35 
 
 		 825 aa  520  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000179914  normal  0.370363 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1256  hypothetical protein  40.08 
 
 		 768 aa  519  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.471083  normal  0.43863 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.6 
 
 		 1094 aa  511  1e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1020  hypothetical protein  40.84 
 
 		 759 aa  498  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1878  Alpha-L-fucosidase  38.65 
 
 		 825 aa  489  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0772  hypothetical protein  37.42 
 
 		 802 aa  492  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5006  Alpha-L-fucosidase  37.23 
 
 		 864 aa  488  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.9086 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5543  Alpha-L-fucosidase  38.45 
 
 		 841 aa  482  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0324078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4083  hypothetical protein  37.32 
 
 		 816 aa  481  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1752  hypothetical protein  38.9 
 
 		 833 aa  476  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2698  Alpha-L-fucosidase  37.53 
 
 		 868 aa  478  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.447699  normal  0.17136 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5679  Alpha-L-fucosidase  40.52 
 
 		 747 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.357027 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1484  Alpha-L-fucosidase  37.3 
 
 		 842 aa  475  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3112  hypothetical protein  37.83 
 
 		 822 aa  475  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.31763  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7192  Alpha-L-fucosidase  37.58 
 
 		 811 aa  469  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000769318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5141  hypothetical protein  39.35 
 
 		 741 aa  468  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2700  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.94 
 
 		 784 aa  467  9.999999999999999e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0813  Alpha-L-fucosidase  36.01 
 
 		 786 aa  461  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6800  Alpha-L-fucosidase  37.6 
 
 		 778 aa  456  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000092205  unclonable  0.0000000000000164312 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1856  glycoside hydrolase family protein  36.45 
 
 		 781 aa  449  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2817  Alpha-L-fucosidase  38.96 
 
 		 940 aa  446  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1120  hypothetical protein  36.81 
 
 		 796 aa  439  1e-121  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  35.92 
 
 		 1164 aa  434  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1354  hypothetical protein  37.78 
 
 		 1139 aa  432  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1395  hypothetical protein  35.96 
 
 		 758 aa  413  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00458705  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0071  glycoside hydrolase family protein  35.4 
 
 		 835 aa  404  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10376  conserved hypothetical protein  36.79 
 
 		 757 aa  403  1e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28510  hypothetical protein  37.78 
 
 		 773 aa  379  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0874  hypothetical protein  33.64 
 
 		 760 aa  375  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.272656  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3002  Alpha-L-fucosidase  35.97 
 
 		 809 aa  376  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06673  alpha-fucosidase (Eurofung)  34.65 
 
 		 831 aa  367  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00444703 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08149  Alpha-fucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU81]  33.91 
 
 		 809 aa  358  2.9999999999999997e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.954517 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2411  twin-arginine translocation pathway signal  36.57 
 
 		 824 aa  351  3e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05400  hypothetical protein  34.3 
 
 		 856 aa  320  6e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  31.68 
 
 		 943 aa  313  6.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2174  hypothetical protein  42.11 
 
 		 646 aa  304  3.0000000000000004e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.007459  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0429  twin-arginine translocation pathway signal  34.44 
 
 		 781 aa  296  6e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.767202 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2555  hypothetical protein  30.22 
 
 		 804 aa  294  4e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29100  hypothetical protein  34.13 
 
 		 762 aa  281  3e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.142141  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1192  hypothetical protein  40.26 
 
 		 837 aa  281  3e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0186  glycoside hydrolase family 95  29.31 
 
 		 788 aa  262  2e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.771982 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4191  twin-arginine translocation pathway signal  36.85 
 
 		 808 aa  225  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.411949  normal  0.364475 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0084  hypothetical protein  29.63 
 
 		 809 aa  183  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1765  hypothetical protein  31.07 
 
 		 819 aa  182  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00969873  normal  0.0262945 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1563  hypothetical protein  29.03 
 
 		 770 aa  169  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156768  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1614  hypothetical protein  28.29 
 
 		 753 aa  146  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126205  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5561  Alpha-L-fucosidase  28.48 
 
 		 757 aa  110  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00114  expressed protein  38.55 
 
 		 262 aa  98.2  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00113  hypothetical protein  43.24 
 
 		 116 aa  95.9  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.688258  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1707  hypothetical protein  23.72 
 
 		 750 aa  78.2  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.358373  normal  0.023809 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3110  hypothetical protein  24.2 
 
 		 928 aa  77.8  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0237915 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2707  Trehalose and maltose hydrolase (possible phosphorylase)  22.15 
 
 		 765 aa  53.9  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0712554  normal  0.489106 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0097  ATP-dependent protease La  25.41 
 
 		 793 aa  44.3  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.411209  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2146  hypothetical protein  33.33 
 
 		 784 aa  44.3  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.292237  normal  0.414458 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>