58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5006 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4083  hypothetical protein  41.14 
 
 		 816 aa  652    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5543  Alpha-L-fucosidase  41.91 
 
 		 841 aa  640    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0324078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1878  Alpha-L-fucosidase  41.53 
 
 		 825 aa  665    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5006  Alpha-L-fucosidase  100 
 
 		 864 aa  1810    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.9086 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1484  Alpha-L-fucosidase  41.28 
 
 		 842 aa  647    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3112  hypothetical protein  41.85 
 
 		 822 aa  640    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.31763  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1752  hypothetical protein  43.47 
 
 		 833 aa  645    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2698  Alpha-L-fucosidase  40.87 
 
 		 868 aa  659    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.447699  normal  0.17136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2699  Alpha-L-fucosidase  42.59 
 
 		 825 aa  679    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000179914  normal  0.370363 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0772  hypothetical protein  39.83 
 
 		 802 aa  610  1e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7192  Alpha-L-fucosidase  41.11 
 
 		 811 aa  610  1e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000769318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.48 
 
 		 1094 aa  600  1e-170  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2700  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.2 
 
 		 784 aa  586  1e-166  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1256  hypothetical protein  40.32 
 
 		 768 aa  585  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.471083  normal  0.43863 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0813  Alpha-L-fucosidase  39.07 
 
 		 786 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5141  hypothetical protein  40.08 
 
 		 741 aa  563  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1020  hypothetical protein  37.73 
 
 		 759 aa  539  9.999999999999999e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2817  Alpha-L-fucosidase  40.03 
 
 		 940 aa  531  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5679  Alpha-L-fucosidase  38.63 
 
 		 747 aa  525  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.357027 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1435  hypothetical protein  37.18 
 
 		 790 aa  522  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.931563  normal  0.0505935 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1856  glycoside hydrolase family protein  36.13 
 
 		 781 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  37.23 
 
 		 1164 aa  510  1e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6800  Alpha-L-fucosidase  36.24 
 
 		 778 aa  509  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000092205  unclonable  0.0000000000000164312 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8217  Alpha-L-fucosidase  37.69 
 
 		 991 aa  500  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  36.5 
 
 		 1479 aa  501  1e-140  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1354  hypothetical protein  34.31 
 
 		 1139 aa  493  9.999999999999999e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  35.16 
 
 		 1193 aa  492  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5237  alpha-L-fucosidase, putative, afc95A  37.23 
 
 		 742 aa  486  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2503  hypothetical protein  36.96 
 
 		 803 aa  486  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20212  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10376  conserved hypothetical protein  35.78 
 
 		 757 aa  483  1e-135  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1395  hypothetical protein  34.52 
 
 		 758 aa  479  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00458705  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0071  glycoside hydrolase family protein  36.59 
 
 		 835 aa  479  1e-134  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2411  twin-arginine translocation pathway signal  35.99 
 
 		 824 aa  439  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05400  hypothetical protein  34.69 
 
 		 856 aa  433  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0874  hypothetical protein  33.33 
 
 		 760 aa  432  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.272656  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06673  alpha-fucosidase (Eurofung)  34.18 
 
 		 831 aa  416  9.999999999999999e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00444703 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0429  twin-arginine translocation pathway signal  34.26 
 
 		 781 aa  390  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.767202 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1120  hypothetical protein  30.91 
 
 		 796 aa  387  1e-106  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1192  hypothetical protein  40.77 
 
 		 837 aa  381  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3002  Alpha-L-fucosidase  41.28 
 
 		 809 aa  360  9e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29100  hypothetical protein  32.5 
 
 		 762 aa  353  5.9999999999999994e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.142141  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2174  hypothetical protein  42.49 
 
 		 646 aa  352  1e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.007459  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28510  hypothetical protein  30.02 
 
 		 773 aa  313  7.999999999999999e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0186  glycoside hydrolase family 95  28.15 
 
 		 788 aa  293  1e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.771982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2555  hypothetical protein  28.33 
 
 		 804 aa  285  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  28.02 
 
 		 943 aa  281  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4191  twin-arginine translocation pathway signal  35.23 
 
 		 808 aa  277  5e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.411949  normal  0.364475 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08149  Alpha-fucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU81]  27.33 
 
 		 809 aa  241  4e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.954517 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1765  hypothetical protein  31.41 
 
 		 819 aa  239  1e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00969873  normal  0.0262945 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0084  hypothetical protein  26.52 
 
 		 809 aa  211  3e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1563  hypothetical protein  26.72 
 
 		 770 aa  176  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156768  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1614  hypothetical protein  28.11 
 
 		 753 aa  134  6e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126205  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00114  expressed protein  39.47 
 
 		 262 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5561  Alpha-L-fucosidase  26.88 
 
 		 757 aa  121  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1707  hypothetical protein  23.17 
 
 		 750 aa  104  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.358373  normal  0.023809 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00113  hypothetical protein  48.21 
 
 		 116 aa  104  8e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.688258  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3110  hypothetical protein  22.21 
 
 		 928 aa  91.7  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0237915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2737  Ricin B lectin  22.1 
 
 		 1148 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285354  normal  0.294912 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>